34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0814 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0814  hypothetical protein  100 
 
 
420 aa  796    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0429314  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0373  hypothetical protein  30.91 
 
 
454 aa  152  8.999999999999999e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.417823  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0478  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.26 
 
 
471 aa  147  4.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.298298  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4331  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36 
 
 
440 aa  88.6  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3473  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.71 
 
 
580 aa  79  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1588  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.31 
 
 
359 aa  70.5  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0248929  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8552  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.71 
 
 
587 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8187  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.77 
 
 
593 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4328  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.11 
 
 
568 aa  60.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238879  normal  0.546066 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3175  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.96 
 
 
363 aa  59.7  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27870  hypothetical protein  32.97 
 
 
515 aa  59.7  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2962  hypothetical protein  41.3 
 
 
547 aa  57.8  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.41173  hitchhiker  0.00173595 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0027  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  44 
 
 
367 aa  56.6  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2495  hypothetical protein  39.13 
 
 
543 aa  51.6  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09470  putative peptidoglycan binding protein  31.62 
 
 
335 aa  49.3  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.265495  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3627  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.11 
 
 
309 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000535955  normal  0.374081 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3158  hypothetical protein  39.33 
 
 
542 aa  48.9  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3528  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.73 
 
 
389 aa  46.6  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  48.94 
 
 
229 aa  45.8  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0082  hypothetical protein  36.28 
 
 
391 aa  46.2  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.619134 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5152  peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.93 
 
 
358 aa  45.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4180  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.7 
 
 
414 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1188  peptidoglycan binding domain-containing protein  50 
 
 
321 aa  44.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4311  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.14 
 
 
305 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4786  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.13 
 
 
376 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0569189  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2795  hypothetical protein  23.49 
 
 
551 aa  44.3  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0306  hypothetical protein  34.78 
 
 
401 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2140  lytic murein transglycosylase  51.16 
 
 
415 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.074873  hitchhiker  0.00848991 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4124  lytic murein transglycosylase  51.16 
 
 
414 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215257  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  48.89 
 
 
671 aa  43.9  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6247  putative transglycosylase  46.51 
 
 
393 aa  43.5  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1246  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.49 
 
 
508 aa  43.1  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2479  lytic murein transglycosylase  51.16 
 
 
419 aa  43.1  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0304253  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  44.68 
 
 
239 aa  43.1  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>