29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0373 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0373  hypothetical protein  100 
 
 
454 aa  897    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.417823  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0478  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.95 
 
 
471 aa  177  4e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.298298  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0814  hypothetical protein  30.84 
 
 
420 aa  147  5e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0429314  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0027  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  52.63 
 
 
367 aa  85.1  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4331  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.33 
 
 
440 aa  79.7  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3473  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.02 
 
 
580 aa  69.7  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27870  hypothetical protein  35 
 
 
515 aa  68.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8187  peptidoglycan binding domain-containing protein  30 
 
 
593 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09470  putative peptidoglycan binding protein  36.05 
 
 
335 aa  53.9  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.265495  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2962  hypothetical protein  35.45 
 
 
547 aa  53.5  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.41173  hitchhiker  0.00173595 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0225  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.59 
 
 
605 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3175  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.5 
 
 
363 aa  50.4  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8552  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.08 
 
 
587 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0102  hypothetical protein  45 
 
 
349 aa  47.8  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1588  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.68 
 
 
359 aa  47.4  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0248929  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4328  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.95 
 
 
568 aa  46.6  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238879  normal  0.546066 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0039  spore cortex-lytic enzyme  41.67 
 
 
242 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0035  spore cortex-lytic enzyme  35.71 
 
 
231 aa  45.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4311  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.41 
 
 
305 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1959  peptidoglycan binding domain-containing protein  50 
 
 
487 aa  44.3  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315261  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  42.86 
 
 
228 aa  44.3  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0084  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.62 
 
 
408 aa  44.3  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5941  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.91 
 
 
381 aa  44.3  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0449  spore cortex-lytic enzyme  44.68 
 
 
267 aa  43.9  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1510  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.11 
 
 
307 aa  43.9  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.360333  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25300  membrane-fusion protein  35.06 
 
 
379 aa  43.1  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344012  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1978  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.51 
 
 
223 aa  43.5  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1030  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.55 
 
 
410 aa  43.1  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.13226 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1518  hypothetical protein  42.22 
 
 
241 aa  43.1  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>