32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5941 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5941  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 
381 aa  740    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0306  hypothetical protein  53.75 
 
 
401 aa  310  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1030  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.75 
 
 
410 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.13226 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0084  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.36 
 
 
408 aa  225  8e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4786  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.59 
 
 
376 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0569189  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25300  membrane-fusion protein  38.79 
 
 
379 aa  192  6e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344012  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0582  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.99 
 
 
405 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246879  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4070  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.31 
 
 
358 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00672322  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0225  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  53.79 
 
 
605 aa  141  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0082  hypothetical protein  31.07 
 
 
391 aa  92.8  9e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.619134 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09470  putative peptidoglycan binding protein  30.34 
 
 
335 aa  82.8  0.000000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.265495  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3175  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.08 
 
 
363 aa  72.8  0.000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13610  hypothetical protein  35.25 
 
 
431 aa  71.2  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.470397 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1588  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.13 
 
 
359 aa  70.5  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0248929  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3473  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.52 
 
 
580 aa  63.9  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4331  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.05 
 
 
440 aa  60.5  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0853  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.21 
 
 
360 aa  57.8  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21610  hypothetical protein  31.52 
 
 
351 aa  55.8  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0478  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.5 
 
 
471 aa  55.1  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.298298  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8552  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.6 
 
 
587 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1583  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.92 
 
 
360 aa  53.9  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.474827  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0027  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36 
 
 
367 aa  48.9  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27870  hypothetical protein  30.31 
 
 
515 aa  47.4  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2962  hypothetical protein  38.27 
 
 
547 aa  47  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.41173  hitchhiker  0.00173595 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1949  cell wall hydrolase, SleB  41.18 
 
 
224 aa  46.6  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201814  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8187  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.96 
 
 
593 aa  46.6  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3158  hypothetical protein  37.5 
 
 
542 aa  46.2  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1959  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.64 
 
 
487 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315261  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1197  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.83 
 
 
667 aa  45.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0373  hypothetical protein  32.91 
 
 
454 aa  43.9  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.417823  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  36.36 
 
 
2277 aa  44.3  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0740  hypothetical protein  32.21 
 
 
309 aa  43.9  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000338455  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>