28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2962 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2962  hypothetical protein  100 
 
 
547 aa  1023    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.41173  hitchhiker  0.00173595 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27870  hypothetical protein  48.45 
 
 
515 aa  396  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3158  hypothetical protein  51.6 
 
 
542 aa  347  3e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2495  hypothetical protein  48.08 
 
 
543 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4331  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.97 
 
 
440 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8552  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.81 
 
 
587 aa  111  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8187  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.14 
 
 
593 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3473  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.75 
 
 
580 aa  104  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4328  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.68 
 
 
568 aa  91.3  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238879  normal  0.546066 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0027  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.61 
 
 
367 aa  76.3  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0225  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.5 
 
 
605 aa  64.3  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0373  hypothetical protein  30.31 
 
 
454 aa  62.8  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.417823  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25300  membrane-fusion protein  33.71 
 
 
379 aa  59.7  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344012  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0084  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.68 
 
 
408 aa  60.1  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0814  hypothetical protein  41.3 
 
 
420 aa  58.5  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0429314  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0478  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.77 
 
 
471 aa  58.2  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.298298  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09470  putative peptidoglycan binding protein  36.19 
 
 
335 aa  56.6  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.265495  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0582  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.65 
 
 
405 aa  55.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246879  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4786  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.31 
 
 
376 aa  55.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0569189  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0306  hypothetical protein  40.2 
 
 
401 aa  55.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0082  hypothetical protein  36.47 
 
 
391 aa  50.4  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.619134 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1625  hypothetical protein  34.23 
 
 
179 aa  50.4  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1588  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.31 
 
 
359 aa  49.3  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0248929  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5941  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.27 
 
 
381 aa  47.4  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1030  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.03 
 
 
410 aa  47  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.13226 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21610  hypothetical protein  30.87 
 
 
351 aa  47  0.0009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3175  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.84 
 
 
363 aa  45.1  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4577  secretion protein HlyD  30.43 
 
 
354 aa  43.5  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.231546  normal  0.47776 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>