26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8187 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8552  peptidoglycan binding domain-containing protein  61.87 
 
 		 587 aa  635    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8187  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 593 aa  1155    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4328  peptidoglycan binding domain-containing protein  52.97 
 
 		 568 aa  456  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238879  normal  0.546066 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4331  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.88 
 
 		 440 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3473  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.03 
 
 		 580 aa  105  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2495  hypothetical protein  37.72 
 
 		 543 aa  98.2  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27870  hypothetical protein  27.97 
 
 		 515 aa  96.3  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2962  hypothetical protein  36.51 
 
 		 547 aa  88.2  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.41173  hitchhiker  0.00173595 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0814  hypothetical protein  31.52 
 
 		 420 aa  64.3  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0429314  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0027  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.57 
 
 		 367 aa  63.5  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21610  hypothetical protein  34.46 
 
 		 351 aa  63.5  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1030  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.44 
 
 		 410 aa  62  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.13226 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0084  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.81 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0373  hypothetical protein  30 
 
 		 454 aa  60.8  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.417823  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4786  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.89 
 
 		 376 aa  58.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0569189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0082  hypothetical protein  29.57 
 
 		 391 aa  54.7  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.619134 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0306  hypothetical protein  33.11 
 
 		 401 aa  53.9  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0225  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.83 
 
 		 605 aa  52.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09470  putative peptidoglycan binding protein  40.26 
 
 		 335 aa  51.6  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.265495  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4070  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.19 
 
 		 358 aa  51.2  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00672322  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5941  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.96 
 
 		 381 aa  47.8  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1588  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.5 
 
 		 359 aa  46.6  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0248929  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3158  hypothetical protein  34.78 
 
 		 542 aa  47  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3175  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.4 
 
 		 363 aa  46.2  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0478  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.78 
 
 		 471 aa  45.4  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.298298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1625  hypothetical protein  31.54 
 
 		 179 aa  45.1  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>