20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4070 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4070  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 		 358 aa  687    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00672322  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1030  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.44 
 
 		 410 aa  177  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.13226 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25300  membrane-fusion protein  39.46 
 
 		 379 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0306  hypothetical protein  38.1 
 
 		 401 aa  156  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5941  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.58 
 
 		 381 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4786  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.62 
 
 		 376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0569189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0084  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.54 
 
 		 408 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13610  hypothetical protein  45.25 
 
 		 431 aa  110  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.470397 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0225  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.54 
 
 		 605 aa  97.4  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0582  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.41 
 
 		 405 aa  93.6  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0082  hypothetical protein  26.44 
 
 		 391 aa  59.3  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.619134 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09470  putative peptidoglycan binding protein  30.3 
 
 		 335 aa  58.2  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.265495  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1588  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.16 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0248929  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4328  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.62 
 
 		 568 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238879  normal  0.546066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8552  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.29 
 
 		 587 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8187  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.69 
 
 		 593 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3175  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.71 
 
 		 363 aa  49.7  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3473  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.71 
 
 		 580 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4331  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.77 
 
 		 440 aa  44.3  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0814  hypothetical protein  33.08 
 
 		 420 aa  42.7  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0429314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>