28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8552 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8552  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 587 aa  1135    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8187  peptidoglycan binding domain-containing protein  61.5 
 
 		 593 aa  598  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4328  peptidoglycan binding domain-containing protein  55.85 
 
 		 568 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238879  normal  0.546066 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3473  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.87 
 
 		 580 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4331  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.11 
 
 		 440 aa  110  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2962  hypothetical protein  40.98 
 
 		 547 aa  95.5  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.41173  hitchhiker  0.00173595 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27870  hypothetical protein  29.36 
 
 		 515 aa  86.3  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3158  hypothetical protein  34.31 
 
 		 542 aa  83.2  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0084  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.22 
 
 		 408 aa  77.8  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2495  hypothetical protein  33.19 
 
 		 543 aa  75.5  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1030  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.13226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0306  hypothetical protein  40 
 
 		 401 aa  73.6  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0814  hypothetical protein  31.71 
 
 		 420 aa  62.4  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0429314  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21610  hypothetical protein  33.93 
 
 		 351 aa  62  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25300  membrane-fusion protein  34.4 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0225  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.84 
 
 		 605 aa  58.9  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4786  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.11 
 
 		 376 aa  59.7  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0569189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0082  hypothetical protein  37.33 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.619134 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0027  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.93 
 
 		 367 aa  57  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0478  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  25.93 
 
 		 471 aa  55.8  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.298298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5941  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.6 
 
 		 381 aa  55.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0582  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.23 
 
 		 405 aa  54.7  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4070  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.82 
 
 		 358 aa  53.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00672322  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09470  putative peptidoglycan binding protein  43.24 
 
 		 335 aa  52.8  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.265495  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0373  hypothetical protein  29.08 
 
 		 454 aa  49.7  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.417823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3106  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.44 
 
 		 159 aa  48.5  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1588  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.79 
 
 		 359 aa  45.8  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0248929  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3362  RND family efflux transporter MFP subunit  36.17 
 
 		 358 aa  45.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>