25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1030 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1030  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 
410 aa  784    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.13226 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5941  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.62 
 
 
381 aa  255  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0306  hypothetical protein  42.94 
 
 
401 aa  236  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0084  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.6 
 
 
408 aa  200  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25300  membrane-fusion protein  40.3 
 
 
379 aa  193  4e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344012  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4786  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.35 
 
 
376 aa  181  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0569189  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4070  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.51 
 
 
358 aa  179  9e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00672322  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0582  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30 
 
 
405 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246879  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0225  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38 
 
 
605 aa  96.3  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13610  hypothetical protein  37.06 
 
 
431 aa  88.6  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.470397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8552  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.27 
 
 
587 aa  74.3  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09470  putative peptidoglycan binding protein  28.25 
 
 
335 aa  71.2  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.265495  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8187  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.57 
 
 
593 aa  64.3  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3473  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.31 
 
 
580 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4331  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.6 
 
 
440 aa  55.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0082  hypothetical protein  27.68 
 
 
391 aa  55.1  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.619134 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4328  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.25 
 
 
568 aa  53.5  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238879  normal  0.546066 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0027  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.63 
 
 
367 aa  51.6  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1588  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.16 
 
 
359 aa  49.7  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0248929  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3175  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.56 
 
 
363 aa  46.6  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0373  hypothetical protein  28.93 
 
 
454 aa  46.6  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.417823  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0478  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.27 
 
 
471 aa  46.2  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.298298  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27870  hypothetical protein  28.95 
 
 
515 aa  45.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  48.21 
 
 
454 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2962  hypothetical protein  31.25 
 
 
547 aa  43.5  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.41173  hitchhiker  0.00173595 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>