28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_27870 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_27870  hypothetical protein  100 
 
 		 515 aa  996    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2962  hypothetical protein  48.26 
 
 		 547 aa  366  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.41173  hitchhiker  0.00173595 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3158  hypothetical protein  48.47 
 
 		 542 aa  322  7e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2495  hypothetical protein  43.07 
 
 		 543 aa  268  1e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4331  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.8 
 
 		 440 aa  133  9e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8187  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.14 
 
 		 593 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3473  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.12 
 
 		 580 aa  97.8  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8552  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.15 
 
 		 587 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4328  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.77 
 
 		 568 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238879  normal  0.546066 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0373  hypothetical protein  34.98 
 
 		 454 aa  79  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.417823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0814  hypothetical protein  32.97 
 
 		 420 aa  70.1  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0429314  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0478  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.97 
 
 		 471 aa  68.6  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.298298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25300  membrane-fusion protein  46.43 
 
 		 379 aa  61.6  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0027  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35 
 
 		 367 aa  61.2  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0225  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.71 
 
 		 605 aa  60.1  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0306  hypothetical protein  35.11 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4786  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.03 
 
 		 376 aa  55.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0569189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0084  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.98 
 
 		 408 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5941  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.71 
 
 		 381 aa  51.2  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0082  hypothetical protein  38.75 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.619134 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1588  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.43 
 
 		 359 aa  47.8  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0248929  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21610  hypothetical protein  31.74 
 
 		 351 aa  46.2  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1030  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.2 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.13226 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2427  RND family efflux transporter MFP subunit  29.8 
 
 		 380 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.412114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09470  putative peptidoglycan binding protein  34.62 
 
 		 335 aa  45.1  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.265495  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1625  hypothetical protein  34.52 
 
 		 179 aa  44.7  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0582  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.98 
 
 		 405 aa  43.9  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13610  hypothetical protein  40.54 
 
 		 431 aa  43.5  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.470397 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>