30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4786 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4786  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 		 376 aa  714    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0569189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5941  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.28 
 
 		 381 aa  216  8e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0306  hypothetical protein  42.06 
 
 		 401 aa  192  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1030  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.35 
 
 		 410 aa  180  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.13226 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0084  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.3 
 
 		 408 aa  170  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25300  membrane-fusion protein  40.72 
 
 		 379 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4070  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.31 
 
 		 358 aa  136  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00672322  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0582  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.62 
 
 		 405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0225  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.14 
 
 		 605 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13610  hypothetical protein  40.38 
 
 		 431 aa  74.3  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.470397 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09470  putative peptidoglycan binding protein  28.03 
 
 		 335 aa  73.9  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.265495  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4331  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.15 
 
 		 440 aa  73.2  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3473  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.04 
 
 		 580 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0082  hypothetical protein  40.51 
 
 		 391 aa  65.9  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.619134 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8552  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.11 
 
 		 587 aa  59.7  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8187  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.13 
 
 		 593 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3158  hypothetical protein  45.71 
 
 		 542 aa  57  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1588  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.23 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0248929  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27870  hypothetical protein  41.03 
 
 		 515 aa  54.7  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3175  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.36 
 
 		 363 aa  55.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2962  hypothetical protein  42.31 
 
 		 547 aa  55.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.41173  hitchhiker  0.00173595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4328  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.51 
 
 		 568 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238879  normal  0.546066 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0027  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.51 
 
 		 367 aa  52  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0478  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.23 
 
 		 471 aa  49.7  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.298298  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2495  hypothetical protein  43.64 
 
 		 543 aa  47.8  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0373  hypothetical protein  31.1 
 
 		 454 aa  47  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.417823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21610  hypothetical protein  37.97 
 
 		 351 aa  46.2  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  50 
 
 		 450 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0814  hypothetical protein  39.13 
 
 		 420 aa  43.9  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0429314  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10570  hypothetical protein  28.95 
 
 		 305 aa  42.7  0.009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>