42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3175 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3175  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 
363 aa  691    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1588  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  79.83 
 
 
359 aa  517  1.0000000000000001e-145  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0248929  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0853  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  62.54 
 
 
360 aa  374  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1583  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  62.15 
 
 
360 aa  359  5e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.474827  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09470  putative peptidoglycan binding protein  36.19 
 
 
335 aa  166  5.9999999999999996e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.265495  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0082  hypothetical protein  30.11 
 
 
391 aa  126  7e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.619134 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21610  hypothetical protein  34.18 
 
 
351 aa  102  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0225  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  44.23 
 
 
605 aa  75.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0027  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.13 
 
 
367 aa  74.3  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5941  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.08 
 
 
381 aa  73.6  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0306  hypothetical protein  36.09 
 
 
401 aa  70.1  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0084  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.48 
 
 
408 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0582  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.65 
 
 
405 aa  59.3  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246879  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0814  hypothetical protein  40.96 
 
 
420 aa  58.9  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0429314  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25300  membrane-fusion protein  41.89 
 
 
379 aa  59.3  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344012  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3473  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.18 
 
 
580 aa  56.2  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4786  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.36 
 
 
376 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0569189  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0373  hypothetical protein  30.54 
 
 
454 aa  53.1  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.417823  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4331  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.66 
 
 
440 aa  52.8  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0604  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.04 
 
 
326 aa  50.1  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66709  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4070  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.71 
 
 
358 aa  50.1  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00672322  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4311  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.16 
 
 
305 aa  49.7  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  32.29 
 
 
228 aa  49.7  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4087  peptidoglycan-binding domain 1 protein  44.83 
 
 
249 aa  49.3  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0478  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  26.52 
 
 
471 aa  48.9  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.298298  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4421  glycoside hydrolase family protein  44.44 
 
 
243 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.36 
 
 
391 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1030  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.99 
 
 
410 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.13226 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.09 
 
 
283 aa  46.2  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3627  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.44 
 
 
309 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000535955  normal  0.374081 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33580  putative peptidoglycan binding protein  30.3 
 
 
384 aa  45.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10172  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2962  hypothetical protein  43.84 
 
 
547 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.41173  hitchhiker  0.00173595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8187  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.13 
 
 
593 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2150  cell wall hydrolase/autolysin  47.92 
 
 
378 aa  43.9  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0102  hypothetical protein  26.94 
 
 
349 aa  44.3  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7330  cell wall hydrolase/autolysin  50 
 
 
409 aa  43.5  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.680147  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1518  hypothetical protein  43.14 
 
 
241 aa  43.5  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4788  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.64 
 
 
163 aa  43.5  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.907058  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0756  hypothetical protein  33.33 
 
 
204 aa  43.1  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444213  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  34.67 
 
 
762 aa  43.1  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  38.71 
 
 
247 aa  42.7  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5403  cell wall hydrolase/autolysin  47.17 
 
 
383 aa  42.7  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>