160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_06460 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_06460  galactokinase  100 
 
 		 439 aa  898    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0819  Galactokinase  41.3 
 
 		 403 aa  296  6e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.847114  normal  0.0773074 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1201  Galactokinase  39.37 
 
 		 410 aa  246  6e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0388  Galactokinase  32.26 
 
 		 427 aa  229  9e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3653  galactokinase  34.45 
 
 		 434 aa  204  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2237  galactokinase  33.51 
 
 		 415 aa  199  7.999999999999999e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  36.4 
 
 		 389 aa  123  8e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  34.6 
 
 		 372 aa  114  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  28.48 
 
 		 350 aa  103  7e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1628  galactokinase  28.48 
 
 		 350 aa  103  7e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  28.04 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  27.78 
 
 		 392 aa  99.8  8e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4206  galactokinase  35.89 
 
 		 376 aa  98.6  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1191  galactokinase  30.2 
 
 		 373 aa  96.3  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  27.08 
 
 		 383 aa  95.5  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  27.49 
 
 		 387 aa  94.4  4e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_002950  PG1633  galactokinase  27.27 
 
 		 384 aa  94  5e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0415  galactokinase  27.66 
 
 		 355 aa  93.2  8e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  25.98 
 
 		 386 aa  92.4  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  27.16 
 
 		 349 aa  92.8  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  26.23 
 
 		 389 aa  91.3  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  24.88 
 
 		 386 aa  91.7  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0892  galactokinase  26.4 
 
 		 391 aa  90.5  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0830  galactokinase  25.84 
 
 		 386 aa  90.1  7e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0480015  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  27.63 
 
 		 394 aa  89.7  9e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  24.52 
 
 		 387 aa  89  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2607  galactokinase  28.37 
 
 		 399 aa  88.6  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00377614  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1777  galactokinase  25.45 
 
 		 392 aa  88.6  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  26.13 
 
 		 387 aa  88.6  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  30.23 
 
 		 398 aa  87.4  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  24.52 
 
 		 387 aa  87.8  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7279  galactokinase  29.39 
 
 		 418 aa  87.4  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  24.92 
 
 		 385 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  24.01 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  30.03 
 
 		 391 aa  84.3  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  25.06 
 
 		 388 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  25.86 
 
 		 384 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  28.53 
 
 		 388 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3662  galactokinase  28.43 
 
 		 412 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0296405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  25 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1073  galactokinase  25.98 
 
 		 385 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.848986  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3336  galactokinase  25.98 
 
 		 409 aa  83.2  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.325513  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  24.38 
 
 		 379 aa  83.2  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  24.22 
 
 		 389 aa  82.8  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  28.66 
 
 		 396 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  25.25 
 
 		 382 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1677  galactokinase  27.34 
 
 		 400 aa  82.4  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114591 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  26.65 
 
 		 349 aa  82  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  25.63 
 
 		 382 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0502  galactokinase  30.91 
 
 		 384 aa  82  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.592539  normal  0.852074 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1233  galactokinase  27.86 
 
 		 395 aa  81.3  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000254056 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  25.73 
 
 		 388 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3018  galactokinase  32.94 
 
 		 361 aa  81.6  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  27.96 
 
 		 403 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  24.82 
 
 		 382 aa  80.9  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  25.38 
 
 		 382 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2490  galactokinase  30.59 
 
 		 409 aa  80.9  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  25 
 
 		 382 aa  80.5  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  25 
 
 		 382 aa  80.5  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  24.69 
 
 		 393 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  25.56 
 
 		 385 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0544  galactokinase  29.11 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0657  galactokinase  25.24 
 
 		 387 aa  80.1  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  25 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  25.38 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  25.38 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  25.38 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  25.38 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  25.17 
 
 		 404 aa  79.7  0.00000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0414  galactokinase  25.25 
 
 		 381 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  25.13 
 
 		 382 aa  79.7  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  24.75 
 
 		 382 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1464  galactokinase  25.84 
 
 		 394 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1161  galactokinase  27.44 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.415843  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0536  galactokinase  27.91 
 
 		 382 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0132306 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0304  galactokinase  25.42 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  34.88 
 
 		 405 aa  77  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3973  galactokinase  32.65 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103412  normal  0.340727 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  32.18 
 
 		 385 aa  76.3  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0997  galactokinase  28.43 
 
 		 362 aa  75.1  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00864415  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  29.24 
 
 		 380 aa  75.1  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  26.63 
 
 		 387 aa  75.5  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  25.33 
 
 		 399 aa  74.3  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2244  galactokinase  26.25 
 
 		 399 aa  74.3  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  28.21 
 
 		 369 aa  73.9  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24040  galactokinase  27.62 
 
 		 420 aa  73.9  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  25.18 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1313  galactokinase  26.84 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20548  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1114  galactokinase  25.53 
 
 		 386 aa  73.6  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  30.03 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  25.15 
 
 		 389 aa  73.2  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1466  galactokinase  26.75 
 
 		 388 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  27.53 
 
 		 386 aa  73.2  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  25.26 
 
 		 351 aa  72.8  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  23.91 
 
 		 383 aa  72  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0355  galactokinase  26.27 
 
 		 389 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3238  galactokinase  31.64 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.217049  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3668  galactokinase  25.42 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0634  galactokinase  27.18 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0657  galactokinase  27.18 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>