More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2215 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2215  ABC transporter related  100 
 
 		 279 aa  573  1.0000000000000001e-162  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.490785 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0927  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component-like protein  45.96 
 
 		 296 aa  262  4e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2217  ABC transporter related  46.03 
 
 		 277 aa  256  3e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.294499 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  41.04 
 
 		 283 aa  222  4e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  45.68 
 
 		 251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.67 
 
 		 283 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0925  ABC transporter ATP-binding protein  40.78 
 
 		 288 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.85132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  40.91 
 
 		 286 aa  210  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5603  ABC transporter related protein  40.39 
 
 		 263 aa  208  7e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  40.48 
 
 		 286 aa  208  9e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  41.74 
 
 		 261 aa  208  9e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  37.89 
 
 		 282 aa  207  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  41.18 
 
 		 267 aa  207  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  42.56 
 
 		 259 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  43.29 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  44.5 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  43.29 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  40.16 
 
 		 285 aa  205  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  44.04 
 
 		 304 aa  206  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  44.5 
 
 		 304 aa  205  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  38.37 
 
 		 279 aa  204  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  43.83 
 
 		 281 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  41.6 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  39.1 
 
 		 272 aa  204  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  40 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0155  ABC transporter related protein  42.26 
 
 		 252 aa  204  2e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  39.1 
 
 		 272 aa  204  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  41.42 
 
 		 259 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  40.76 
 
 		 267 aa  203  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  42.92 
 
 		 284 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  38.89 
 
 		 259 aa  203  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3513  ABC transporter related  42.74 
 
 		 279 aa  203  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  39.76 
 
 		 254 aa  202  4e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  42.44 
 
 		 261 aa  202  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  40.94 
 
 		 252 aa  202  5e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  38.72 
 
 		 272 aa  202  6e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  38.43 
 
 		 260 aa  202  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  43.27 
 
 		 307 aa  201  8e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  45.24 
 
 		 254 aa  201  8e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  39.34 
 
 		 308 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3997  ABC transporter, ATPase subunit  40.73 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  41.53 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  40.42 
 
 		 259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  40.83 
 
 		 260 aa  199  6e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  41.77 
 
 		 291 aa  198  6e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  38.98 
 
 		 254 aa  198  7e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  41.48 
 
 		 273 aa  198  9e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  38.93 
 
 		 263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  38.17 
 
 		 278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  38.98 
 
 		 259 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4112  ABC transporter-related protein  40.32 
 
 		 311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4878  putative ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 265 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5505  normal  0.0921087 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  39.5 
 
 		 290 aa  196  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  38.96 
 
 		 306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  39.76 
 
 		 257 aa  195  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  38.19 
 
 		 254 aa  195  6e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  41.08 
 
 		 303 aa  195  7e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  44.25 
 
 		 264 aa  195  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1530  ABC transporter related  43.33 
 
 		 285 aa  194  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  40.26 
 
 		 297 aa  193  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  40.17 
 
 		 259 aa  192  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2221  ABC transporter-related protein  37.3 
 
 		 262 aa  192  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000225021  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  38.91 
 
 		 293 aa  192  6e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  38.91 
 
 		 293 aa  192  6e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  38.19 
 
 		 254 aa  192  7e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1472  ABC transporter related  41.63 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211771  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6101  ABC transporter related  40.32 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1976  ABC transporter related  40.32 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.227551  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  37.6 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2000  ABC transporter related  40.32 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  37.96 
 
 		 271 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3115  ABC transporter related  38.75 
 
 		 272 aa  190  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200151  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  43.38 
 
 		 264 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  42.13 
 
 		 271 aa  190  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  39.84 
 
 		 272 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0052  ABC transporter related  40.55 
 
 		 265 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  39.06 
 
 		 289 aa  190  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  43.9 
 
 		 280 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0429  ABC transporter related  43.36 
 
 		 313 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0115377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  39.92 
 
 		 264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0036  ABC transporter, ATP-binding protein  39.69 
 
 		 265 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2560  ABC transporter related  35.43 
 
 		 271 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6201  ABC transporter related  41.28 
 
 		 245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.102037 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7933  ABC transporter related  38.61 
 
 		 258 aa  189  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  38.96 
 
 		 259 aa  189  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0037  ABC transporter related  40.16 
 
 		 265 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  38.98 
 
 		 263 aa  189  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0033  ABC transporter related  40.16 
 
 		 265 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  41.41 
 
 		 263 aa  189  5e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  38.3 
 
 		 287 aa  189  5e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  37.55 
 
 		 271 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  37.7 
 
 		 271 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  43.17 
 
 		 254 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0252  ABC transporter, ATP-binding protein  38.95 
 
 		 288 aa  188  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.616609  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4138  ABC transporter related  39.11 
 
 		 311 aa  188  7e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  38.95 
 
 		 288 aa  188  7e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2698  ABC transporter, ATP-binding protein  38.95 
 
 		 288 aa  188  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1294  ABC transporter related  40.65 
 
 		 262 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.195948  normal  0.376789 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0035  ABC transporter related  38.49 
 
 		 265 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  36.82 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>