More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1395 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
261 aa  529  1e-149  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1845  enoyl-CoA hydratase  41.94 
 
 
259 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.068213  decreased coverage  0.00498054 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  37.6 
 
 
261 aa  188  9e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  40.64 
 
 
263 aa  187  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.8 
 
 
264 aa  186  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3600  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.75 
 
 
263 aa  185  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.465464 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2169  enoyl-CoA hydratase  40.73 
 
 
259 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.086116  normal  0.0350969 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0973  enoyl-CoA hydratase  40.57 
 
 
259 aa  178  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0850913 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.8 
 
 
266 aa  177  1e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3603  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.54 
 
 
264 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.158658 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  39.15 
 
 
263 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  38.46 
 
 
262 aa  176  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.61 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678896  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  39.77 
 
 
262 aa  172  5e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.98 
 
 
257 aa  172  5.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  37.98 
 
 
263 aa  169  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  38.04 
 
 
263 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  38.04 
 
 
263 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  38.87 
 
 
263 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  38.76 
 
 
263 aa  167  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  40.08 
 
 
263 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1009  enoyl-CoA hydratase  41.39 
 
 
259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2014  enoyl-CoA hydratase  41.13 
 
 
259 aa  166  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.49745  normal  0.0415975 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
259 aa  166  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  40.24 
 
 
251 aa  164  9e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  40.16 
 
 
276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.06 
 
 
260 aa  163  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  35.5 
 
 
263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.79 
 
 
271 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  35.88 
 
 
263 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  35.88 
 
 
263 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  35.88 
 
 
263 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  35.88 
 
 
263 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  35.88 
 
 
263 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  35.88 
 
 
263 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  35.88 
 
 
263 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  38.4 
 
 
261 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.4 
 
 
271 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2958  enoyl-CoA hydratase  39.53 
 
 
259 aa  161  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.02 
 
 
271 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  39.18 
 
 
263 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  38.58 
 
 
261 aa  159  6e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.38 
 
 
274 aa  157  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  36.95 
 
 
280 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  39 
 
 
262 aa  157  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3395  enoyl-CoA hydratase  38.67 
 
 
259 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.428446 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  40.93 
 
 
261 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 
260 aa  157  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3344  enoyl-CoA hydratase  38.67 
 
 
259 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.875578  normal  0.316715 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5713  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.25 
 
 
263 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3333  enoyl-CoA hydratase  38.67 
 
 
259 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0320985  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  35.69 
 
 
259 aa  155  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.46 
 
 
264 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.65 
 
 
264 aa  155  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.5 
 
 
267 aa  155  8e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.55 
 
 
268 aa  154  9e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65840  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.86 
 
 
263 aa  155  9e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.46 
 
 
264 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  35.94 
 
 
257 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0814  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.11 
 
 
262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.134124  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2835  putative enoyl-CoA hydratase  34.24 
 
 
261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.58 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  37.65 
 
 
267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2354  enoyl-CoA hydratase  37.21 
 
 
266 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239934  normal  0.727951 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  34.38 
 
 
259 aa  152  7e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  36.47 
 
 
284 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  38.85 
 
 
262 aa  151  8e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.68 
 
 
260 aa  151  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2240  enoyl-CoA hydratase  39.6 
 
 
272 aa  151  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.96 
 
 
258 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  39 
 
 
262 aa  150  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  36.02 
 
 
266 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.26 
 
 
258 aa  150  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.415627  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.47 
 
 
260 aa  149  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
264 aa  149  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.65 
 
 
270 aa  150  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.8 
 
 
259 aa  149  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1086  enoyl-CoA hydratase  40.33 
 
 
355 aa  149  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.695016  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1007  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.98 
 
 
276 aa  149  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57099  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  37.5 
 
 
260 aa  149  5e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2251  enoyl-CoA hydratase  42.62 
 
 
263 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.5 
 
 
273 aa  148  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.08 
 
 
258 aa  148  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3834  enoyl-CoA hydratase  35.02 
 
 
262 aa  148  7e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2227  enoyl-CoA hydratase  42.62 
 
 
263 aa  148  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1615  enoyl-CoA hydratase  42.62 
 
 
263 aa  148  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2213  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.6 
 
 
257 aa  148  9e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0591948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  36.44 
 
 
262 aa  148  9e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2180  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.8 
 
 
264 aa  148  9e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470778  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.18 
 
 
258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3322  enoyl-CoA hydratase  35.14 
 
 
263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3285  enoyl-CoA hydratase  35.14 
 
 
263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000573094  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3537  enoyl-CoA hydratase  35.14 
 
 
263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50917e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3583  enoyl-CoA hydratase  35.14 
 
 
263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  38.46 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.21 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  35.02 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3237  enoyl-CoA hydratase  35.14 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  36.92 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>