More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1017 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1017  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
126 aa  254  3e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301084  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0836  nitrogen regulatory protein P-II  58.87 
 
 
124 aa  147  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1156  nitrogen regulatory protein P-II  58.73 
 
 
130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1246  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  57.6 
 
 
125 aa  140  5e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000500613  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1629  nitrogen regulatory protein P-II  56.45 
 
 
125 aa  139  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000227966  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0742  nitrogen regulatory protein P-II  55.2 
 
 
125 aa  136  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2615  nitrogen regulatory protein P-II  55.28 
 
 
124 aa  135  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1530  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  56 
 
 
125 aa  134  3.0000000000000003e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.858615  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0683  nitrogen regulatory protein P-II  53.6 
 
 
125 aa  130  3.9999999999999996e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1951  nitrogen regulatory protein P-II  53.6 
 
 
125 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0122455  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1753  nitrogen regulatory protein P-II  53.23 
 
 
125 aa  128  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.424498  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3092  nitrogen regulatory protein P-II  44.96 
 
 
131 aa  107  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2819  nitrogen regulatory protein P-II  46.09 
 
 
126 aa  99  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.587201  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1025  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 
126 aa  98.6  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0169  nitrogen regulatory protein P-II  42.64 
 
 
125 aa  90.9  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00936567  normal  0.629139 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1432  nitrogen regulatory protein P-II  43.31 
 
 
128 aa  88.6  3e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0660  nitrogen regulatory protein P-II  41.46 
 
 
121 aa  85.5  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.187673  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0145  nitrogen regulatory protein P-II  44.53 
 
 
120 aa  85.9  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.550451  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0100  nitrogen regulatory protein P-II  42.28 
 
 
121 aa  85.9  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.250689  normal  0.0316533 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1048  nitrogen regulatory protein P-II  37.69 
 
 
127 aa  84  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1801  nitrogen regulatory protein P-II  41.46 
 
 
121 aa  83.2  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1554  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 
125 aa  81.3  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0559  nitrogen regulatory protein P-II  38.41 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000146576  normal  0.195853 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2279  P-II family nitrogen regulatory protein  39.68 
 
 
123 aa  80.1  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000418064  normal  0.159182 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  37.4 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0063  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 
121 aa  77.8  0.00000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  39.02 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  38.21 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  37.4 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  37.4 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  37.4 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2852  nitrogen regulatory protein P-II  37.4 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287324  normal  0.0455746 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1657  nitrogen regulatory protein P-II  39.02 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  36.59 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1730  nitrogen regulatory protein P-II  39.02 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.434906  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02445  regulatory protein P-II for glutamine synthetase  38.21 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1115  nitrogen regulatory protein P-II  38.21 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2762  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.21 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  39.02 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  37.4 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.21 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2918  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.21 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.94675  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1124  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.21 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02409  hypothetical protein  38.21 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2824  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.21 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2937  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.21 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2720  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.21 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0014  nitrogen regulatory protein P-II  39.02 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0394648 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.21 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2803  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.21 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2838  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.21 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3787  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.21 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2310  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  34.96 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0255165  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2217  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  37.4 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  37.4 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  37.4 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12933  nitrogen regulatory protein P-II glnB  39.02 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.30403e-36  normal  0.258229 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  35.77 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  37.4 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1888  nitrogen regulatory protein P-II  37.4 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3162  nitrogen regulatory protein P-II  36.59 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000317831  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  34.15 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3635  nitrogen regulatory protein P-II  37.4 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.284455 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  37.4 
 
 
112 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000368327 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0141  nitrogen regulatory protein P-II  38.21 
 
 
111 aa  73.6  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457658  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  37.4 
 
 
112 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  34.96 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  34.96 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  36.59 
 
 
117 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  36.59 
 
 
117 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2050  nitrogen regulatory protein P-II  37.4 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.885894  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  39.84 
 
 
112 aa  72  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  36.59 
 
 
136 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  36.59 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  34.96 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0742  nitrogen regulatory protein P-II  36.59 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0306564  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0233  nitrogen regulatory protein P-II  39.02 
 
 
112 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  36.59 
 
 
112 aa  71.2  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1243  nitrogen regulatory protein P-II  36.59 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.50478  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  34.15 
 
 
112 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  36.59 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  36.59 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  37.4 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0883  nitrogen regulatory protein P-II  36.59 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1090  nitrogen regulatory protein P-II  36.59 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0228645  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 
112 aa  71.2  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  34.96 
 
 
112 aa  71.2  0.000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3038  nitrogen regulatory protein P-II 1  37.4 
 
 
112 aa  71.2  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.196983  normal  0.293626 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1144  nitrogen regulatory protein P-II  38.06 
 
 
135 aa  71.2  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.931676  normal  0.946017 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1584  nitrogen regulatory protein P-II  36.59 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.138814  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  36.59 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1507  nitrogen regulatory protein P-II  35.77 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  36.59 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3013  nitrogen regulatory protein P-II  36.59 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00180505  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  34.15 
 
 
112 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2271  nitrogen regulatory protein P-II  36.59 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  36.59 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1085  nitrogen regulatory protein P-II  36.59 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0800  nitrogen regulatory protein P-II  37.4 
 
 
112 aa  71.2  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0321  nitrogen regulatory protein P-II  36.59 
 
 
112 aa  70.9  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>