128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0897 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0897  OsmC family protein  100 
 
 
145 aa  293  5e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669017  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1904  OsmC family protein  38.1 
 
 
193 aa  99  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.576095  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  32.17 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1670  OsmC family protein  30.3 
 
 
156 aa  85.1  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0539264  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1071  OsmC family protein  27.27 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000601559  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1075  OsmC family protein  27.27 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1143  OsmC family protein  27.27 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000523467  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2794  OsmC family protein  28.46 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  33.9 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3495  hypothetical protein  26.92 
 
 
142 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  36.36 
 
 
170 aa  69.7  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3007  OsmC family protein  26.98 
 
 
146 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  32.5 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  31.71 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  29.03 
 
 
177 aa  63.9  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  29.69 
 
 
147 aa  63.5  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  31.25 
 
 
148 aa  62.8  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  28.45 
 
 
189 aa  59.7  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3965  OsmC family protein  30.09 
 
 
132 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0969  OsmC family protein  27.27 
 
 
182 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.298439 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1026  OsmC family protein  28.33 
 
 
206 aa  57  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13840  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  25.56 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2100  OsmC family protein  30.65 
 
 
185 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  28.35 
 
 
176 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0586  OsmC family protein  27.2 
 
 
179 aa  54.3  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal  0.0133234 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2788  hypothetical protein  28.32 
 
 
186 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1595  OsmC family protein  29.91 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  24 
 
 
171 aa  52.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2279  OsmC family protein  29.91 
 
 
155 aa  53.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0377998  normal  0.182149 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2254  OsmC-like protein  25.2 
 
 
199 aa  52  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  30.28 
 
 
409 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3231  OsmC family protein  30.48 
 
 
163 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1151  OsmC family protein  26.39 
 
 
183 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.824502  normal  0.359642 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0190  OsmC family protein  25.95 
 
 
189 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1628  OsmC-like protein  26.98 
 
 
138 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0181271 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1644  OsmC family protein  24.43 
 
 
193 aa  51.6  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1058  OsmC family protein  27.97 
 
 
200 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.333829 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1310  OsmC family protein  24.31 
 
 
183 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47097  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0541  OsmC family protein  45.1 
 
 
151 aa  50.4  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.489752  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07015  hypothetical protein  25.64 
 
 
181 aa  50.4  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0623  hypothetical protein  26.17 
 
 
176 aa  50.1  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0005983  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5247  OsmC family protein  25 
 
 
187 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.402263 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2175  OsmC-like protein  24.48 
 
 
185 aa  48.9  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.416909  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2484  OsmC family protein  31.43 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.092178 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4851  OsmC-like protein  21.97 
 
 
187 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.137347 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6453  OsmC family protein  24.79 
 
 
182 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16719  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6160  OsmC family protein  24.59 
 
 
182 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76501  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4175  hypothetical protein  29.01 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214068  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  29.17 
 
 
408 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0049  OsmC family protein  30 
 
 
406 aa  47.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4264  hypothetical protein  28.45 
 
 
184 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2898  OsmC-like protein  28.97 
 
 
135 aa  47.4  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  28.57 
 
 
413 aa  47.4  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4668  OsmC family protein  23.61 
 
 
183 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2836  OsmC family protein  24.06 
 
 
177 aa  47.4  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  32.14 
 
 
131 aa  47.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2054  OsmC family protein  31.03 
 
 
164 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  28.83 
 
 
130 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  28.83 
 
 
130 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2212  OsmC family protein  25.89 
 
 
159 aa  47  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  31.36 
 
 
412 aa  47  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  29.36 
 
 
130 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7506  hypothetical protein  30.49 
 
 
188 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101926  normal  0.551931 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48750  hypothetical protein  28.24 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000274485 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  28.44 
 
 
405 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  27.52 
 
 
406 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1255  OsmC-like protein  30.49 
 
 
176 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6577  OsmC family protein  30.49 
 
 
176 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6182  OsmC family protein  30.49 
 
 
176 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.360981 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3793  OsmC family protein  28.57 
 
 
185 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.242728 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2717  OsmC-like protein  29.66 
 
 
135 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712413 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3145  redox protein regulator of disulfide bond formation, OsmC-like  25.56 
 
 
132 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1978  OsmC family protein  28.57 
 
 
186 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0982  OsmC family protein  38.18 
 
 
127 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2142  OsmC family protein  26.23 
 
 
129 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1348  OsmC family protein  28.18 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1270  hypothetical protein  27.87 
 
 
144 aa  45.1  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00225413  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0275  OsmC-like protein  29.27 
 
 
138 aa  45.1  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000021415  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6635  OsmC family protein  29.59 
 
 
411 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  hitchhiker  0.00000360166 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5418  hypothetical protein  26.5 
 
 
180 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1840  hypothetical protein  30 
 
 
405 aa  44.7  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.949047 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5957  OsmC family protein  24.37 
 
 
190 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0042  OsmC family protein  28.23 
 
 
142 aa  44.7  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  26.61 
 
 
130 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3848  OsmC family protein  24.74 
 
 
181 aa  44.7  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.323457  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  30.09 
 
 
402 aa  44.3  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1403  OsmC family protein  24.03 
 
 
132 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655694  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2570  OsmC family protein  23.66 
 
 
187 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1440  OsmC family protein  31.19 
 
 
142 aa  43.9  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1525  OsmC family protein  26.5 
 
 
141 aa  42.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.267191  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3491  OsmC family protein  25.22 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0361  OsmC family protein  30.3 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1486  OsmC-like protein  25 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320434  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  27.93 
 
 
407 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1923  OsmC-like protein  34.55 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4895  OsmC-like protein  25.49 
 
 
184 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2557  OsmC family protein  26.61 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000559572  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6854  OsmC family protein  28.57 
 
 
186 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521419  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1950  OsmC family protein  25.37 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  29.63 
 
 
410 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>