31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3345 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3345  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 419 aa  835    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.138271  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0507  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 		 451 aa  186  7e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3833  TPR repeat-containing protein  32.03 
 
 		 446 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117065  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0486  TPR repeat-containing protein  43.46 
 
 		 445 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0510  TPR repeat-containing protein  46.34 
 
 		 450 aa  176  7e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0562  TPR repeat-containing protein  31.85 
 
 		 396 aa  170  4e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3749  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 		 425 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.541109  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0456  MSHA biogenesis protein MshN, putative  40 
 
 		 399 aa  160  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3766  TPR repeat-containing protein  30.09 
 
 		 428 aa  160  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0468  TPR repeat-containing protein  43.06 
 
 		 441 aa  159  9e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4415  TPR repeat-containing protein  32.87 
 
 		 397 aa  155  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3484  TPR repeat-containing protein  42.29 
 
 		 441 aa  155  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.317992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0546  TPR repeat-containing protein  32.27 
 
 		 413 aa  152  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0391  TPR repeat-containing protein  32.07 
 
 		 386 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2822  MSHA biogenesis protein MshN  32.32 
 
 		 389 aa  89  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0471  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHN)  27.64 
 
 		 357 aa  88.6  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0436928  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03696  hypothetical protein  29 
 
 		 365 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0387  putative MshA biogenesis protein, MshN-like  29.61 
 
 		 481 aa  77.8  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00107124  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4574  putative MSHA biogenesis protein MshN  23.87 
 
 		 403 aa  76.3  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002370  MSHA biogenesis protein MshN  26.94 
 
 		 364 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00253  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshN (pilus type IV)  28.84 
 
 		 418 aa  72.4  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0172  hypothetical protein  31.45 
 
 		 373 aa  72.4  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.356715  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3272  hypothetical protein  27.59 
 
 		 461 aa  56.6  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0895  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 354 aa  53.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.643748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01444  TPR repeat protein  32 
 
 		 937 aa  49.3  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0688079  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0766  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 		 369 aa  49.3  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0146573  normal  0.0797434 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  33.78 
 
 		 884 aa  47.4  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 632 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0327  TPR repeat-containing protein  22.92 
 
 		 413 aa  46.2  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.366106  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 		 301 aa  45.8  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1225  hypothetical protein  32.17 
 
 		 941 aa  44.3  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>