More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2086 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2086  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 336 aa  695    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  29.62 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  29.39 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 271 aa  82  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.5 
 
 		 368 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  25.39 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27.03 
 
 		 265 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.5 
 
 		 368 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 334 aa  79.7  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  26.69 
 
 		 259 aa  79.3  0.00000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 		 284 aa  78.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2933  alpha/beta hydrolase fold protein  29.3 
 
 		 260 aa  78.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  hitchhiker  0.000486055 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.14 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  26.77 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  26.38 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  29.69 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  27.95 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0914  alpha/beta hydrolase fold protein  29.18 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  28.79 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5264  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.764514 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  26.86 
 
 		 256 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  26.86 
 
 		 256 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 		 280 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  26.86 
 
 		 256 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6345  alpha/beta hydrolase fold  26.46 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.588074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  25.76 
 
 		 277 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  27.13 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  25.76 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  26.69 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  28.36 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  25.73 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  25.75 
 
 		 282 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 		 266 aa  72  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10564  peroxidase bpoC (non-haem peroxidase)  26.95 
 
 		 262 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0807819 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  27.84 
 
 		 270 aa  72  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  25.96 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3997  alpha/beta hydrolase fold  24.56 
 
 		 338 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  26.25 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  26.3 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  27.87 
 
 		 425 aa  70.9  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  27.56 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  28.52 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6522  alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6756  alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.216165  normal  0.0313623 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3061  alpha/beta hydrolase fold  25.64 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  24.44 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5410  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4148  alpha/beta hydrolase fold protein  28.25 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  23.86 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1813  alpha/beta hydrolase fold  25.54 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.557453  normal  0.0116174 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3435  alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 		 302 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.898623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  24.63 
 
 		 277 aa  69.3  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  25.46 
 
 		 270 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 		 340 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3219  alpha/beta hydrolase fold protein  25.19 
 
 		 270 aa  69.3  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1824  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 		 332 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.459481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  26.41 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  25.28 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0974  alpha/beta hydrolase fold  25.77 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3372  alpha/beta hydrolase fold  24.07 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.771296 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2201  alpha/beta fold family hydrolase  27.7 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  27.24 
 
 		 270 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4279  alpha/beta hydrolase fold  25.84 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52768  normal  0.131681 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 		 275 aa  67  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  23.68 
 
 		 323 aa  67  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  25.73 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  25.73 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3736  alpha/beta hydrolase fold  26.27 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265867  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  26.05 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  24.09 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3536  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3962  3-oxoadipate enol-lactonase  26.52 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  38.61 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  25.38 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  27.09 
 
 		 256 aa  65.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 		 272 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 279 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  25.66 
 
 		 278 aa  65.5  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  25.6 
 
 		 277 aa  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4822  alpha/beta hydrolase fold  23.64 
 
 		 340 aa  65.1  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3643  alpha/beta hydrolase fold  25.58 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5868  alpha/beta hydrolase fold protein  25.65 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.139447 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0887  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0583236  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  26.74 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  26.14 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>