39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1033 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1033  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  628  1e-179  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1008  hypothetical protein  71.53 
 
 		 302 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.884011  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2816  alpha/beta hydrolase fold  67.87 
 
 		 325 aa  435  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1224  hypothetical protein  68.65 
 
 		 328 aa  432  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1043  alpha/beta hydrolase fold  67.99 
 
 		 333 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.791084  hitchhiker  0.00189554 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1146  alpha/beta hydrolase fold protein  65.48 
 
 		 331 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000108014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1108  alpha/beta hydrolase fold  67.66 
 
 		 333 aa  427  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1047  hypothetical protein  67 
 
 		 333 aa  425  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00162551 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3360  alpha/beta hydrolase fold  65.48 
 
 		 331 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.110045 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3222  alpha/beta hydrolase fold  65.79 
 
 		 331 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3221  alpha/beta hydrolase fold  65.79 
 
 		 331 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3042  alpha/beta hydrolase fold  64.75 
 
 		 302 aa  412  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2809  alpha/beta hydrolase fold  66.78 
 
 		 308 aa  412  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000352126 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0979  alpha/beta hydrolase fold  64.88 
 
 		 325 aa  412  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0862357 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3372  alpha/beta hydrolase fold  66.01 
 
 		 314 aa  408  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.670411 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3543  alpha/beta hydrolase fold  62.67 
 
 		 313 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0195115 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1597  alpha/beta hydrolase fold  46.42 
 
 		 274 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0878  hypothetical protein  41.87 
 
 		 334 aa  218  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000343609  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2086  hypothetical protein  26.76 
 
 		 329 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  0.0731474 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2091  esterase/lipase/thioesterase family protein  25.55 
 
 		 329 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226093  hitchhiker  0.00381064 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1594  alpha/beta fold family hydrolase  27.46 
 
 		 342 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477038 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2293  esterase/lipase/thioesterase family protein  27.47 
 
 		 330 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00953151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41650  putative esterase  28.32 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3657  hypothetical protein  26.69 
 
 		 342 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.186916  normal  0.561219 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3535  esterase/lipase  27.05 
 
 		 336 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2083  lipase, putative  26.67 
 
 		 330 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.826703  normal  0.0145598 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1771  lipase, putative  26.64 
 
 		 329 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000783432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1601  alpha/beta fold family hydrolase  26.33 
 
 		 342 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925882  hitchhiker  0.00000000109421 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4380  alpha/beta hydrolase fold  25.55 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4247  Alpha/beta hydrolase fold-1  25 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.724002  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4403  alpha/beta hydrolase fold protein  25.24 
 
 		 357 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.956683  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1479  alpha/beta hydrolase fold  24.18 
 
 		 309 aa  53.9  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.940058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4396  alpha/beta hydrolase fold  25.68 
 
 		 368 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375375 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48210  putative hydrolase  28.4 
 
 		 294 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000506825  normal  0.0564296 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1956  alpha/beta hydrolase fold  25.58 
 
 		 335 aa  49.7  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2203  alpha/beta hydrolase fold  21.11 
 
 		 319 aa  49.3  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0832977  decreased coverage  0.00859748 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2581  putative hydrolase  30.95 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543603 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3622  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1848  alpha/beta hydrolase fold  35.9 
 
 		 295 aa  43.9  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674995  normal  0.35019 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>