More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2236 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_2236  recA protein  100 
 
 		 347 aa  696    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2002  recombinase A  81.79 
 
 		 345 aa  564  1e-160  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177298  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0201  recombinase A  79.42 
 
 		 345 aa  550  1e-155  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.911025  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0616  recombinase A  80.55 
 
 		 364 aa  546  1e-154  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2094  recombinase A  78.01 
 
 		 365 aa  540  9.999999999999999e-153  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0153  recombinase A  77.06 
 
 		 344 aa  534  1e-151  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1845  recombinase A  75.8 
 
 		 343 aa  525  1e-148  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1787  recombinase A  77.03 
 
 		 348 aa  525  1e-148  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.744188  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1669  recombinase A  75.8 
 
 		 343 aa  525  1e-148  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2047  recombinase A  75.51 
 
 		 343 aa  521  1e-147  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.161674  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  68.31 
 
 		 336 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  70.68 
 
 		 362 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  70.37 
 
 		 364 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  63.37 
 
 		 350 aa  465  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  66.57 
 
 		 355 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  65.48 
 
 		 345 aa  462  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  68.83 
 
 		 361 aa  463  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  65.48 
 
 		 345 aa  462  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  68.18 
 
 		 360 aa  464  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  67.59 
 
 		 361 aa  458  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  63.19 
 
 		 348 aa  459  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  63.19 
 
 		 348 aa  459  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2558  recombinase A  67.28 
 
 		 362 aa  458  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352201  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  65.55 
 
 		 342 aa  458  9.999999999999999e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  68.01 
 
 		 366 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  64.37 
 
 		 362 aa  456  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03079  recombinase A  66.97 
 
 		 348 aa  456  1e-127  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.353429  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0727  recombinase A  64.86 
 
 		 347 aa  455  1e-127  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.794192  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  64.37 
 
 		 363 aa  457  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4194  recombinase A  67.07 
 
 		 358 aa  455  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1288  recombinase A  65.45 
 
 		 348 aa  456  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  66.36 
 
 		 361 aa  454  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  67.59 
 
 		 424 aa  457  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  64.53 
 
 		 343 aa  453  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  64.53 
 
 		 348 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  65.22 
 
 		 341 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  64.63 
 
 		 347 aa  451  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  65.43 
 
 		 357 aa  451  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1230  recombinase A  65.43 
 
 		 357 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.460816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  67.08 
 
 		 338 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  67.08 
 
 		 338 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  65.85 
 
 		 343 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2228  recA protein  68.2 
 
 		 363 aa  449  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  67.41 
 
 		 365 aa  448  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3956  recA protein  64.33 
 
 		 384 aa  451  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.165355 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  66.05 
 
 		 363 aa  448  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  66.36 
 
 		 345 aa  449  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3948  recA protein  66.77 
 
 		 384 aa  449  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  66.05 
 
 		 363 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  64.72 
 
 		 347 aa  449  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  63.61 
 
 		 350 aa  449  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0711  recombinase A  64.94 
 
 		 345 aa  450  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3015  recombinase A  64.53 
 
 		 347 aa  449  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.514179  hitchhiker  0.000000000000973321 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  66.67 
 
 		 341 aa  449  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  66.05 
 
 		 362 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_002978  WD1050  recombinase A  67.18 
 
 		 355 aa  447  1.0000000000000001e-124  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2629  recA protein  67.79 
 
 		 366 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0618  recA protein  62.69 
 
 		 347 aa  444  1.0000000000000001e-124  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.186792  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  65.42 
 
 		 343 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1231  recombinase A  63.3 
 
 		 355 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000000176903 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  64.81 
 
 		 362 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0881  recombinase A  65.03 
 
 		 343 aa  445  1.0000000000000001e-124  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.115374  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  66.05 
 
 		 363 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  64.2 
 
 		 383 aa  445  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0996  recA protein  64.44 
 
 		 363 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  63.8 
 
 		 360 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0988  recombinase A  65.03 
 
 		 343 aa  445  1.0000000000000001e-124  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  64.63 
 
 		 352 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  64.33 
 
 		 352 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  64.22 
 
 		 347 aa  447  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  65.43 
 
 		 347 aa  445  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  64.22 
 
 		 347 aa  447  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2601  recA protein  67.79 
 
 		 366 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.2342 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0988  recA protein  65.53 
 
 		 335 aa  447  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  65.62 
 
 		 347 aa  444  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2082  recombinase A  65.12 
 
 		 347 aa  445  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2824  recA protein  67.79 
 
 		 366 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217843  normal  0.126726 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0981  recA protein  64.22 
 
 		 358 aa  444  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1629  recombinase A  63.3 
 
 		 355 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.849206  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  62.54 
 
 		 347 aa  441  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5503  recA protein  67.89 
 
 		 363 aa  444  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468538  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38560  recombinase A  64.51 
 
 		 349 aa  442  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2373  recombinase A  62.73 
 
 		 351 aa  442  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00420891  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  63.61 
 
 		 345 aa  441  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4088  recombinase A  63.3 
 
 		 355 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  65.12 
 
 		 364 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  65.63 
 
 		 356 aa  444  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1523  recombinase A  63.58 
 
 		 346 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  63.31 
 
 		 347 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4685  recA protein  66.13 
 
 		 377 aa  441  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000254393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  65.12 
 
 		 362 aa  443  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0291  recA protein  67.89 
 
 		 363 aa  443  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0355806  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  63.05 
 
 		 359 aa  444  1e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17530  recombinase A  63.58 
 
 		 346 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3213  recombinase A  61.49 
 
 		 357 aa  441  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.996939  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1114  recombinase A  61.6 
 
 		 357 aa  442  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.239871  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0597  recombinase A  65.22 
 
 		 356 aa  442  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  63.31 
 
 		 347 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  62.91 
 
 		 350 aa  442  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1905  recombinase A  61.38 
 
 		 357 aa  444  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.954739 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>