55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1127 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1127  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 341 aa  679    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0698  ribonuclease PH  45.87 
 
 		 342 aa  287  2e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.782296  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1263  permease YjgP/YjgQ  46.96 
 
 		 342 aa  282  6.000000000000001e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000160031  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0748  YjgP/YjgQ permease  42.86 
 
 		 341 aa  275  7e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0913  hypothetical protein  42.27 
 
 		 341 aa  262  6.999999999999999e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.17255  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0843  hypothetical protein  42.27 
 
 		 341 aa  262  6.999999999999999e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1188  hypothetical protein  41.81 
 
 		 341 aa  261  1e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0525463  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0972  YjgP/YjgQ permease  43.58 
 
 		 340 aa  257  2e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.707138  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0976  putative permease, YjgP/YjgQ family  43.6 
 
 		 341 aa  251  2e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0995  permease YjgP/YjgQ  43 
 
 		 339 aa  233  3e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  23.15 
 
 		 792 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0872  permease YjgP/YjgQ  23.88 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000506114  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  22.01 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1015  permease YjgP/YjgQ family protein  23.62 
 
 		 370 aa  59.7  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000271858  normal  0.473888 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  20 
 
 		 370 aa  55.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000695544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1231  permease YjgP/YjgQ family protein  24.52 
 
 		 371 aa  55.8  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192979  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  21.65 
 
 		 371 aa  54.3  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  24.37 
 
 		 382 aa  54.3  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  22.14 
 
 		 370 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  22.14 
 
 		 370 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3338  permease YjgP/YjgQ family protein  24.71 
 
 		 388 aa  53.9  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3118  permease YjgP/YjgQ family protein  22.14 
 
 		 370 aa  53.1  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000110304  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0527  putative permease  26.27 
 
 		 370 aa  53.1  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0167564  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  21.77 
 
 		 370 aa  53.1  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  20.54 
 
 		 418 aa  52  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0396  permease YjgP/YjgQ family protein  24.14 
 
 		 358 aa  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.167769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  22.74 
 
 		 418 aa  50.4  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0796  hypothetical protein  24.88 
 
 		 369 aa  50.1  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.211721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  22.65 
 
 		 392 aa  49.7  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0925  permease YjgP/YjgQ family protein  24.55 
 
 		 370 aa  49.3  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000914337  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2530  permease YjgP/YjgQ family protein  26.06 
 
 		 378 aa  48.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.749789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  21.16 
 
 		 370 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0902  permease YjgP/YjgQ family protein  23.53 
 
 		 382 aa  48.5  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2628  permease YjgP/YjgQ family protein  23.97 
 
 		 386 aa  47.4  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  24.11 
 
 		 403 aa  47  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 384 aa  46.6  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2900  permease  23.89 
 
 		 376 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.675827  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1544  permease YjgP/YjgQ family protein  23.89 
 
 		 376 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2917  permease YjgP/YjgQ  25.44 
 
 		 386 aa  45.4  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3933  permease YjgP/YjgQ family protein  22.63 
 
 		 389 aa  45.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0880082 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2465  permease YjgP/YjgQ  20.09 
 
 		 371 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  20.38 
 
 		 399 aa  44.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  21.9 
 
 		 371 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1490  permease YjgP/YjgQ family protein  21.9 
 
 		 371 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.857253  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1121  permease YjgP/YjgQ family protein  24.77 
 
 		 376 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182226 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3046  permease YjgP/YjgQ family protein  24.88 
 
 		 398 aa  43.9  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.583583 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3650  permease YjgP/YjgQ family protein  21.58 
 
 		 389 aa  43.9  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3943  permease YjgP/YjgQ family protein  21.58 
 
 		 389 aa  43.9  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  20.46 
 
 		 379 aa  43.5  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0111  permease YjgP/YjgQ family protein  27.72 
 
 		 364 aa  43.5  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.482303  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1814  permease YjgP/YjgQ  24.81 
 
 		 371 aa  43.5  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.120366  normal  0.600316 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  20.27 
 
 		 391 aa  43.1  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  23.56 
 
 		 478 aa  43.1  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11670  permease YjgP/YjgQ family  25.55 
 
 		 376 aa  43.1  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0962  permease YjgP/YjgQ family protein  23.53 
 
 		 367 aa  42.7  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>