59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0640 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0640  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 
404 aa  833    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1219  fibronectin type III domain-containing protein  42.18 
 
 
388 aa  315  9e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1415  fibronectin type III domain-containing protein  39.6 
 
 
410 aa  279  7e-74  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1295  fibronectin type III domain-containing protein  39.6 
 
 
410 aa  278  1e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1288  fibronectin type III domain-containing protein  39.45 
 
 
394 aa  277  2e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.125445  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0446  fibronectin type III domain-containing protein  39.85 
 
 
409 aa  277  3e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0610  fibronectin type III domain protein  38.9 
 
 
404 aa  272  6e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0784  fibronectin, type III  35.18 
 
 
444 aa  243  3e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0508  diaminopimelate decarboxylase dap decarboxylase  45.79 
 
 
181 aa  159  1e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3156  Fibronectin type III domain protein  26.63 
 
 
741 aa  94.7  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  27.65 
 
 
1462 aa  70.9  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  26.01 
 
 
649 aa  61.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  25.49 
 
 
2068 aa  60.8  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  28.21 
 
 
1628 aa  60.1  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.84 
 
 
6885 aa  59.3  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.71 
 
 
795 aa  57.8  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 
1230 aa  54.3  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  25 
 
 
1380 aa  53.1  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  24.33 
 
 
680 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  28.97 
 
 
456 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  25.79 
 
 
456 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4335  alpha amylase catalytic region  38.14 
 
 
1753 aa  51.6  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.167512  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  23.22 
 
 
9585 aa  51.2  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  25 
 
 
2286 aa  50.4  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  27.71 
 
 
803 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0017  fibronectin type III domain protein  28.1 
 
 
207 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.857049  normal  0.0757173 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  28.14 
 
 
1199 aa  49.3  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1543  cellulosome anchoring protein cohesin region  27.41 
 
 
782 aa  48.9  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000430269  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1632  Fibronectin type III domain protein  30.59 
 
 
377 aa  48.5  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2773  Fibronectin type III domain protein  22.87 
 
 
690 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000670095 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  26.98 
 
 
1042 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  36.84 
 
 
1307 aa  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_009673  Bcer98_4034  fibronectin type III domain-containing protein  23.78 
 
 
454 aa  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1314  Fibronectin type III domain protein  25.97 
 
 
211 aa  47.8  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000146829  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  24.64 
 
 
458 aa  47.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1100  FG-GAP repeat protein  25.79 
 
 
1065 aa  47.4  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3668  fibronectin type III domain-containing protein  26.51 
 
 
836 aa  47.4  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  23.53 
 
 
1363 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  22.92 
 
 
1363 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  27.74 
 
 
3802 aa  46.6  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  25 
 
 
729 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  28.11 
 
 
1160 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  23.15 
 
 
1847 aa  46.2  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0543  Fibronectin type III domain protein  25.99 
 
 
928 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  24.87 
 
 
459 aa  44.7  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  25.58 
 
 
455 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  24.23 
 
 
445 aa  44.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2396  protein of unknown function DUF187  30.1 
 
 
532 aa  44.3  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.00000000122661  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  28.57 
 
 
905 aa  44.3  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1040  fibronectin type III domain-containing protein  25 
 
 
771 aa  44.3  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6454  serine/threonine protein kinase  30.83 
 
 
705 aa  43.9  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00864828 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0068  fibronectin, type III domain-containing protein  25.37 
 
 
1695 aa  43.9  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  26.16 
 
 
455 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  26.9 
 
 
458 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  25.7 
 
 
455 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  35.48 
 
 
455 aa  43.5  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  35.48 
 
 
455 aa  43.5  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  27.41 
 
 
527 aa  43.1  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  22.83 
 
 
918 aa  42.7  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>