36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3094 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3094  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 266 aa  556  1e-157  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1242  lipolytic protein G-D-S-L family  50.78 
 
 		 251 aa  254  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0146465  normal  0.0264869 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1156  lipolytic protein G-D-S-L family  48.08 
 
 		 266 aa  251  7e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.866129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1522  lipolytic protein G-D-S-L family  50.91 
 
 		 252 aa  240  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.652703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4445  lipolytic protein G-D-S-L family  46.82 
 
 		 230 aa  217  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.185378  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05360  fibronectin type 3 domain-containing protein  34.9 
 
 		 1880 aa  171  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  41.63 
 
 		 727 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2325  lipolytic protein G-D-S-L family  36.51 
 
 		 340 aa  169  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4664  lipolytic protein G-D-S-L family  36.6 
 
 		 285 aa  162  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.106654  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4246  GDSL family lipase  41.98 
 
 		 218 aa  161  8.000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50953  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2735  GDSL family lipase  38.97 
 
 		 239 aa  153  4e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.886563  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.53 
 
 		 831 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3820  Pectinesterase  34.91 
 
 		 627 aa  139  6e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29260  lysophospholipase L1-like esterase  35.87 
 
 		 230 aa  135  5e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0769  lipolytic protein G-D-S-L family  33.48 
 
 		 258 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1336  GDSL family lipase  33.47 
 
 		 419 aa  131  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341885 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3313  GDSL family lipase  32.68 
 
 		 233 aa  129  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1356  GDSL family lipase  35.41 
 
 		 552 aa  125  8.000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3111  lipolytic protein G-D-S-L family  33.33 
 
 		 238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2824  putative rhamnogalacturonan acetylesterase  36.02 
 
 		 165 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4273  pectinesterase  31.6 
 
 		 571 aa  110  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4226  GDSL family lipase  29.67 
 
 		 491 aa  103  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1231  Lysophospholipase L1 and related esterase-like protein  32.38 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0882392 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4022  GDSL family lipase  28.52 
 
 		 277 aa  95.5  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03283  rhamnogalacturonan acetylesterase  38.93 
 
 		 161 aa  94  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.826167  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0740  pectinesterase  27.41 
 
 		 865 aa  91.7  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1229  pectin acetylesterase  25.48 
 
 		 552 aa  85.9  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02834  esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17250)  28.05 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.417764  normal  0.0230725 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1088  pectin acetylesterase  25.94 
 
 		 551 aa  84  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3046  pectin acetylesterase  26.26 
 
 		 552 aa  82.4  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2765  lipolytic protein G-D-S-L family  28.51 
 
 		 546 aa  80.5  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.198603  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3372  lipolytic protein G-D-S-L family  27.57 
 
 		 396 aa  80.1  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02528  Putative uncharacterized proteinRhamnogalacturonan acetylesterase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BAA2]  31.74 
 
 		 245 aa  75.1  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2625  hypothetical protein  26.7 
 
 		 469 aa  50.1  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2189  GDSL family lipase  25.97 
 
 		 250 aa  44.7  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00786475  normal  0.715805 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2599  lipolytic protein G-D-S-L family  26.22 
 
 		 213 aa  42.7  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>