More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2825 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0820  serine/threonine protein kinase  57.82 
 
 		 574 aa  692    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.703748  normal  0.0249792 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1942  Serine/threonine protein kinase  54.63 
 
 		 621 aa  638    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2825  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 574 aa  1192    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.766433  hitchhiker  0.00137239 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2845  serine/threonine protein kinase  54.82 
 
 		 577 aa  652    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36762  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3613  serine/threonine protein kinase  52.97 
 
 		 577 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374938  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0704  serine/threonine protein kinase  54.12 
 
 		 569 aa  615  1e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0336836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0330  serine/threonine protein kinase  54.11 
 
 		 574 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7924  serine/threonine protein kinase  51.75 
 
 		 572 aa  608  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.345293  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3479  protein serine/threonine phosphatases  50.61 
 
 		 580 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.644953  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3727  protein kinase  51.97 
 
 		 569 aa  591  1e-167  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000615107 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0181  protein kinase  48.39 
 
 		 579 aa  567  1e-160  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1132  protein kinase  48.29 
 
 		 571 aa  544  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1244  serine/threonine protein kinase  48.47 
 
 		 571 aa  545  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3139  serine/threonine protein kinase  48.93 
 
 		 585 aa  531  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1512  serine/threonine protein kinase  38.69 
 
 		 596 aa  403  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1814  serine/threonine protein kinase  38.03 
 
 		 596 aa  390  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02559  Serine/threonine protein kinase  38.01 
 
 		 605 aa  386  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2762  serine/threonine protein kinase  35.21 
 
 		 606 aa  382  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757983  normal  0.303991 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4949  serine/threonine protein kinase  36.55 
 
 		 610 aa  375  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1021  serine/threonine protein kinase  35.58 
 
 		 589 aa  375  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.867163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0248  putative membrane associated protein kinase  36 
 
 		 590 aa  375  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1878  serine/threonine protein kinase  35.69 
 
 		 599 aa  375  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.686913  hitchhiker  0.00272261 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2418  serine/threonine protein kinase  35.09 
 
 		 570 aa  369  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03878  Serine/threonine protein kinase  36.24 
 
 		 586 aa  372  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2627  protein serine/threonine phosphatase  34.55 
 
 		 576 aa  367  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0575166 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2279  serine/threonine protein kinase  36.57 
 
 		 574 aa  367  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0942803 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3713  protein kinase  37.29 
 
 		 591 aa  362  1e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1963  serine/threonine protein kinase  35.24 
 
 		 576 aa  355  1e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2280  serine/threonine protein kinase  31.12 
 
 		 548 aa  296  9e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187654  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1609  protein serine/threonine phosphatase  31.08 
 
 		 555 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122256  decreased coverage  0.000000000229317 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3205  protein serine/threonine phosphatase  29.44 
 
 		 571 aa  267  4e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.252613 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3649  protein kinase  31.38 
 
 		 556 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0234168  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2091  serine/threonine-protein kinase, putative  31.33 
 
 		 556 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0473599 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1602  protein serine/threonine phosphatase  31.33 
 
 		 556 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.022391  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2101  protein kinase  30.91 
 
 		 553 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1786  hitchhiker  0.00815198 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0826  protein kinase:protein phosphatase 2C-like  30.73 
 
 		 562 aa  257  4e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1782  protein serine/threonine phosphatase  29.29 
 
 		 556 aa  256  5e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2097  protein kinase  29.95 
 
 		 554 aa  252  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0694444 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3523  putative serine/threonine-protein kinase  31.22 
 
 		 555 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2971  protein serine/threonine phosphatases  30.22 
 
 		 563 aa  246  9e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0320  protein serine/threonine phosphatases  30.82 
 
 		 565 aa  246  9e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2303  serine/threonine protein kinase, putative  30.15 
 
 		 529 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23380  serine/threonine-kinase and phosphatase  28.95 
 
 		 559 aa  243  5e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0593  protein phosphatase/kinase family protein  28.06 
 
 		 595 aa  236  7e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41520  putative serine/threonine-protein kinase  30.33 
 
 		 533 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3527  serine/threonine protein kinase  29.76 
 
 		 566 aa  215  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2316  putative serine/threonine protein kinase  28.69 
 
 		 573 aa  213  9e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.943613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1410  protein kinase  27.44 
 
 		 582 aa  207  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.840602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3274  protein serine/threonine phosphatases  27.2 
 
 		 594 aa  207  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.35703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2677  protein serine/threonine phosphatase  29.81 
 
 		 580 aa  205  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1550  protein kinase  25.98 
 
 		 667 aa  201  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05919 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1321  serine/threonine protein kinase  26.72 
 
 		 700 aa  189  1e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1146  protein serine/threonine phosphatase  35.26 
 
 		 705 aa  130  8.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.694371  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  27.08 
 
 		 666 aa  125  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1555  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.18 
 
 		 707 aa  117  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.556964 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.45 
 
 		 598 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  31.35 
 
 		 586 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4523  serine/threonine protein kinase  30.19 
 
 		 439 aa  113  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  29.28 
 
 		 662 aa  113  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6663  serine/threonine protein kinase  32.57 
 
 		 414 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.997468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  33.49 
 
 		 646 aa  111  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1554  serine/threonine protein kinase  29.39 
 
 		 710 aa  111  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3840  serine/threonine protein kinase  27.44 
 
 		 466 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  29.01 
 
 		 634 aa  110  9.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  31.67 
 
 		 468 aa  109  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4114  serine/threonine protein kinase  27.46 
 
 		 513 aa  109  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0600748  normal  0.0166963 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0022  serine/threonine protein kinase  32.38 
 
 		 567 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0878271  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5336  serine/threonine protein kinase  27.24 
 
 		 485 aa  108  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0786  serine/threonine protein kinase, putative  27.4 
 
 		 666 aa  107  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  32.06 
 
 		 666 aa  107  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  30.37 
 
 		 614 aa  107  5e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3757  serine/threonine protein kinase  26.71 
 
 		 466 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.79 
 
 		 551 aa  107  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3699  serine/threonine protein kinase  26.71 
 
 		 469 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2501  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.76 
 
 		 1036 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.04 
 
 		 602 aa  106  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4975  serine/threonine protein kinase  31.19 
 
 		 580 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.71 
 
 		 863 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.94 
 
 		 740 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  28.93 
 
 		 638 aa  104  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3860  serine/threonine protein kinase  27.45 
 
 		 486 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12204  transmembrane serine/threonine-protein kinase L pknL  30.73 
 
 		 399 aa  105  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 502 aa  105  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0456  serine/threonine protein kinase  31.54 
 
 		 490 aa  105  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.959747  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0928  serine/threonine protein kinase  26.09 
 
 		 761 aa  104  4e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000612403  hitchhiker  1.21149e-16 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.34 
 
 		 650 aa  104  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3668  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.35 
 
 		 553 aa  104  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.965868  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.91 
 
 		 505 aa  103  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0507  serine/threonine protein kinase  31.03 
 
 		 569 aa  103  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.672124  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6001  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.68 
 
 		 607 aa  103  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.13 
 
 		 668 aa  103  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2796  serine/threonine protein kinase  32.69 
 
 		 982 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0264511  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3809  serine/threonine protein kinase  26.37 
 
 		 478 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  26.3 
 
 		 625 aa  103  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.82 
 
 		 880 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0870  serine/threonine protein kinase  28 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.43 
 
 		 700 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1100  serine/threonine protein kinase  32.54 
 
 		 1415 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  30.68 
 
 		 776 aa  102  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  32.98 
 
 		 593 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>