202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0879 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0879  hypothetical protein  100 
 
 		 528 aa  1061    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.207268  hitchhiker  0.000254267 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1667  major facilitator transporter  49.06 
 
 		 451 aa  242  9e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0579205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03703  putative muropeptide transport protein  51.19 
 
 		 448 aa  241  2.9999999999999997e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0944  MSF transporter  50 
 
 		 447 aa  239  1e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03281  hypothetical protein  50.86 
 
 		 409 aa  237  4e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002702  AmpG permease  50.86 
 
 		 450 aa  237  4e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1889  putative ampG protein  51.48 
 
 		 462 aa  229  9e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1355  AmpG-related permease  30.44 
 
 		 515 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.010612  normal  0.140605 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0962  AmpG-related permease  31.3 
 
 		 515 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4369  AmpG-related permease  30.44 
 
 		 515 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0389334 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4494  AmpG-related permease  30.87 
 
 		 515 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.769685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0190  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 576 aa  182  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1400  signal transducer ampG1  28.9 
 
 		 502 aa  171  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00988952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0147  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 550 aa  166  9e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0110  major facilitator superfamily MFS_1  42.55 
 
 		 452 aa  148  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0140571  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3814  ampG protein, putative  37.93 
 
 		 461 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0812  major facilitator transporter  37.07 
 
 		 463 aa  143  6e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0783  major facilitator transporter  36.64 
 
 		 463 aa  143  9e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0711  major facilitator transporter  37.56 
 
 		 471 aa  143  9e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3723  major facilitator transporter  36.65 
 
 		 471 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3155  major facilitator transporter  36.64 
 
 		 465 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3600  major facilitator transporter  36.65 
 
 		 471 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3531  major facilitator superfamily MFS_1  37.1 
 
 		 471 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125194 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3644  major facilitator transporter  35.96 
 
 		 472 aa  140  7e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0893526 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0819  major facilitator transporter  35.81 
 
 		 471 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0771  major facilitator transporter  35.12 
 
 		 465 aa  137  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00332718  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3442  major facilitator transporter  36.12 
 
 		 478 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3113  major facilitator transporter  35.65 
 
 		 476 aa  134  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2556  AmpG protein, putative  36.13 
 
 		 466 aa  134  6e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0122  major facilitator transporter  25.55 
 
 		 509 aa  133  9e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00126713  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2892  major facilitator transporter  36.61 
 
 		 472 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0730175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13420  AmpG-related permease  41.98 
 
 		 515 aa  130  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2937  major facilitator transporter  33.73 
 
 		 443 aa  130  6e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4383  ampG protein, putative  43.97 
 
 		 516 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.920569  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4078  AmpG-related permease  43.26 
 
 		 516 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0139  beta-lactamase induction signal transducer protein  24.82 
 
 		 509 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.143308  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0146  muropeptide transporter  35.43 
 
 		 426 aa  126  9e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.802826 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4070  HNH endonuclease  26.77 
 
 		 509 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7099  major facilitator superfamily MFS_1  35.64 
 
 		 447 aa  121  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.835982  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0191  muropeptide transporter  33.78 
 
 		 419 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10028  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  37.13 
 
 		 428 aa  120  6e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6531  major facilitator transporter  41.55 
 
 		 443 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1198  AmpG permease  42.65 
 
 		 519 aa  118  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0069  major facilitator superfamily MFS_1  30.13 
 
 		 475 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0152  major facilitator superfamily transporter  36.1 
 
 		 466 aa  117  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.421087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7340  major facilitator superfamily permease  33.74 
 
 		 460 aa  116  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0941  hypothetical protein  40.26 
 
 		 598 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.274634 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3063  major facilitator transporter  37.11 
 
 		 452 aa  115  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.797307  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3691  major facilitator transporter  32.52 
 
 		 454 aa  115  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3114  major facilitator transporter  44.16 
 
 		 475 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0154  muropeptide transporter  32.61 
 
 		 426 aa  114  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.679367  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0044  muropeptide transporter  32.17 
 
 		 429 aa  114  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0623  major facilitator superfamily MFS_1  33.19 
 
 		 459 aa  114  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89214  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3596  major facilitator transporter  32.13 
 
 		 478 aa  113  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.597959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0047  muropeptide transporter  32.17 
 
 		 429 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1235  muropeptide MFS uptake transporter AmpG  38.71 
 
 		 550 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.988982 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0253  putative transport transmembrane protein  41.77 
 
 		 462 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0223  major facilitator transporter  42.95 
 
 		 461 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0770  major facilitator transporter  36.08 
 
 		 455 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.742854 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2143  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 450 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57100  putative permease  36.76 
 
 		 594 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4964  putative permease  36.22 
 
 		 594 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559843  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0083  major facilitator transporter  32.91 
 
 		 457 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2276  major facilitator superfamily MFS_1  33.72 
 
 		 416 aa  109  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1298  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 442 aa  109  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1218  major facilitator superfamily MFS_1  34.63 
 
 		 425 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2679  major facilitator transporter  36.55 
 
 		 465 aa  108  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000459278 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0664  major facilitator transporter  35.64 
 
 		 456 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757276  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1044  muropeptide transporter  32.84 
 
 		 495 aa  107  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0385615  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3983  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 416 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819094 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  35.26 
 
 		 412 aa  107  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2288  major facilitator transporter  30.21 
 
 		 468 aa  107  8e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  33.67 
 
 		 492 aa  106  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2584  major facilitator superfamily transporter  33.94 
 
 		 439 aa  106  9e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11871  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3268  muropeptide transporter  32.35 
 
 		 495 aa  106  9e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  31.34 
 
 		 491 aa  106  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0329  major facilitator transporter  41.21 
 
 		 478 aa  106  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00388  hypothetical protein  31.34 
 
 		 491 aa  106  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000464324  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0296  AmpG protein  39.04 
 
 		 457 aa  105  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0367426 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0199  major facilitator superfamily transporter  33.51 
 
 		 447 aa  105  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.723346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2636  major facilitator transporter  31.75 
 
 		 429 aa  105  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.103448  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2009  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 415 aa  105  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.872827  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1449  major facilitator transporter  35.27 
 
 		 453 aa  104  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3176  AmpG-related permease  31.34 
 
 		 491 aa  104  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022392  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  31.34 
 
 		 491 aa  104  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  31.34 
 
 		 491 aa  104  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  31.34 
 
 		 491 aa  104  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1726  major facilitator superfamily MFS_1  30.51 
 
 		 417 aa  104  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.299438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  31.34 
 
 		 491 aa  104  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  31.34 
 
 		 491 aa  104  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  31.34 
 
 		 491 aa  104  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1773  major facilitator transporter  38.85 
 
 		 630 aa  104  5e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0209  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 466 aa  103  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1156  major facilitator transporter  38.71 
 
 		 553 aa  103  8e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0968602  normal  0.231698 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0320  ampG protein, putative  31.49 
 
 		 409 aa  103  9e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2483  major facilitator transporter  28.63 
 
 		 411 aa  102  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  31.98 
 
 		 492 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0516  major facilitator transporter  39.19 
 
 		 441 aa  102  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  31.98 
 
 		 492 aa  102  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1209  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 448 aa  102  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.299464  normal  0.44689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>