261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3691 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3748  acyl-CoA dehydrogenase type 2  100 
 
 
403 aa  835    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3691  acyl-CoA dehydrogenase type 2  100 
 
 
403 aa  835    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3337  acyl-CoA dehydrogenase type 2  67.44 
 
 
400 aa  555  1e-157  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1542  hypothetical protein  50.67 
 
 
413 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0941275  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1413  Acyl-CoA dehydrogenase-like  48.52 
 
 
397 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.465411  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3648  acyl-CoA dehydrogenase type 2  46.29 
 
 
399 aa  356  2.9999999999999997e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2129  acyl-CoA dehydrogenase type 2  41.34 
 
 
407 aa  306  6e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.556044  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2776  acyl-CoA dehydrogenase type 2  42.19 
 
 
388 aa  292  7e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.576785  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3845  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  42.08 
 
 
391 aa  290  4e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1633  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain-containing protein  39.89 
 
 
402 aa  278  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.464804 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2671  acyl-CoA dehydrogenase type 2  42.05 
 
 
390 aa  276  3e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00505359  normal  0.0674396 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2879  acyl-CoA dehydrogenase type 2  41.78 
 
 
390 aa  276  5e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3508  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  37.4 
 
 
388 aa  263  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115117  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0920  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  36.29 
 
 
394 aa  263  6e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897315  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1828  acyl-CoA dehydrogenase type 2  42.2 
 
 
389 aa  251  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463674  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4709  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  38.12 
 
 
394 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4795  acyl-CoA dehydrogenase type 2  38.12 
 
 
394 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5094  acyl-CoA dehydrogenase type 2  38.12 
 
 
394 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0902  hypothetical protein  36.81 
 
 
402 aa  246  8e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000160111  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1463  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.59 
 
 
394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5308  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.02 
 
 
394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0842748 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13603  oxidoreductase  36.57 
 
 
394 aa  243  5e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.601758 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0933  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.96 
 
 
397 aa  242  7e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15060  oxidoreductase  38.07 
 
 
397 aa  238  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0529359  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3704  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.72 
 
 
370 aa  232  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2892  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.85 
 
 
393 aa  231  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.846301 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4548  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.91 
 
 
393 aa  230  3e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.277841 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0318  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  34.32 
 
 
393 aa  229  7e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193328  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0328  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.32 
 
 
393 aa  229  7e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.105819 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0309  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.32 
 
 
393 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2605  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  33.52 
 
 
392 aa  209  9e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2649  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.52 
 
 
392 aa  209  9e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5306  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  33.24 
 
 
421 aa  209  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2635  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.52 
 
 
392 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.430531  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0206  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.25 
 
 
391 aa  206  5e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3519  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  35.91 
 
 
394 aa  206  8e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.734065  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0937  putative pigment protein  34.67 
 
 
409 aa  204  3e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3744  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.16 
 
 
390 aa  189  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3018  putative acyl-CoA dehydrogenase  33.16 
 
 
390 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394232  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0209  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.62 
 
 
391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1536  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.9 
 
 
397 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.307066  hitchhiker  0.00234859 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3090  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.96 
 
 
404 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0412654  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3406  Acyl-CoA dehydrogenase  35.36 
 
 
409 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6104  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.66 
 
 
394 aa  169  6e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3505  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.3 
 
 
389 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0636117  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5725  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  30.05 
 
 
410 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3188  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.43 
 
 
389 aa  164  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2133  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.3 
 
 
396 aa  161  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422165  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5779  hypothetical protein  31.84 
 
 
405 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0696  hypothetical protein  29.4 
 
 
406 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103838  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2060  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal type2  28.42 
 
 
415 aa  156  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000000186324  normal  0.168772 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1567  Acyl-CoA dehydrogenase-like  27.25 
 
 
418 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029301  normal  0.0603177 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1564  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.17 
 
 
387 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1594  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  29.17 
 
 
387 aa  151  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1618  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.17 
 
 
387 aa  151  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6974  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  30.48 
 
 
393 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.503826 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2708  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.55 
 
 
390 aa  147  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7417  oxidoreductase  34.51 
 
 
383 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.177501  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32180  acyl-CoA dehydrogenase protein  27.32 
 
 
389 aa  145  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2089  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.95 
 
 
392 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.878616  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1900  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.76 
 
 
388 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4084  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.04 
 
 
394 aa  137  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1234  putative hydrolase  40.88 
 
 
370 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1773  GTP cyclohydrolase II  32.68 
 
 
636 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000841591 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4085  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  27.92 
 
 
394 aa  132  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4461  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.86 
 
 
392 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3621  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.91 
 
 
413 aa  126  7e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2500  Acyl-CoA dehydrogenase-like  27.64 
 
 
397 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284322  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6977  acyl-CoA dehydrogenase  28.72 
 
 
415 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.392428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6489  ccyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.94 
 
 
387 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1183  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.89 
 
 
404 aa  122  9e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.576313 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3521  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.33 
 
 
397 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0664779 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2207  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.25 
 
 
389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.853509  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3905  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.4 
 
 
397 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.936592 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5351  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.71 
 
 
397 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.901542  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3615  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.4 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0960663  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5083  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.4 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.267797 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2161  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  27.69 
 
 
392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05205  hypothetical protein  25.07 
 
 
393 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0918769  normal  0.0217925 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13111  hypothetical protein  28.07 
 
 
376 aa  117  5e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2720  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.67 
 
 
414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.186309  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1367  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.37 
 
 
397 aa  115  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2312  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.75 
 
 
404 aa  109  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0231485 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4703  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  33.33 
 
 
393 aa  109  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0738  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.72 
 
 
386 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.28274 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5062  possible oxidoreductase  28.34 
 
 
427 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4091  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  27.05 
 
 
392 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3894  Acyl-CoA dehydrogenase-like  24.43 
 
 
386 aa  106  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2555  putative acyl CooA deshydrogenase  24.26 
 
 
424 aa  106  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.580555 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2837  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.09 
 
 
399 aa  104  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4447  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  26.93 
 
 
398 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4184  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.86 
 
 
388 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1010  Acyl-CoA dehydrogenase  28.02 
 
 
405 aa  101  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5077  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.62 
 
 
399 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  0.184833 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1020  Acyl-CoA dehydrogenase-like  22.53 
 
 
361 aa  101  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000439336  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4707  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  27.76 
 
 
395 aa  100  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4200  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.37 
 
 
393 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.729166  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4295  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.12 
 
 
376 aa  97.4  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3809  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.56 
 
 
387 aa  96.3  8e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4780  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.84 
 
 
403 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>