219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1512 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1512  K+ potassium transporter  100 
 
 
634 aa  1257    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0101  K+ potassium transporter  61.43 
 
 
648 aa  738    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.185505  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2102  K+ potassium transporter  53.44 
 
 
630 aa  624  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1262  K potassium transporter  52.45 
 
 
643 aa  614  9.999999999999999e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0285347 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3513  Kup family low affinity potassium transporter  53.17 
 
 
640 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3932  K potassium transporter  51.36 
 
 
672 aa  597  1e-169  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0963001  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5357  K potassium transporter  51.36 
 
 
656 aa  594  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00124872  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0508  K potassium transporter  48.74 
 
 
632 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.845054  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3512  Kup family low affinity potassium transporter  52.72 
 
 
632 aa  585  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0444  K potassium transporter  49.76 
 
 
630 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0753432 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3417  K potassium transporter  51.03 
 
 
634 aa  581  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.120836  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5050  K potassium transporter  52.01 
 
 
657 aa  579  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992645 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2327  K potassium transporter  51.03 
 
 
658 aa  579  1e-164  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163546 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0551  K potassium transporter  48.97 
 
 
632 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.861026  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1643  K potassium transporter  50.64 
 
 
670 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1877  K potassium transporter  50.32 
 
 
668 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.119842  normal  0.0678898 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1596  K potassium transporter  50.32 
 
 
668 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.923122  normal  0.0938769 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3926  K potassium transporter  50.72 
 
 
641 aa  569  1e-161  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.147688 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2692  K+ potassium transporter  50.32 
 
 
634 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0189185  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0927  potassium uptake protein  50.39 
 
 
634 aa  566  1e-160  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.137865  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1811  K potassium transporter  48.73 
 
 
651 aa  565  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3923  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1497  K+ potassium transporter  51.59 
 
 
666 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4765  K potassium transporter  48.24 
 
 
652 aa  556  1e-157  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.266428 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6041  K potassium transporter  49.68 
 
 
633 aa  558  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420233  normal  0.917457 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1334  K+ potassium transporter  47.39 
 
 
636 aa  555  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.508351  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1238  K+ potassium transporter  51.36 
 
 
651 aa  553  1e-156  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.261795  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2528  K potassium transporter  47.43 
 
 
628 aa  553  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00494923  hitchhiker  0.0000000660434 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2222  K potassium transporter  51.68 
 
 
629 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.569984  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1608  KUP family K(+) transporter  47.43 
 
 
628 aa  555  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.191618 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1092  potassium uptake protein  48.03 
 
 
622 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0884975  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1339  potassium uptake protein  48.1 
 
 
651 aa  553  1e-156  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.0000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1383  potassium uptake protein  48.1 
 
 
651 aa  551  1e-155  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601106  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1331  potassium uptake protein  48.03 
 
 
630 aa  551  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00641911  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3556  K+ potassium transporter  47.4 
 
 
626 aa  551  1e-155  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2341  kup system potassium uptake protein  47.87 
 
 
660 aa  551  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.357755  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1537  K potassium transporter  49.21 
 
 
637 aa  548  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1820  potassium uptake protein  48.03 
 
 
630 aa  551  1e-155  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0076  potassium uptake protein  48.03 
 
 
630 aa  551  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.210813  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2175  potassium uptake protein  47.87 
 
 
630 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2213  potassium uptake protein  47.87 
 
 
630 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2247  potassium uptake protein  47.55 
 
 
660 aa  546  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438776  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1407  K potassium transporter  46.86 
 
 
628 aa  541  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.196511  decreased coverage  0.0000000731332 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1710  K potassium transporter  46.93 
 
 
637 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00353606  normal  0.989137 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6870  K potassium transporter  47.85 
 
 
633 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5100  K+ transporter  46.77 
 
 
638 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5940  K potassium transporter  47.32 
 
 
633 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0821691  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1737  K+ potassium transporter  46.71 
 
 
637 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2065  potassium uptake protein  48.33 
 
 
624 aa  537  1e-151  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5868  K potassium transporter  47.48 
 
 
633 aa  538  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1231  K+ potassium transporter  47.07 
 
 
656 aa  535  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0916765  normal  0.143534 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1512  K+ potassium transporter  48.18 
 
 
653 aa  537  1e-151  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312861  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1475  K potassium transporter  46.23 
 
 
638 aa  538  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.765149  normal  0.163846 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6370  K potassium transporter  47.68 
 
 
633 aa  535  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649313  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1823  K potassium transporter  45.98 
 
 
638 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0350815  normal  0.623135 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6280  K+ potassium transporter  45.98 
 
 
688 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1232  K potassium transporter  48.41 
 
 
636 aa  534  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1799  K+ potassium transporter  45.98 
 
 
638 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2061  K+ potassium transporter  47.65 
 
 
644 aa  531  1e-149  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.266591  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0179  K potassium transporter  48.25 
 
 
637 aa  531  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03631  potassium transporter  44.88 
 
 
622 aa  526  1e-148  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4220  potassium uptake protein  44.88 
 
 
622 aa  526  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0308  K potassium transporter  47.31 
 
 
637 aa  527  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.938116  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1621  potassium uptake transmembrane protein  46.54 
 
 
633 aa  525  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3963  potassium transport protein Kup  44.88 
 
 
622 aa  526  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4173  potassium transport protein Kup  44.88 
 
 
622 aa  525  1e-148  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03575  hypothetical protein  44.88 
 
 
622 aa  526  1e-148  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4247  potassium transport protein Kup  44.88 
 
 
622 aa  526  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4263  potassium transport protein Kup  44.88 
 
 
622 aa  526  1e-148  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.704108  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4115  potassium transport protein Kup  44.88 
 
 
622 aa  526  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.133962 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1463  K+ potassium transporter  45.45 
 
 
647 aa  528  1e-148  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.954899  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2350  potassium uptake protein, Kup system  47.01 
 
 
631 aa  525  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00598886  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4532  potassium transport protein Kup  45.04 
 
 
622 aa  523  1e-147  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.336747  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0201  K+ potassium transporter  44.62 
 
 
632 aa  523  1e-147  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5183  potassium transport protein Kup  44.72 
 
 
622 aa  523  1e-147  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100699  normal  0.594597 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4211  potassium transport protein Kup  45.37 
 
 
622 aa  523  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0006  potassium transport protein Kup  45.37 
 
 
622 aa  523  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0279816  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0572  K potassium transporter  46.14 
 
 
620 aa  520  1e-146  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4242  potassium transport protein Kup  44.72 
 
 
622 aa  522  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4179  potassium transport protein Kup  45.24 
 
 
622 aa  520  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.418392  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3258  K potassium transporter  44.65 
 
 
622 aa  521  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0402943  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2252  K potassium transporter  47.78 
 
 
633 aa  520  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3909  K+ potassium transporter  44.65 
 
 
622 aa  521  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000284388  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3125  K potassium transporter  45.54 
 
 
639 aa  515  1.0000000000000001e-145  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2565  K potassium transporter  48.4 
 
 
633 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1253  K+ potassium transporter  43.85 
 
 
622 aa  516  1.0000000000000001e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22459  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4117  potassium transport protein Kup  44.57 
 
 
622 aa  517  1.0000000000000001e-145  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0495643 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3979  potassium transport protein Kup  44.58 
 
 
622 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.356267  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0485  K+ potassium transporter  46.78 
 
 
630 aa  515  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4902  potassium transport protein Kup  45.05 
 
 
622 aa  513  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  hitchhiker  0.000280995 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3436  K potassium transporter  46.56 
 
 
620 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0006  potassium transport protein Kup  45.05 
 
 
622 aa  513  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0580063  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4541  K+ potassium transporter  44.58 
 
 
622 aa  510  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1598  K potassium transporter  45.28 
 
 
633 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.364539  normal  0.357667 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4107  potassium transport protein Kup  45.04 
 
 
622 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.382302  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2512  K+ potassium transporter  45.64 
 
 
620 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201429  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4213  potassium transport protein Kup  45.04 
 
 
622 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.681675  normal  0.819116 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1856  K+ potassium transporter  45.5 
 
 
620 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5996  K potassium transporter  44.76 
 
 
627 aa  506  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106648  hitchhiker  0.00272836 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4272  potassium transport protein Kup  45.04 
 
 
622 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.461844  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3454  Kup family low affinity potassium transporter  46.09 
 
 
611 aa  506  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.565497 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>