257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0217 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0217  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  100 
 
 		 349 aa  711    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2868  4Fe-4S cluster binding  71.63 
 
 		 350 aa  471  1e-132  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2899  putative iron-sulfur cluster binding protein  69.88 
 
 		 382 aa  430  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2290  hypothetical protein  61.88 
 
 		 347 aa  406  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.439481  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1143  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur cluster binding protein  61.63 
 
 		 348 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4944  hypothetical protein  60.83 
 
 		 374 aa  403  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2804  hypothetical protein  61.92 
 
 		 348 aa  401  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0957966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2806  hypothetical protein  62.54 
 
 		 347 aa  401  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.578108 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0200  hypothetical protein  60.47 
 
 		 383 aa  404  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2784  hypothetical protein  63.41 
 
 		 343 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3534  hypothetical protein  59.52 
 
 		 387 aa  400  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1337  hypothetical protein  56.66 
 
 		 393 aa  400  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3307  putative 4Fe-4S binding domain protein  63.93 
 
 		 344 aa  394  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.917643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4582  domain of unknown function DUF1730  57.77 
 
 		 385 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0279  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  58.5 
 
 		 375 aa  391  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0274  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  59.77 
 
 		 343 aa  391  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.097204 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  59.52 
 
 		 380 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0983  putative iron-sulfur cluster-binding protein  57.18 
 
 		 404 aa  388  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0440  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  58.94 
 
 		 388 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0043  domain of unknown function DUF1730  59.27 
 
 		 370 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1045  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  56.89 
 
 		 398 aa  385  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3314  iron-sulfur cluster binding protein  57.42 
 
 		 392 aa  387  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.117611  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0663  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  59.94 
 
 		 382 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.300921 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4319  domain of unknown function DUF1730  56.89 
 
 		 383 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3598  hypothetical protein  58.33 
 
 		 383 aa  386  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1809  hypothetical protein  58.81 
 
 		 385 aa  387  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.188281 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1141  domain of unknown function DUF1730  60.87 
 
 		 357 aa  380  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2662  domain of unknown function DUF1730  57.27 
 
 		 392 aa  372  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1342  hypothetical protein  64.33 
 
 		 353 aa  370  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.185892  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0340  iron-sulfur cluster binding protein  55.65 
 
 		 390 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0118  putative iron-sulfur cluster binding protein  57.23 
 
 		 372 aa  363  2e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.921505  normal  0.832944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2385  hypothetical protein  59.93 
 
 		 349 aa  362  4e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0221  hypothetical protein  66.43 
 
 		 325 aa  360  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2342  protein of unknown function DUF1730  59.49 
 
 		 356 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.932969 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5422  domain of unknown function DUF1730  54.41 
 
 		 389 aa  351  1e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.98716  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3132  hypothetical protein  58.06 
 
 		 363 aa  345  6e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3682  iron-sulfur cluster binding protein  56.19 
 
 		 366 aa  340  2e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.253797 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2673  tRNA pseudouridine synthase B  42 
 
 		 369 aa  275  7e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0891  4Fe-4S cluster binding protein  46.86 
 
 		 363 aa  273  3e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0619732  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3051  4Fe-4S cluster binding  43.73 
 
 		 354 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2758  iron-sulfur cluster binding protein  45.32 
 
 		 356 aa  273  4.0000000000000004e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.620502  normal  0.744246 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0672  putative iron-sulfur cluster binding protein  44.09 
 
 		 355 aa  271  2e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2530  4Fe-4S cluster binding  44.35 
 
 		 385 aa  268  1e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00414  iron-sulfur cluster binding protein, putative  42.69 
 
 		 355 aa  268  1e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210433  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0340  4Fe-4S cluster binding protein  44.38 
 
 		 368 aa  266  4e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246127  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0490  iron-sulfur cluster binding protein  43.77 
 
 		 380 aa  266  5e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1520  4Fe-4S ferredoxin protein  45 
 
 		 438 aa  266  5.999999999999999e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0107493  normal  0.24299 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3244  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.74 
 
 		 386 aa  262  6.999999999999999e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1317  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.28 
 
 		 357 aa  260  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.468365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2775  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.64 
 
 		 362 aa  261  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.886764  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5125  iron-sulfur cluster binding protein  43.06 
 
 		 351 aa  259  4e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0783629  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3972  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.69 
 
 		 397 aa  259  4e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1627  hypothetical protein  41.4 
 
 		 387 aa  259  4e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3461  iron-sulfur cluster binding protein  43.68 
 
 		 362 aa  258  8e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265251  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1302  iron-sulfur cluster binding protein, putative  43.94 
 
 		 373 aa  258  9e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3728  iron-sulfur cluster binding protein  44.3 
 
 		 379 aa  258  9e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0597  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.74 
 
 		 364 aa  258  1e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0425  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.98 
 
 		 379 aa  258  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000030316  hitchhiker  0.000000852685 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3034  domain of unknown function DUF1730  45.59 
 
 		 345 aa  256  3e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.125913  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3925  iron-sulfur cluster binding protein  44.3 
 
 		 379 aa  256  3e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00310532  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2853  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  44.12 
 
 		 343 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243694  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2940  domain of unknown function DUF1730  44.41 
 
 		 343 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.271755  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1713  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.77 
 
 		 348 aa  253  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1379  4Fe-4S cluster binding  41.28 
 
 		 355 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2625  iron-sulfur cluster-binding protein  44.51 
 
 		 385 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.913512 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002253  iron-sulfur cluster-binding protein  42.63 
 
 		 375 aa  252  6e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000253209  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0349  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.9 
 
 		 379 aa  252  7e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000159146  unclonable  0.00000283659 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4948  iron-sulfur cluster-binding protein  41.6 
 
 		 362 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0566  4Fe-4S cluster binding  41.6 
 
 		 362 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4182  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.79 
 
 		 360 aa  251  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327368  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00643  putative 4Fe-4S binding protein  42.44 
 
 		 380 aa  250  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4691  iron-sulfur cluster binding protein  40.86 
 
 		 354 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0985  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.22 
 
 		 361 aa  249  4e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.188512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2753  iron-sulfur cluster-binding protein  42.95 
 
 		 369 aa  249  5e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006724  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0517  4Fe-4S cluster binding  39.6 
 
 		 359 aa  249  7e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246101  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3301  4Fe-4S cluster binding  44.59 
 
 		 372 aa  248  9e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194025  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0900  iron-sulfur cluster binding protein  42.5 
 
 		 360 aa  247  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0486  iron-sulfur cluster binding protein  44.48 
 
 		 379 aa  247  3e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000360257  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00099  iron-sulfur cluster-binding protein  41.99 
 
 		 375 aa  246  4.9999999999999997e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04033  predicted Fe-S electron transport protein  38.95 
 
 		 379 aa  245  6.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000233876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3827  iron-sulfur cluster binding protein  38.95 
 
 		 379 aa  245  6.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294328  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4409  iron-sulfur cluster binding protein  38.95 
 
 		 379 aa  245  6.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.448649999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4697  iron-sulfur cluster binding protein  38.95 
 
 		 379 aa  245  6.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000309577  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3847  iron-sulfur cluster binding protein  38.95 
 
 		 379 aa  245  6.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000133072  hitchhiker  0.00000262117 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4723  iron-sulfur cluster binding protein  38.95 
 
 		 379 aa  245  6.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000626886  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03995  hypothetical protein  38.95 
 
 		 379 aa  245  6.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000106432  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3526  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.64 
 
 		 398 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0629  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.16 
 
 		 357 aa  245  9e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.619472 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0304  iron-sulfur cluster binding protein  44.76 
 
 		 326 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000115389  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2783  hypothetical protein  44.02 
 
 		 347 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2782  putative ferredoxin, 4Fe-4S binding protein  42.77 
 
 		 372 aa  245  9.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4952  iron-sulfur cluster binding protein  40.46 
 
 		 354 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.279227  normal  0.302526 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0669  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.85 
 
 		 395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0529  iron-sulfur cluster binding protein  43.26 
 
 		 379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.465139  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1030  iron-sulfur cluster binding protein  43.09 
 
 		 373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0665154  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1785  iron-sulfur cluster binding protein  46.62 
 
 		 366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.280211  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5682  iron-sulfur cluster binding protein  38.95 
 
 		 379 aa  243  3e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000046188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4637  iron-sulfur cluster binding protein  38.62 
 
 		 379 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000171021  normal  0.0426509 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4634  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.9 
 
 		 384 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000341327  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4624  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.9 
 
 		 384 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000999766  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>