More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1794 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1794  inner-membrane translocator  100 
 
 		 293 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385321  hitchhiker  0.00053204 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1804  inner-membrane translocator  94.88 
 
 		 293 aa  501  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.165252  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2582  inner-membrane translocator  67.47 
 
 		 291 aa  304  9.000000000000001e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.496751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2031  inner-membrane translocator  57 
 
 		 300 aa  273  2.0000000000000002e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3519  inner-membrane translocator  49.83 
 
 		 301 aa  267  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0058  inner-membrane translocator  50.54 
 
 		 295 aa  256  3e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.148316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3268  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  48.28 
 
 		 294 aa  255  5e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0104  inner-membrane translocator  48.28 
 
 		 294 aa  255  6e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.503861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0086  inner-membrane translocator  48.62 
 
 		 294 aa  255  6e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2969  inner-membrane translocator  48.28 
 
 		 320 aa  255  7e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968698  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0086  inner-membrane translocator  48.28 
 
 		 320 aa  255  7e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.285698  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3165  inner-membrane translocator  51.92 
 
 		 291 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3243  inner-membrane translocator  49.13 
 
 		 295 aa  253  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.577561  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0020  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  48.97 
 
 		 294 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1438  inner-membrane translocator  53.21 
 
 		 293 aa  252  5.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.683973 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3210  inner-membrane translocator  46.69 
 
 		 294 aa  252  6e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3536  inner-membrane translocator  46.69 
 
 		 294 aa  251  7e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0293486 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0088  inner-membrane translocator  47.93 
 
 		 294 aa  251  7e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0077  inner-membrane translocator  47.93 
 
 		 294 aa  251  7e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.981824  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4451  inner-membrane translocator  50.18 
 
 		 295 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0584854  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3757  putative branched-chain amino acid transport permease  48.92 
 
 		 295 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8052  inner-membrane translocator  50.18 
 
 		 293 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3758  putative ABC transporter, permease protein  51.9 
 
 		 287 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2331  inner-membrane translocator  50.87 
 
 		 291 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2937  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  47.93 
 
 		 287 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3912  inner-membrane translocator  48.62 
 
 		 294 aa  250  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2519  inner-membrane translocator  51.22 
 
 		 291 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.964633  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1675  inner-membrane translocator  51.79 
 
 		 291 aa  249  4e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3328  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  47.93 
 
 		 294 aa  248  8e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2996  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  47.75 
 
 		 294 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3374  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  47.75 
 
 		 294 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6434  inner-membrane translocator  48.56 
 
 		 295 aa  247  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.263735  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0197  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  47.75 
 
 		 294 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4063  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  47.75 
 
 		 294 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3989  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  47.75 
 
 		 294 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1606  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  47.75 
 
 		 294 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3341  transmembrane ABC transporter protein  46.34 
 
 		 313 aa  247  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3046  inner-membrane translocator  46.9 
 
 		 294 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0956  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  45.83 
 
 		 295 aa  239  5e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.824506  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4026  inner-membrane translocator  49.82 
 
 		 295 aa  238  9e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0897  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  45.83 
 
 		 295 aa  238  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  46.5 
 
 		 656 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3294  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  49.46 
 
 		 295 aa  236  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0420921  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3594  inner-membrane translocator  49.28 
 
 		 294 aa  236  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.577522 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3368  inner-membrane translocator  46.34 
 
 		 296 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3517  inner-membrane translocator  46.34 
 
 		 294 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2952  inner-membrane translocator  52.33 
 
 		 291 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0349553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1714  inner-membrane translocator  47.84 
 
 		 295 aa  231  8.000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0374994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3306  inner-membrane translocator  50 
 
 		 295 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.605647  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5954  inner-membrane translocator  46.69 
 
 		 295 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00927263  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0009  inner-membrane translocator  47.51 
 
 		 306 aa  224  2e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.978164  normal  0.0292693 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3780  inner-membrane translocator  48.55 
 
 		 294 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6726  inner-membrane translocator  47.64 
 
 		 295 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1399  inner-membrane translocator  44.79 
 
 		 295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.934196  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6268  inner-membrane translocator  47.48 
 
 		 294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.770597  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2867  inner-membrane translocator  48.56 
 
 		 295 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5820  inner-membrane translocator  47.64 
 
 		 295 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908719  normal  0.153687 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2931  inner-membrane translocator  50.72 
 
 		 295 aa  219  5e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3530  inner-membrane translocator  51.44 
 
 		 294 aa  217  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.902092  normal  0.626427 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1378  inner-membrane translocator  47.67 
 
 		 293 aa  216  5e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3289  hypothetical protein  47.84 
 
 		 295 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0960576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.9 
 
 		 290 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4078  inner-membrane translocator  51.08 
 
 		 294 aa  209  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  44.21 
 
 		 299 aa  208  7e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1676  inner-membrane translocator  51.72 
 
 		 287 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1078  inner-membrane translocator  50 
 
 		 294 aa  203  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0299849  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1449  inner-membrane translocator  44.52 
 
 		 296 aa  202  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268141  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1287  inner-membrane translocator  44.52 
 
 		 296 aa  202  5e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  40.7 
 
 		 652 aa  201  9e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3459  inner-membrane translocator  43.6 
 
 		 286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0548  inner-membrane translocator  46.67 
 
 		 296 aa  198  9e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2705  inner-membrane translocator  42.46 
 
 		 289 aa  196  5.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0009  inner-membrane translocator  45.32 
 
 		 294 aa  195  7e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.30949  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3484  inner-membrane translocator  46.04 
 
 		 291 aa  195  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282429  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1582  inner-membrane translocator  44.1 
 
 		 286 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2713  inner-membrane translocator  41.9 
 
 		 283 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000181558  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0664  inner-membrane translocator  42.81 
 
 		 286 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3557  inner-membrane translocator  44.88 
 
 		 296 aa  193  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.212819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2024  inner-membrane translocator  42.86 
 
 		 296 aa  193  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3118  inner-membrane translocator  45.32 
 
 		 294 aa  192  6e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4182  inner-membrane translocator  43.4 
 
 		 289 aa  192  8e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5161  inner-membrane translocator  46.21 
 
 		 294 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.143386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0429  inner-membrane translocator  41.05 
 
 		 293 aa  190  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.220728 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3211  inner-membrane translocator  40.48 
 
 		 285 aa  190  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.64226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4476  branched-chain amino acid ABC transporter permease  41.67 
 
 		 285 aa  189  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.903087  normal  0.0213123 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2464  inner-membrane translocator  45.99 
 
 		 294 aa  188  9e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.707029  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0618  inner-membrane translocator  42.46 
 
 		 286 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6024  inner-membrane translocator  43.25 
 
 		 286 aa  185  7e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0658  inner-membrane translocator  42.46 
 
 		 286 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal  0.0364428 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2138  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  52.26 
 
 		 288 aa  185  8e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1819  inner-membrane translocator  52.26 
 
 		 288 aa  185  8e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4644  inner-membrane translocator  41.34 
 
 		 291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.706844  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3697  inner-membrane translocator  40.99 
 
 		 291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1051  inner-membrane translocator  38.33 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4076  inner-membrane translocator  45.68 
 
 		 294 aa  182  8.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4271  inner-membrane translocator  44.52 
 
 		 314 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4661  inner-membrane translocator  40.99 
 
 		 290 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4370  inner-membrane translocator  39.58 
 
 		 290 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3459  inner-membrane translocator  37.63 
 
 		 289 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.411869  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2900  inner-membrane translocator  42.81 
 
 		 291 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>