103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1611 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1622  2-nitropropane dioxygenase, NPD  86.97 
 
 
487 aa  828    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1611  2-nitropropane dioxygenase NPD  100 
 
 
485 aa  961    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0274193 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5685  2-nitropropane dioxygenase, NPD  62.39 
 
 
476 aa  549  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3653  2-nitropropane dioxygenase, NPD  60.52 
 
 
472 aa  501  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.042009  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0849  2-nitropropane dioxygenase, NPD  55.58 
 
 
505 aa  476  1e-133  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.183629  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1713  2-nitropropane dioxygenase, NPD  50.64 
 
 
475 aa  474  1e-132  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000796531  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0981  2-nitropropane dioxygenase, NPD  53.18 
 
 
472 aa  473  1e-132  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.011325 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2635  putative 2-nitropropane dioxygenase  49.59 
 
 
491 aa  464  1e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4298  2-nitropropane dioxygenase, NPD  49.68 
 
 
481 aa  459  9.999999999999999e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.15389  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1446  putative 2-nitropropane dioxygenase  50.75 
 
 
486 aa  393  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00192568  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50353  predicted protein  41.76 
 
 
553 aa  378  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0091  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.1 
 
 
382 aa  80.1  0.00000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1249  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  23.65 
 
 
355 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0721  2-nitropropane dioxygenase, NPD  24.23 
 
 
363 aa  63.9  0.000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.214896  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1681  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.2 
 
 
396 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1676  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.94 
 
 
396 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0582286  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3641  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.06 
 
 
386 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3317  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.31 
 
 
382 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2272  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  25.39 
 
 
424 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.189277  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1283  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.73 
 
 
396 aa  62  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.756319 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0114  hypothetical protein  24.69 
 
 
402 aa  60.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.782574 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2188  putative 2-nitropropane dioxygenase  27.25 
 
 
433 aa  60.8  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000766761 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0756  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.8 
 
 
361 aa  60.8  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0405  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.07 
 
 
376 aa  60.5  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0406  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.53 
 
 
357 aa  60.5  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.25833  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1164  2-nitropropane dioxygenase, NPD  25.44 
 
 
373 aa  60.1  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.121776  normal  0.303682 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6322  2-nitropropane dioxygenase, NPD  26.17 
 
 
396 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1757  2-nitropropane dioxygenase, NPD  26.17 
 
 
396 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0670  2-nitropropane dioxygenase NPD  21.99 
 
 
421 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5053  2-nitropropane dioxygenase, NPD  26.42 
 
 
396 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1506  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.19 
 
 
396 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.186362 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1025  2-nitropropane dioxygenase NPD  21.75 
 
 
366 aa  57.4  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1770  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.17 
 
 
396 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.763797 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1158  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.23 
 
 
357 aa  57.4  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0552766 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0610  2-nitropropane dioxygenase NPD  22.07 
 
 
417 aa  57  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2182  putative dioxygenase related to 2-nitropropane dioxygenase  24.26 
 
 
414 aa  56.2  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000148707  unclonable  0.000000279866 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2873  2-nitropropane dioxygenase, NPD  24.38 
 
 
415 aa  55.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1586  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  23.69 
 
 
373 aa  55.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.385159  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2083  2-nitropropane dioxygenase, NPD  23.26 
 
 
393 aa  55.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.683958 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1061  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  22.22 
 
 
355 aa  55.5  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.992497  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2248  2-nitropropane dioxygenase NPD  24.32 
 
 
360 aa  55.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.69113  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0188  hypothetical protein  23.19 
 
 
417 aa  54.7  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0706904  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0485  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  24.72 
 
 
365 aa  55.1  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5565  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.89 
 
 
405 aa  55.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286036  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0766  2-nitropropane dioxygenase NPD  24.19 
 
 
373 aa  54.3  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0843777 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1305  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  25.95 
 
 
396 aa  53.9  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.302592  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0103  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  25.95 
 
 
396 aa  53.9  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2128  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  25.85 
 
 
396 aa  53.9  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.364934  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2183  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  25.95 
 
 
396 aa  53.9  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1062  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  25.95 
 
 
396 aa  53.9  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1055  2-nitropropane dioxygenase, NPD  24.02 
 
 
361 aa  53.9  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.455716  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1792  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  25.95 
 
 
396 aa  53.9  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.34549  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5061  2-nitropropane dioxygenase, NPD  23.33 
 
 
415 aa  53.5  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.877356  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0649  2-nitropropane dioxygenase NPD  24.01 
 
 
365 aa  53.5  0.000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2314  2-nitropropane dioxygenase  25.13 
 
 
396 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0626  2-nitropropane dioxygenase, NPD  23 
 
 
419 aa  53.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1286  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  23.4 
 
 
363 aa  53.1  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000131785  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2314  2-nitropropane dioxygenase NPD  24.78 
 
 
396 aa  53.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.16521 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0619  oxidoreductase (2-nitropropane dioxygenase family)  22.97 
 
 
366 aa  52.8  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1406  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  23.94 
 
 
363 aa  52  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  unclonable  0.00324657  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0779  2-nitropropane dioxygenase NPD  22.61 
 
 
418 aa  52.4  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1584  2-nitropropane dioxygenase, NPD  25.83 
 
 
375 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610651  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0500  hypothetical protein  23.9 
 
 
419 aa  52  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.546917 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1945  putative 2-nitropropane dioxygenase  25.3 
 
 
396 aa  51.6  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00553543  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0455  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  23.4 
 
 
363 aa  51.2  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000000961366  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1279  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  24.12 
 
 
363 aa  51.2  0.00005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0434534  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2755  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.64 
 
 
359 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0669905  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0498  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  24.76 
 
 
363 aa  50.8  0.00006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.142021  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1939  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.66 
 
 
419 aa  50.4  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4714  putative 2-nitropropane dioxygenase  34.68 
 
 
358 aa  50.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1140  hypothetical protein  28.66 
 
 
355 aa  50.1  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1135  hypothetical protein  28.95 
 
 
350 aa  50.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3113  2-nitropropane dioxygenase NPD  21.6 
 
 
352 aa  49.7  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1851  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.25 
 
 
373 aa  50.1  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000135103  normal  0.816566 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0006  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.72 
 
 
332 aa  49.3  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4565  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.55 
 
 
381 aa  48.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.190968 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1210  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  25 
 
 
370 aa  48.1  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3371  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.58 
 
 
354 aa  48.1  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.940632  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1184  2-nitropropane dioxygenase NPD  22.99 
 
 
414 aa  47.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1878  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.33 
 
 
361 aa  47.8  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.842086 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0152  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.38 
 
 
345 aa  47  0.0007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.174988  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1940  2-nitropropane dioxygenase, NPD  26.26 
 
 
348 aa  47  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0127053 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0974  trans-2-enoyl-ACP reductase II  30.36 
 
 
348 aa  46.2  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1538  2-nitropropane dioxygenase, NPD  22.13 
 
 
414 aa  46.2  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3888  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.64 
 
 
349 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6745  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.29 
 
 
367 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.566568 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0977  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.21 
 
 
380 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.652012  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0445  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.64 
 
 
349 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3542  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.25 
 
 
361 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0130805 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4381  2-nitropropane dioxygenase NPD  22.7 
 
 
417 aa  45.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231487 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  31.86 
 
 
316 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3814  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.64 
 
 
349 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1334  2-nitropropane dioxygenase, NPD  22.25 
 
 
414 aa  44.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.413147  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4010  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.34 
 
 
349 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0038  2-nitropropane dioxygenase, NPD  25.58 
 
 
352 aa  44.3  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3672  2-nitropropane dioxygenase  29.41 
 
 
311 aa  43.9  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2734  putative oxidoreductase protein  31.19 
 
 
348 aa  43.9  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0271  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.86 
 
 
365 aa  44.3  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0474  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.69 
 
 
353 aa  43.9  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.71 
 
 
353 aa  43.5  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.138776 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>