239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_2183 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_1506  2-nitropropane dioxygenase NPD  82.32 
 
 		 396 aa  661    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.186362 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1305  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  100 
 
 		 396 aa  797    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.302592  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2314  2-nitropropane dioxygenase  99.75 
 
 		 396 aa  795    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5053  2-nitropropane dioxygenase, NPD  84.09 
 
 		 396 aa  681    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2272  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  94.44 
 
 		 424 aa  756    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.189277  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1770  2-nitropropane dioxygenase NPD  82.83 
 
 		 396 aa  675    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.763797 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2183  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  100 
 
 		 396 aa  797    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6322  2-nitropropane dioxygenase, NPD  82.32 
 
 		 396 aa  671    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1283  2-nitropropane dioxygenase NPD  80 
 
 		 396 aa  641    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.756319 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1676  2-nitropropane dioxygenase NPD  84.09 
 
 		 396 aa  681    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0582286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1681  2-nitropropane dioxygenase, NPD  83.08 
 
 		 396 aa  675    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1757  2-nitropropane dioxygenase, NPD  82.58 
 
 		 396 aa  674    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2314  2-nitropropane dioxygenase NPD  79.75 
 
 		 396 aa  635    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.16521 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2128  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  99.75 
 
 		 396 aa  796    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.364934  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1062  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  100 
 
 		 396 aa  797    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1792  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  99.75 
 
 		 396 aa  794    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.34549  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0103  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  100 
 
 		 396 aa  797    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1945  putative 2-nitropropane dioxygenase  78.73 
 
 		 396 aa  626  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00553543  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0622  hypothetical protein  62.33 
 
 		 405 aa  474  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2751  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  62.33 
 
 		 405 aa  474  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.76383  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0114  hypothetical protein  64.61 
 
 		 402 aa  474  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.782574 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3317  2-nitropropane dioxygenase NPD  64.27 
 
 		 382 aa  474  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2815  2-nitropropane dioxygenase  62.73 
 
 		 392 aa  471  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2694  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  62.07 
 
 		 414 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1705  2-nitropropane dioxygenase  62.33 
 
 		 438 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.137412  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3641  2-nitropropane dioxygenase NPD  62.92 
 
 		 386 aa  474  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2391  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  62.33 
 
 		 414 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2896  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  62.33 
 
 		 414 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.369795  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5061  2-nitropropane dioxygenase, NPD  63.56 
 
 		 415 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.877356  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2083  2-nitropropane dioxygenase, NPD  63.03 
 
 		 393 aa  465  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.683958 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2188  putative 2-nitropropane dioxygenase  64 
 
 		 433 aa  462  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000766761 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1803  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  61.93 
 
 		 392 aa  464  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5565  2-nitropropane dioxygenase NPD  55.5 
 
 		 405 aa  393  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286036  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2347  2-nitropropane dioxygenase NPD  54.76 
 
 		 393 aa  386  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6039  hitchhiker  0.000000126588 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4589  2-nitropropane dioxygenase, NPD  55.35 
 
 		 422 aa  384  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0091  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.78 
 
 		 382 aa  239  9e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0006  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.15 
 
 		 332 aa  207  2e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0649  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.7 
 
 		 365 aa  204  1e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0405  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.61 
 
 		 376 aa  203  4e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3113  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.2 
 
 		 352 aa  200  3.9999999999999996e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1025  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.79 
 
 		 366 aa  197  3e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2248  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.34 
 
 		 360 aa  195  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.69113  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1210  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  36.29 
 
 		 370 aa  192  8e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1158  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.7 
 
 		 357 aa  192  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0552766 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0721  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.85 
 
 		 363 aa  191  2e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.214896  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3148  2-nitropropane dioxygenase-like dioxygenase  35.99 
 
 		 369 aa  189  7e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0185089  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0485  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  34.55 
 
 		 365 aa  189  8e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1586  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  34.5 
 
 		 373 aa  188  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.385159  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2985  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.57 
 
 		 364 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0619  oxidoreductase (2-nitropropane dioxygenase family)  34.41 
 
 		 366 aa  186  4e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1584  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.76 
 
 		 375 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1164  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.29 
 
 		 373 aa  183  6e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.121776  normal  0.303682 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0756  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.79 
 
 		 361 aa  182  9.000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0498  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  35.52 
 
 		 363 aa  182  1e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.142021  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1061  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  33.52 
 
 		 355 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.992497  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0455  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  33.42 
 
 		 363 aa  181  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000000961366  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0406  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.78 
 
 		 357 aa  181  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.25833  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0358  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.69 
 
 		 353 aa  180  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2940  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.48 
 
 		 363 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1406  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  33.42 
 
 		 363 aa  179  7e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  unclonable  0.00324657  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1293  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.34 
 
 		 361 aa  179  7e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000110305  hitchhiker  0.00000426168 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1279  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  34.32 
 
 		 363 aa  179  9e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0434534  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1249  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  34.07 
 
 		 355 aa  178  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0766  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.25 
 
 		 373 aa  178  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0843777 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1286  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  33.42 
 
 		 363 aa  179  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000131785  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1344  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.22 
 
 		 363 aa  177  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.865033  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3007  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.09 
 
 		 379 aa  172  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0038  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.65 
 
 		 352 aa  171  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1877  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  35.57 
 
 		 360 aa  168  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117521  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1055  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.15 
 
 		 361 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.455716  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0977  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.69 
 
 		 380 aa  159  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.652012  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3736  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.44 
 
 		 339 aa  156  7e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040511 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1851  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.08 
 
 		 373 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000135103  normal  0.816566 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3815  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.84 
 
 		 314 aa  124  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2873  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.44 
 
 		 415 aa  114  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1184  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.26 
 
 		 414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0500  hypothetical protein  30.99 
 
 		 419 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.546917 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0779  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.89 
 
 		 418 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1939  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.25 
 
 		 419 aa  109  9.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2182  putative dioxygenase related to 2-nitropropane dioxygenase  31.94 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000148707  unclonable  0.000000279866 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0188  hypothetical protein  29.87 
 
 		 417 aa  105  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0706904  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0670  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.89 
 
 		 421 aa  104  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0626  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.56 
 
 		 419 aa  104  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4381  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.12 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231487 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1854  hypothetical protein  25.98 
 
 		 316 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0198092  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1538  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.24 
 
 		 414 aa  101  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0610  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.94 
 
 		 417 aa  100  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0274  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.38 
 
 		 391 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0253  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.15 
 
 		 391 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0263  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.56 
 
 		 391 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0774  hypothetical protein  27.69 
 
 		 467 aa  94  5e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1334  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.9 
 
 		 414 aa  90.1  7e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.413147  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2913  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.49 
 
 		 315 aa  89.7  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000125004  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0237  hypothetical protein  26.85 
 
 		 467 aa  89.4  9e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0189  hypothetical protein  28.8 
 
 		 465 aa  88.6  2e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0274  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.34 
 
 		 390 aa  86.3  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302467 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0282  2-nitropropane dioxygenase, NPD  26.52 
 
 		 315 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0713522  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0776  2-nitropropane dioxygenase, NPD  26.49 
 
 		 467 aa  83.6  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2312  2-nitropropane dioxygenase, NPD  25.83 
 
 		 469 aa  81.3  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.241055  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1243  2-nitropropane dioxygenase, NPD  25.42 
 
 		 467 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.317364 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>