89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0849 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0849  2-nitropropane dioxygenase, NPD  100 
 
 
505 aa  984    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.183629  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3653  2-nitropropane dioxygenase, NPD  62.69 
 
 
472 aa  546  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.042009  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5685  2-nitropropane dioxygenase, NPD  58.99 
 
 
476 aa  534  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1713  2-nitropropane dioxygenase, NPD  51.28 
 
 
475 aa  489  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000796531  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1611  2-nitropropane dioxygenase NPD  55.2 
 
 
485 aa  485  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0274193 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1622  2-nitropropane dioxygenase, NPD  53.62 
 
 
487 aa  482  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2635  putative 2-nitropropane dioxygenase  53.05 
 
 
491 aa  475  1e-133  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0981  2-nitropropane dioxygenase, NPD  52.24 
 
 
472 aa  467  9.999999999999999e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.011325 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4298  2-nitropropane dioxygenase, NPD  50.11 
 
 
481 aa  457  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.15389  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50353  predicted protein  44.62 
 
 
553 aa  409  1e-113  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1446  putative 2-nitropropane dioxygenase  48.72 
 
 
486 aa  392  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00192568  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1164  2-nitropropane dioxygenase, NPD  25.35 
 
 
373 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.121776  normal  0.303682 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0405  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.21 
 
 
376 aa  63.5  0.000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1055  2-nitropropane dioxygenase, NPD  22.04 
 
 
361 aa  62.4  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.455716  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0619  oxidoreductase (2-nitropropane dioxygenase family)  22.16 
 
 
366 aa  62  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2272  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  25.97 
 
 
424 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.189277  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1676  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.17 
 
 
396 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0582286  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0610  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.69 
 
 
417 aa  59.3  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0188  hypothetical protein  22.88 
 
 
417 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0706904  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1792  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  26.82 
 
 
396 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.34549  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2183  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  26.82 
 
 
396 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1062  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  26.82 
 
 
396 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1305  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  26.82 
 
 
396 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.302592  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1770  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.17 
 
 
396 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.763797 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0766  2-nitropropane dioxygenase NPD  24.79 
 
 
373 aa  58.2  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0843777 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0103  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  26.82 
 
 
396 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2128  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  26.82 
 
 
396 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.364934  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5053  2-nitropropane dioxygenase, NPD  26.45 
 
 
396 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6322  2-nitropropane dioxygenase, NPD  26.45 
 
 
396 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0756  2-nitropropane dioxygenase NPD  24.14 
 
 
361 aa  57.4  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1757  2-nitropropane dioxygenase, NPD  26.45 
 
 
396 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1249  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  22.33 
 
 
355 aa  57.4  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1681  2-nitropropane dioxygenase, NPD  26.92 
 
 
396 aa  57  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0455  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  22.83 
 
 
363 aa  57  0.0000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000000961366  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1406  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  22.61 
 
 
363 aa  56.6  0.0000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  unclonable  0.00324657  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2314  2-nitropropane dioxygenase  26.54 
 
 
396 aa  57  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1061  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  22.01 
 
 
355 aa  55.8  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.992497  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1283  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.13 
 
 
396 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.756319 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0670  2-nitropropane dioxygenase NPD  21.98 
 
 
421 aa  55.1  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0500  hypothetical protein  24.33 
 
 
419 aa  55.1  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.546917 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1286  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  22.54 
 
 
363 aa  54.7  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000131785  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0406  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.46 
 
 
357 aa  54.7  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.25833  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1586  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  24.86 
 
 
373 aa  54.3  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.385159  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3113  2-nitropropane dioxygenase NPD  21.39 
 
 
352 aa  54.7  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1851  2-nitropropane dioxygenase NPD  24.72 
 
 
373 aa  54.3  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000135103  normal  0.816566 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0091  2-nitropropane dioxygenase NPD  22.99 
 
 
382 aa  53.9  0.000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1506  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.37 
 
 
396 aa  53.9  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.186362 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0498  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  21.21 
 
 
363 aa  53.9  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.142021  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0779  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.7 
 
 
418 aa  53.9  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2873  2-nitropropane dioxygenase, NPD  24.29 
 
 
415 aa  53.5  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4504  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.84 
 
 
338 aa  53.5  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.372283  normal  0.089603 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4381  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.28 
 
 
417 aa  52.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231487 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0721  2-nitropropane dioxygenase, NPD  23.89 
 
 
363 aa  52.8  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.214896  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1279  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  20.99 
 
 
363 aa  53.1  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0434534  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5565  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.53 
 
 
405 aa  52.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286036  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1945  putative 2-nitropropane dioxygenase  26.12 
 
 
396 aa  52.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00553543  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2248  2-nitropropane dioxygenase NPD  24.14 
 
 
360 aa  51.6  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.69113  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3306  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.97 
 
 
342 aa  51.6  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.152065  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0649  2-nitropropane dioxygenase NPD  21.22 
 
 
365 aa  51.6  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0626  2-nitropropane dioxygenase, NPD  21.89 
 
 
419 aa  51.6  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.33 
 
 
334 aa  50.8  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1009  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.22 
 
 
345 aa  50.4  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0114  hypothetical protein  25.99 
 
 
402 aa  50.4  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.782574 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0974  trans-2-enoyl-ACP reductase II  34.07 
 
 
348 aa  50.4  0.00008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1210  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  22.19 
 
 
370 aa  49.7  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2314  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.75 
 
 
396 aa  50.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.16521 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1158  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.52 
 
 
357 aa  49.3  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0552766 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3317  2-nitropropane dioxygenase NPD  22.32 
 
 
382 aa  48.9  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0152  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.48 
 
 
345 aa  48.9  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.174988  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1538  2-nitropropane dioxygenase, NPD  24.23 
 
 
414 aa  48.5  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0544  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  28.77 
 
 
326 aa  48.1  0.0004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0006  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.15 
 
 
332 aa  47.4  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3641  2-nitropropane dioxygenase NPD  22.32 
 
 
386 aa  47  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1939  2-nitropropane dioxygenase NPD  22.35 
 
 
419 aa  47  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1184  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.83 
 
 
414 aa  46.6  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0133  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.33 
 
 
352 aa  46.2  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.899957  normal  0.134277 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2182  putative dioxygenase related to 2-nitropropane dioxygenase  23.43 
 
 
414 aa  46.2  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000148707  unclonable  0.000000279866 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0084  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.89 
 
 
343 aa  46.6  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00133989  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0977  2-nitropropane dioxygenase NPD  24.8 
 
 
380 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.652012  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0098  hypothetical protein  38.89 
 
 
343 aa  46.6  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2083  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.34 
 
 
393 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.683958 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1334  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.38 
 
 
414 aa  45.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.413147  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1878  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.33 
 
 
361 aa  45.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.842086 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0744  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.46 
 
 
354 aa  44.3  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2985  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.38 
 
 
364 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565895  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1170  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  32.14 
 
 
342 aa  43.9  0.007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21331  thiazole synthase  34.04 
 
 
268 aa  43.9  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1262  thiazole synthase  34.04 
 
 
268 aa  43.5  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3815  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.94 
 
 
314 aa  43.5  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146369  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>