262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1757 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_2183  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  82.58 
 
 
396 aa  674    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1305  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  82.58 
 
 
396 aa  674    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.302592  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2128  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  82.32 
 
 
396 aa  673    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.364934  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2314  2-nitropropane dioxygenase  82.58 
 
 
396 aa  675    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2314  2-nitropropane dioxygenase NPD  80.25 
 
 
396 aa  645    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.16521 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5053  2-nitropropane dioxygenase, NPD  96.97 
 
 
396 aa  771    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2272  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  81.57 
 
 
424 aa  660    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.189277  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1283  2-nitropropane dioxygenase NPD  82.78 
 
 
396 aa  657    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.756319 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1062  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  82.58 
 
 
396 aa  674    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1945  putative 2-nitropropane dioxygenase  80.26 
 
 
396 aa  637    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00553543  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1676  2-nitropropane dioxygenase NPD  94.7 
 
 
396 aa  756    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0582286  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1770  2-nitropropane dioxygenase NPD  98.74 
 
 
396 aa  785    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.763797 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6322  2-nitropropane dioxygenase, NPD  99.75 
 
 
396 aa  790    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1681  2-nitropropane dioxygenase, NPD  95.2 
 
 
396 aa  759    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1792  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  82.32 
 
 
396 aa  671    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.34549  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1757  2-nitropropane dioxygenase, NPD  100 
 
 
396 aa  793    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1506  2-nitropropane dioxygenase NPD  91.16 
 
 
396 aa  728    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.186362 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0103  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  82.58 
 
 
396 aa  674    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0114  hypothetical protein  64.89 
 
 
402 aa  479  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.782574 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2694  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  62.2 
 
 
414 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1705  2-nitropropane dioxygenase  62.2 
 
 
438 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.137412  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0622  hypothetical protein  62.2 
 
 
405 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2751  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  62.2 
 
 
405 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.76383  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2391  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  62.2 
 
 
414 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2896  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  62.2 
 
 
414 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.369795  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5061  2-nitropropane dioxygenase, NPD  64.71 
 
 
415 aa  473  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.877356  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2188  putative 2-nitropropane dioxygenase  65.81 
 
 
433 aa  472  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000766761 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2083  2-nitropropane dioxygenase, NPD  63.9 
 
 
393 aa  471  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.683958 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2815  2-nitropropane dioxygenase  62.8 
 
 
392 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3641  2-nitropropane dioxygenase NPD  63.19 
 
 
386 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3317  2-nitropropane dioxygenase NPD  64.44 
 
 
382 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1803  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  61.73 
 
 
392 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5565  2-nitropropane dioxygenase NPD  56.43 
 
 
405 aa  392  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286036  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4589  2-nitropropane dioxygenase, NPD  57.14 
 
 
422 aa  388  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2347  2-nitropropane dioxygenase NPD  54.5 
 
 
393 aa  383  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6039  hitchhiker  0.000000126588 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0091  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.1 
 
 
382 aa  230  3e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0006  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.18 
 
 
332 aa  216  7e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0649  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.13 
 
 
365 aa  199  5e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0721  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.95 
 
 
363 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.214896  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0405  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.34 
 
 
376 aa  195  1e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1025  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.07 
 
 
366 aa  194  3e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1586  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  35.94 
 
 
373 aa  192  6e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.385159  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2985  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.27 
 
 
364 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565895  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3113  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.99 
 
 
352 aa  191  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2248  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.48 
 
 
360 aa  192  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.69113  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1061  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  33.42 
 
 
355 aa  187  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.992497  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3148  2-nitropropane dioxygenase-like dioxygenase  37.87 
 
 
369 aa  187  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0185089  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1158  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.16 
 
 
357 aa  186  8e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0552766 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1877  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  36.95 
 
 
360 aa  184  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117521  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0406  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.78 
 
 
357 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.25833  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1249  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  34.31 
 
 
355 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1210  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  34.32 
 
 
370 aa  183  5.0000000000000004e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1293  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.05 
 
 
361 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000110305  hitchhiker  0.00000426168 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0485  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  33.33 
 
 
365 aa  182  1e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3007  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.5 
 
 
379 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1279  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  33.33 
 
 
363 aa  178  1e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0434534  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0756  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.15 
 
 
361 aa  178  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0358  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.3 
 
 
353 aa  178  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0038  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.63 
 
 
352 aa  177  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0619  oxidoreductase (2-nitropropane dioxygenase family)  33.85 
 
 
366 aa  177  4e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0766  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.42 
 
 
373 aa  176  8e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0843777 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2940  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.76 
 
 
363 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1164  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.68 
 
 
373 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.121776  normal  0.303682 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1344  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.76 
 
 
363 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.865033  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1055  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.07 
 
 
361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.455716  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1584  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.05 
 
 
375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610651  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0498  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  34.04 
 
 
363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.142021  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0455  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  33.42 
 
 
363 aa  174  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000000961366  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1406  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  33.42 
 
 
363 aa  172  9e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  unclonable  0.00324657  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1286  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  33.42 
 
 
363 aa  172  9e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000131785  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0977  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.64 
 
 
380 aa  166  9e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.652012  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3736  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.35 
 
 
339 aa  160  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040511 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1851  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.88 
 
 
373 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000135103  normal  0.816566 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3815  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.36 
 
 
314 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2873  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.67 
 
 
415 aa  123  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0626  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.7 
 
 
419 aa  121  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0779  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.57 
 
 
418 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1184  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.9 
 
 
414 aa  113  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1939  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.82 
 
 
419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4381  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.55 
 
 
417 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231487 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0274  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.81 
 
 
391 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0253  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.73 
 
 
391 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1538  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.43 
 
 
414 aa  109  7.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0263  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.81 
 
 
391 aa  109  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0500  hypothetical protein  30.48 
 
 
419 aa  109  9.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.546917 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2182  putative dioxygenase related to 2-nitropropane dioxygenase  32.58 
 
 
414 aa  108  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000148707  unclonable  0.000000279866 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1854  hypothetical protein  26.67 
 
 
316 aa  108  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0198092  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0188  hypothetical protein  31.23 
 
 
417 aa  108  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0706904  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0670  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.02 
 
 
421 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0610  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.45 
 
 
417 aa  99.8  7e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0274  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.66 
 
 
390 aa  97.4  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.302467 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1334  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.49 
 
 
414 aa  93.6  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.413147  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2913  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.2 
 
 
315 aa  92  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000125004  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0282  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.96 
 
 
315 aa  91.7  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0713522  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0774  hypothetical protein  26.5 
 
 
467 aa  89  1e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0237  hypothetical protein  25.68 
 
 
467 aa  87.8  3e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0189  hypothetical protein  27.18 
 
 
465 aa  87.4  4e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0776  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.74 
 
 
467 aa  86.7  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0183  hypothetical protein  26.55 
 
 
453 aa  84.3  0.000000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2312  2-nitropropane dioxygenase, NPD  26.21 
 
 
469 aa  84.7  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.241055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>