More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1851 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1851  2-nitropropane dioxygenase NPD  100 
 
 
373 aa  764    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000135103  normal  0.816566 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2248  2-nitropropane dioxygenase NPD  61.25 
 
 
360 aa  450  1e-125  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.69113  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0977  2-nitropropane dioxygenase NPD  57.97 
 
 
380 aa  436  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.652012  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0766  2-nitropropane dioxygenase NPD  56.47 
 
 
373 aa  433  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0843777 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1164  2-nitropropane dioxygenase, NPD  55.92 
 
 
373 aa  431  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.121776  normal  0.303682 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0406  2-nitropropane dioxygenase NPD  55.18 
 
 
357 aa  422  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.25833  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1586  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  54.95 
 
 
373 aa  424  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.385159  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1055  2-nitropropane dioxygenase, NPD  57.78 
 
 
361 aa  424  1e-117  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.455716  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1025  2-nitropropane dioxygenase NPD  50 
 
 
366 aa  363  3e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1158  2-nitropropane dioxygenase NPD  45.66 
 
 
357 aa  336  3.9999999999999995e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0552766 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1061  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  45.79 
 
 
355 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.992497  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1249  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  45.51 
 
 
355 aa  320  3e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2985  2-nitropropane dioxygenase NPD  48.64 
 
 
364 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565895  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3113  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.6 
 
 
352 aa  285  7e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0405  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.6 
 
 
376 aa  273  5.000000000000001e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0649  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.87 
 
 
365 aa  264  1e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1877  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  42.78 
 
 
360 aa  259  4e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117521  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0358  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.3 
 
 
353 aa  258  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1293  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.29 
 
 
361 aa  256  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000110305  hitchhiker  0.00000426168 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0721  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.78 
 
 
363 aa  256  6e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.214896  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0485  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  41.35 
 
 
365 aa  255  7e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1286  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  41.92 
 
 
363 aa  253  4.0000000000000004e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000131785  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0455  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  41.64 
 
 
363 aa  251  1e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000000961366  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1210  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  40.98 
 
 
370 aa  251  2e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1406  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  41.37 
 
 
363 aa  249  6e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  unclonable  0.00324657  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3007  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.71 
 
 
379 aa  248  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0619  oxidoreductase (2-nitropropane dioxygenase family)  38.27 
 
 
366 aa  247  2e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2940  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.65 
 
 
363 aa  246  6e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0498  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  40.33 
 
 
363 aa  246  6e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.142021  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0756  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.02 
 
 
361 aa  245  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1344  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.11 
 
 
363 aa  243  5e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.865033  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1584  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.17 
 
 
375 aa  243  5e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610651  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3148  2-nitropropane dioxygenase-like dioxygenase  38.08 
 
 
369 aa  243  5e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0185089  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1279  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  39.84 
 
 
363 aa  242  7e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0434534  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0006  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.81 
 
 
332 aa  242  7.999999999999999e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3736  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.48 
 
 
339 aa  240  2e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040511 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0038  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.36 
 
 
352 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0091  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.03 
 
 
382 aa  226  5.0000000000000005e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1854  hypothetical protein  38.33 
 
 
316 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0198092  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3815  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.78 
 
 
314 aa  220  3e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0282  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.5 
 
 
315 aa  199  7.999999999999999e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0713522  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0959  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.72 
 
 
315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00532239  normal  0.214658 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0114  hypothetical protein  39.02 
 
 
402 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.782574 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3317  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.21 
 
 
382 aa  190  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4589  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.16 
 
 
422 aa  189  9e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3641  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.21 
 
 
386 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1283  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.42 
 
 
396 aa  186  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.756319 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2694  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  36.29 
 
 
414 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0622  hypothetical protein  36.29 
 
 
405 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2896  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  36.29 
 
 
414 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.369795  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2751  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  36.29 
 
 
405 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.76383  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2391  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  36.29 
 
 
414 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1705  2-nitropropane dioxygenase  36.29 
 
 
438 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.137412  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2913  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.88 
 
 
315 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000125004  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5565  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.29 
 
 
405 aa  183  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286036  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2815  2-nitropropane dioxygenase  36.68 
 
 
392 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1803  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  36.68 
 
 
392 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5053  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.08 
 
 
396 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5061  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.26 
 
 
415 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.877356  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2083  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.68 
 
 
393 aa  176  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.683958 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1681  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.2 
 
 
396 aa  176  8e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1506  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.63 
 
 
396 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.186362 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1757  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.2 
 
 
396 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1676  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.68 
 
 
396 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0582286  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6322  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.2 
 
 
396 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1770  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.2 
 
 
396 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.763797 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2347  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.51 
 
 
393 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6039  hitchhiker  0.000000126588 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2314  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.46 
 
 
396 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.16521 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2272  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  34.96 
 
 
424 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.189277  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1945  putative 2-nitropropane dioxygenase  35.57 
 
 
396 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00553543  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2183  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  35.41 
 
 
396 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1305  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  35.41 
 
 
396 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.302592  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0103  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  35.41 
 
 
396 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1062  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  35.41 
 
 
396 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2128  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  35.14 
 
 
396 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.364934  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2314  2-nitropropane dioxygenase  34.96 
 
 
396 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1792  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  35.41 
 
 
396 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.34549  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2188  putative 2-nitropropane dioxygenase  34.68 
 
 
433 aa  159  8e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000766761 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0779  2-nitropropane dioxygenase NPD  34 
 
 
418 aa  125  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0274  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.93 
 
 
391 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0263  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.93 
 
 
391 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4381  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.79 
 
 
417 aa  124  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231487 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0253  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.63 
 
 
391 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0610  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.33 
 
 
417 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.6 
 
 
323 aa  120  3e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0188  hypothetical protein  33.11 
 
 
417 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0706904  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  31.93 
 
 
317 aa  120  4.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2873  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.12 
 
 
415 aa  120  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  32.46 
 
 
326 aa  119  7e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1538  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.87 
 
 
414 aa  119  7e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  33.33 
 
 
316 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2182  putative dioxygenase related to 2-nitropropane dioxygenase  32.79 
 
 
414 aa  119  9e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000148707  unclonable  0.000000279866 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  32.71 
 
 
316 aa  117  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1184  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.33 
 
 
414 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.06 
 
 
319 aa  116  6e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1939  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.67 
 
 
419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0670  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.46 
 
 
421 aa  114  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.17 
 
 
313 aa  112  9e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000021316  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0500  hypothetical protein  31.67 
 
 
419 aa  111  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.546917 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0626  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.31 
 
 
419 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>