45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0981 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0981  2-nitropropane dioxygenase, NPD  100 
 
 		 472 aa  947    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011325 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1713  2-nitropropane dioxygenase, NPD  55.08 
 
 		 475 aa  512  1e-144  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000796531  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4298  2-nitropropane dioxygenase, NPD  54.51 
 
 		 481 aa  500  1e-140  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.15389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2635  putative 2-nitropropane dioxygenase  55.32 
 
 		 491 aa  498  1e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5685  2-nitropropane dioxygenase, NPD  55.56 
 
 		 476 aa  487  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1622  2-nitropropane dioxygenase, NPD  52.67 
 
 		 487 aa  473  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1611  2-nitropropane dioxygenase NPD  53.18 
 
 		 485 aa  461  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0274193 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0849  2-nitropropane dioxygenase, NPD  52.15 
 
 		 505 aa  449  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.183629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3653  2-nitropropane dioxygenase, NPD  52.14 
 
 		 472 aa  431  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.042009  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50353  predicted protein  46.23 
 
 		 553 aa  426  1e-118  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1446  putative 2-nitropropane dioxygenase  52.35 
 
 		 486 aa  412  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00192568  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0610  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.26 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0977  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.2 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.652012  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0779  2-nitropropane dioxygenase NPD  22.53 
 
 		 418 aa  53.9  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1025  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.93 
 
 		 366 aa  53.5  0.000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1164  2-nitropropane dioxygenase, NPD  24.86 
 
 		 373 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.121776  normal  0.303682 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1334  2-nitropropane dioxygenase, NPD  23.95 
 
 		 414 aa  52.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.413147  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2873  2-nitropropane dioxygenase, NPD  23.93 
 
 		 415 aa  53.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0626  2-nitropropane dioxygenase, NPD  21.61 
 
 		 419 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1851  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.24 
 
 		 373 aa  51.6  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000135103  normal  0.816566 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0500  hypothetical protein  23.48 
 
 		 419 aa  51.6  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.546917 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0649  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.73 
 
 		 365 aa  50.8  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2248  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.84 
 
 		 360 aa  50.1  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.69113  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0766  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.14 
 
 		 373 aa  50.1  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0843777 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1939  2-nitropropane dioxygenase NPD  21.9 
 
 		 419 aa  49.7  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0670  2-nitropropane dioxygenase NPD  21.05 
 
 		 421 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0188  hypothetical protein  22.41 
 
 		 417 aa  49.7  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0706904  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0006  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.98 
 
 		 332 aa  49.3  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0091  2-nitropropane dioxygenase NPD  22.99 
 
 		 382 aa  48.9  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1158  2-nitropropane dioxygenase NPD  22.68 
 
 		 357 aa  47.8  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0552766 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0406  2-nitropropane dioxygenase NPD  24.6 
 
 		 357 aa  47.4  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.25833  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4381  2-nitropropane dioxygenase NPD  22.86 
 
 		 417 aa  47.4  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231487 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5565  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.94 
 
 		 405 aa  47.4  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286036  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  26.4 
 
 		 316 aa  46.2  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2147  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.25 
 
 		 354 aa  46.2  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2083  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.91 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.683958 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2985  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.56 
 
 		 364 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0405  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.25 
 
 		 376 aa  44.3  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0098  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.17 
 
 		 313 aa  44.3  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.718222  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1538  2-nitropropane dioxygenase, NPD  22.59 
 
 		 414 aa  44.3  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1586  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  22.69 
 
 		 373 aa  44.3  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.385159  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.77 
 
 		 334 aa  43.5  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2182  putative dioxygenase related to 2-nitropropane dioxygenase  24.59 
 
 		 414 aa  43.1  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000148707  unclonable  0.000000279866 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3113  2-nitropropane dioxygenase NPD  20.67 
 
 		 352 aa  43.1  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1584  2-nitropropane dioxygenase, NPD  22.8 
 
 		 375 aa  43.1  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610651  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>