83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5685 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5685  2-nitropropane dioxygenase, NPD  100 
 
 		 476 aa  925    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1622  2-nitropropane dioxygenase, NPD  62.08 
 
 		 487 aa  560  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1611  2-nitropropane dioxygenase NPD  62.39 
 
 		 485 aa  539  9.999999999999999e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0274193 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0849  2-nitropropane dioxygenase, NPD  58.99 
 
 		 505 aa  525  1e-147  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.183629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3653  2-nitropropane dioxygenase, NPD  60.91 
 
 		 472 aa  497  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.042009  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0981  2-nitropropane dioxygenase, NPD  55.56 
 
 		 472 aa  487  1e-136  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011325 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1713  2-nitropropane dioxygenase, NPD  51.69 
 
 		 475 aa  481  1e-134  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000796531  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4298  2-nitropropane dioxygenase, NPD  51.8 
 
 		 481 aa  473  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.15389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2635  putative 2-nitropropane dioxygenase  51.28 
 
 		 491 aa  446  1.0000000000000001e-124  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1446  putative 2-nitropropane dioxygenase  53.65 
 
 		 486 aa  421  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00192568  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50353  predicted protein  43.59 
 
 		 553 aa  389  1e-107  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0670  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.19 
 
 		 421 aa  68.2  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0766  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.74 
 
 		 373 aa  67  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0843777 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1164  2-nitropropane dioxygenase, NPD  25.53 
 
 		 373 aa  67  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.121776  normal  0.303682 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1586  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  25.07 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.385159  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0091  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.61 
 
 		 382 aa  65.1  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2182  putative dioxygenase related to 2-nitropropane dioxygenase  24.59 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000148707  unclonable  0.000000279866 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0188  hypothetical protein  22.3 
 
 		 417 aa  62  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0706904  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0756  2-nitropropane dioxygenase NPD  24.06 
 
 		 361 aa  62.4  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0649  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.35 
 
 		 365 aa  61.6  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0779  2-nitropropane dioxygenase NPD  22.2 
 
 		 418 aa  60.5  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3641  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.53 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1283  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.1 
 
 		 396 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.756319 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1676  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.25 
 
 		 396 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0582286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3317  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.53 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1945  putative 2-nitropropane dioxygenase  25.24 
 
 		 396 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00553543  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4381  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.25 
 
 		 417 aa  58.2  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231487 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2873  2-nitropropane dioxygenase, NPD  25.56 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1334  2-nitropropane dioxygenase, NPD  23.96 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.413147  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1061  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  21.82 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.992497  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6322  2-nitropropane dioxygenase, NPD  25.75 
 
 		 396 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1770  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.97 
 
 		 396 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.763797 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1025  2-nitropropane dioxygenase NPD  22.66 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1210  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  23.77 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1757  2-nitropropane dioxygenase, NPD  25.75 
 
 		 396 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1184  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.56 
 
 		 414 aa  57  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1249  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  22.1 
 
 		 355 aa  56.6  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1681  2-nitropropane dioxygenase, NPD  26 
 
 		 396 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5053  2-nitropropane dioxygenase, NPD  24.87 
 
 		 396 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2272  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  25.3 
 
 		 424 aa  55.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.189277  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0405  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.5 
 
 		 376 aa  55.5  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0610  2-nitropropane dioxygenase NPD  21.3 
 
 		 417 aa  55.5  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0114  hypothetical protein  25.23 
 
 		 402 aa  55.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.782574 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0626  2-nitropropane dioxygenase, NPD  23.02 
 
 		 419 aa  55.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1939  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.88 
 
 		 419 aa  55.1  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0406  2-nitropropane dioxygenase NPD  21.75 
 
 		 357 aa  53.9  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.25833  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2940  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.94 
 
 		 363 aa  53.5  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2314  2-nitropropane dioxygenase  24.44 
 
 		 396 aa  53.5  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1792  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  25.19 
 
 		 396 aa  53.5  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.34549  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2314  2-nitropropane dioxygenase NPD  25 
 
 		 396 aa  53.1  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.16521 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1062  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  25.19 
 
 		 396 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2248  2-nitropropane dioxygenase NPD  22.35 
 
 		 360 aa  52.8  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.69113  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2183  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  25.19 
 
 		 396 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2128  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  25.19 
 
 		 396 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.364934  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0103  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  25.19 
 
 		 396 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1305  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  25.19 
 
 		 396 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.302592  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0721  2-nitropropane dioxygenase, NPD  24.72 
 
 		 363 aa  52.4  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.214896  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1506  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.15 
 
 		 396 aa  51.2  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.186362 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0500  hypothetical protein  22.56 
 
 		 419 aa  51.2  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.546917 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1538  2-nitropropane dioxygenase, NPD  23.31 
 
 		 414 aa  51.2  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1344  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.44 
 
 		 363 aa  50.1  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.865033  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0498  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  22.22 
 
 		 363 aa  49.7  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.142021  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1140  hypothetical protein  27.36 
 
 		 355 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1851  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.05 
 
 		 373 aa  48.5  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000135103  normal  0.816566 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0977  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.21 
 
 		 380 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.652012  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2188  putative 2-nitropropane dioxygenase  27.36 
 
 		 433 aa  48.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000766761 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0038  2-nitropropane dioxygenase, NPD  24 
 
 		 352 aa  48.5  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1279  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  22.55 
 
 		 363 aa  47.8  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0434534  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2083  2-nitropropane dioxygenase, NPD  23.99 
 
 		 393 aa  47.4  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.683958 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1135  hypothetical protein  29.25 
 
 		 350 aa  47.4  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0006  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.83 
 
 		 332 aa  47  0.0008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0619  oxidoreductase (2-nitropropane dioxygenase family)  21.55 
 
 		 366 aa  45.8  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0455  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  23.23 
 
 		 363 aa  45.1  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000000961366  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5565  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.46 
 
 		 405 aa  45.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286036  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0485  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  21.29 
 
 		 365 aa  45.1  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4589  2-nitropropane dioxygenase, NPD  26.07 
 
 		 422 aa  44.7  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1293  2-nitropropane dioxygenase, NPD  68.57 
 
 		 361 aa  44.7  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000110305  hitchhiker  0.00000426168 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5061  2-nitropropane dioxygenase, NPD  23.91 
 
 		 415 aa  44.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.877356  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1406  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  23.23 
 
 		 363 aa  44.7  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  unclonable  0.00324657  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1286  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  23.43 
 
 		 363 aa  43.9  0.006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000131785  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2347  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.27 
 
 		 393 aa  43.9  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6039  hitchhiker  0.000000126588 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3113  2-nitropropane dioxygenase NPD  20.51 
 
 		 352 aa  43.9  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3007  2-nitropropane dioxygenase, NPD  24.94 
 
 		 379 aa  43.5  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>