More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1100 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1207  hypothetical protein  90.93 
 
 
540 aa  947    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1100  hypothetical protein  100 
 
 
540 aa  1064    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.575745  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8313  putative acetolactate synthase  56.62 
 
 
550 aa  595  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.387847 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2914  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  57.67 
 
 
548 aa  589  1e-167  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.540468  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0553  hypothetical protein  55.78 
 
 
553 aa  571  1e-161  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000755623  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7728  hypothetical protein  55.9 
 
 
559 aa  568  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1710  hypothetical protein  54.93 
 
 
551 aa  538  1e-151  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5210  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  51.86 
 
 
549 aa  508  1e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11850  hypothetical protein  48.51 
 
 
547 aa  478  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4120  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  36.15 
 
 
568 aa  349  7e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1089  thiamine pyrophosphate protein central region  41.84 
 
 
550 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0296  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  37.16 
 
 
568 aa  332  1e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414678  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4360  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  31.76 
 
 
640 aa  281  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0493016 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0954  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.39 
 
 
573 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3594  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  33.22 
 
 
574 aa  273  8.000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0544  acetolactate synthase-like TPP-requiring enzyme  34.81 
 
 
586 aa  270  4e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00261466 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1073  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  34.74 
 
 
847 aa  263  4e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2028  putative acetolactate synthase (acetohydroxy-acid synthase) (ALS), TPP-requiring enzyme  35.06 
 
 
570 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2104  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  33.39 
 
 
588 aa  258  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.444225 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2478  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding protein  34.32 
 
 
585 aa  258  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  32.72 
 
 
847 aa  255  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1073  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  35.26 
 
 
586 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0677257  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1326  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.42 
 
 
557 aa  249  8e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1015  thiamine pyrophosphate enzyme  34.55 
 
 
586 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.661723  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1076  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  34.53 
 
 
586 aa  247  4e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.244575  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1175  Acetolactate synthase  30.32 
 
 
591 aa  236  6e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.112778  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0112  thiamine pyrophosphate domain protein TPP-binding  32.72 
 
 
582 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246122  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.86 
 
 
563 aa  221  3e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5585  putative oxalyl-CoA decarboxylase  29.44 
 
 
581 aa  221  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1149  putative oxalyl-CoA decarboxylase  30.68 
 
 
584 aa  218  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.314848  normal  0.637283 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.81 
 
 
552 aa  216  7e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.84 
 
 
588 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0486  putative oxalyl-CoA decarboxylase  29.58 
 
 
584 aa  215  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1260  acetolactate synthase, large subunit  27.76 
 
 
566 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00775476  hitchhiker  0.00000116322 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1495  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.97 
 
 
566 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433241 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.95 
 
 
581 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.64 
 
 
566 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.39 
 
 
566 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500204  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.97 
 
 
563 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2746  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.87 
 
 
566 aa  213  7e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  25.68 
 
 
587 aa  212  1e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.95 
 
 
566 aa  211  3e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  27.44 
 
 
587 aa  211  4e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.4 
 
 
581 aa  211  4e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1209  putative oxalyl-CoA decarboxylase  29.76 
 
 
583 aa  210  5e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.32462 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1369  putative oxalyl-CoA decarboxylase  29.76 
 
 
583 aa  210  5e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2168  acetolactate synthase, large subunit  27.72 
 
 
562 aa  210  7e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4838  putative oxalyl-CoA decarboxylase  28.6 
 
 
598 aa  209  7e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.54 
 
 
562 aa  209  8e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3430  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.26 
 
 
574 aa  209  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.646845  normal  0.0217288 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  26.53 
 
 
587 aa  208  2e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.57 
 
 
553 aa  206  6e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2596  acetolactate synthase catalytic subunit  25.74 
 
 
577 aa  206  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  25.59 
 
 
587 aa  206  1e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.55 
 
 
556 aa  206  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0018312  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3023  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.55 
 
 
561 aa  206  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000478309  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.35 
 
 
569 aa  204  3e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  27.66 
 
 
567 aa  204  3e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1450  acetolactate synthase catalytic subunit  27.71 
 
 
566 aa  204  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.805223  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4664  putative oxalyl-CoA decarboxylase  28.7 
 
 
577 aa  204  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0855  acetolactate synthase catalytic subunit  26.64 
 
 
578 aa  203  5e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.14 
 
 
554 aa  203  7e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  26.07 
 
 
599 aa  203  7e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3075  acetolactate synthase, large subunit  26.92 
 
 
566 aa  202  9e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.843153  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3617  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.57 
 
 
563 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692831  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1517  acetolactate synthase catalytic subunit  28.09 
 
 
566 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1282  acetolactate synthase catalytic subunit  28.19 
 
 
566 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.92 
 
 
565 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  26.63 
 
 
566 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1281  acetolactate synthase catalytic subunit  28.19 
 
 
569 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4449  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.36 
 
 
570 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0502  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.15 
 
 
535 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0235829  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1488  acetolactate synthase catalytic subunit  28.19 
 
 
569 aa  201  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1556  acetolactate synthase catalytic subunit  28.19 
 
 
566 aa  201  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1319  acetolactate synthase catalytic subunit  27.99 
 
 
566 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3894  acetolactate synthase catalytic subunit  27.99 
 
 
566 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3892  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.96 
 
 
550 aa  200  6e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289685  normal  0.0243729 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1417  acetolactate synthase catalytic subunit  27.99 
 
 
566 aa  200  7e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0911  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.97 
 
 
587 aa  200  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1308  acetolactate synthase catalytic subunit  27.81 
 
 
578 aa  199  9e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0833  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.18 
 
 
569 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.469559  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.54 
 
 
582 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3114  putative oxalyl-CoA decarboxylase  26.63 
 
 
576 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.857507  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1170  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.65 
 
 
583 aa  199  1.0000000000000001e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10830  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.34 
 
 
555 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3155  thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  33.77 
 
 
550 aa  198  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3108  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.1 
 
 
571 aa  197  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_737  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.23 
 
 
569 aa  197  3e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00716267  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2401  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.38 
 
 
558 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0132  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.59 
 
 
584 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2119  acetolactate synthase, large subunit  26.68 
 
 
568 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.712969  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1063  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.1 
 
 
595 aa  197  4.0000000000000005e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.722606  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2229  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.21 
 
 
579 aa  197  4.0000000000000005e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.63 
 
 
563 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.01 
 
 
558 aa  196  6e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1296  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.6 
 
 
563 aa  196  6e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3580  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.39 
 
 
558 aa  196  8.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0486011  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.65 
 
 
564 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0132  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.13 
 
 
584 aa  196  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.084297 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.48 
 
 
561 aa  196  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>