More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3335 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00648  putrescine/proton symporter: putrescine/ornithine antiporter  75.52 
 
 		 439 aa  667    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.173719  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2945  arginine/ornithine antiporter  75.52 
 
 		 439 aa  667    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3976  putrescine transporter  89.53 
 
 		 439 aa  782    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0747  putrescine transporter  74.43 
 
 		 439 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110662  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0180  putrescine transporter  90.02 
 
 		 439 aa  786    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1204  putrescine transporter  73.06 
 
 		 437 aa  655    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.658764  decreased coverage  0.0000377329 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0857  putrescine transporter  74.43 
 
 		 439 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00640  hypothetical protein  75.52 
 
 		 439 aa  667    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.167643  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0313  putrescine transporter  89.79 
 
 		 439 aa  784    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0784  putrescine transporter  75.52 
 
 		 439 aa  665    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0285849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0760  putrescine transporter  74.43 
 
 		 439 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.428261  normal  0.419082 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0808  putrescine transporter  74.43 
 
 		 439 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.210181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3680  putrescine transporter  88.68 
 
 		 439 aa  783    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0508  putrescine transporter  77.6 
 
 		 440 aa  666    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0714  putrescine transporter  74.89 
 
 		 439 aa  666    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0136028  normal  0.578449 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4172  putrescine transporter  89.53 
 
 		 439 aa  782    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2964  putrescine transporter  75.52 
 
 		 439 aa  667    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.018093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4085  putrescine transporter  89.53 
 
 		 439 aa  782    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0717  putrescine transporter  74.88 
 
 		 439 aa  663    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193165  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0821  putrescine transporter  74.43 
 
 		 439 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.438039  normal  0.147845 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1574  putrescine transporter  71.13 
 
 		 436 aa  636    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3668  putrescine transporter  90 
 
 		 439 aa  782    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0277  putrescine transporter  89.77 
 
 		 439 aa  780    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4054  putrescine transporter  89.53 
 
 		 439 aa  782    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3872  putrescine transporter  89.77 
 
 		 439 aa  780    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0414158 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3335  putrescine transporter  100 
 
 		 438 aa  869    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04834  putrescine transporter  65.97 
 
 		 436 aa  585  1e-166  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001093  putrescine/proton symporter putrescine/ornithine antiporter PotE  65.51 
 
 		 436 aa  583  1.0000000000000001e-165  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3513  putrescine transporter  63.87 
 
 		 461 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015578 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4355  putrescine transporter  63.7 
 
 		 461 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879219  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4011  putrescine transporter  63.7 
 
 		 461 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.253932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1067  putrescine transporter  64.49 
 
 		 439 aa  567  1e-160  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5194  putrescine transporter  55.99 
 
 		 452 aa  488  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6446  amino acid permease-associated region  53.46 
 
 		 750 aa  463  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.396159 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2445  putrescine transporter  51.92 
 
 		 446 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273787  normal  0.196088 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2989  putrescine transporter  50.35 
 
 		 443 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00443871  normal  0.0573626 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3254  putrescine transporter  50.58 
 
 		 442 aa  437  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4344  arginine:agmatin antiporter  38.81 
 
 		 508 aa  278  9e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.620829  hitchhiker  0.000578907 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4860  arginine:agmatin antiporter  38.6 
 
 		 508 aa  276  5e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.086172  hitchhiker  0.00303215 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0780  arginine:agmatin antiporter  38.35 
 
 		 510 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12332  normal  0.0754473 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3702  arginine:agmatin antiporter  37.84 
 
 		 509 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.391119 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2394  arginine:agmatin antiporter  40.64 
 
 		 450 aa  268  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.66662  normal  0.401461 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2861  arginine:agmatin antiporter  35.58 
 
 		 444 aa  266  5e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0608832  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1326  arginine:agmatin antiporter  35.58 
 
 		 444 aa  266  5e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.501085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2782  arginine:agmatin antiporter  35.58 
 
 		 444 aa  266  5e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.604082  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03986  arginine:agmatin  35.38 
 
 		 445 aa  263  4e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3877  amino acid permease-associated region  35.38 
 
 		 445 aa  263  4e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4612  arginine:agmatin antiporter  35.38 
 
 		 445 aa  263  4e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3912  arginine:agmatin antiporter  35.38 
 
 		 445 aa  263  4e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.27107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5628  arginine:agmatin antiporter  35.38 
 
 		 445 aa  263  4e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4669  arginine:agmatin antiporter  35.38 
 
 		 445 aa  263  4e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4580  arginine:agmatin antiporter  35.38 
 
 		 445 aa  263  4e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03947  hypothetical protein  35.38 
 
 		 445 aa  263  4e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4355  arginine:agmatin antiporter  35.38 
 
 		 445 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.705479  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4640  arginine:agmatin antiporter  35.14 
 
 		 445 aa  260  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4556  arginine:agmatin antiporter  35.14 
 
 		 445 aa  260  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4640  arginine:agmatin antiporter  35.14 
 
 		 445 aa  260  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4689  arginine:agmatin antiporter  35.14 
 
 		 445 aa  260  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4549  arginine:agmatin antiporter  34.89 
 
 		 445 aa  257  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2657  lysine/cadaverine antiporter  36.9 
 
 		 445 aa  206  6e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002188  lysine/cadaverine antiporter membrane protein CadB  35.03 
 
 		 447 aa  204  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000189693  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00206  lysine/cadaverine antiporter  34.76 
 
 		 448 aa  203  4e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1006  lysine/cadaverine antiporter  33.5 
 
 		 438 aa  200  5e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000705878  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2492  lysine/cadaverine antiporter  34.76 
 
 		 444 aa  199  7e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3476  putative amino acid permease  31.42 
 
 		 451 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41010  putative amino acid permease  30.57 
 
 		 451 aa  193  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2800  lysine/cadaverine antiporter  33.09 
 
 		 443 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.1623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2821  lysine/cadaverine antiporter  33.09 
 
 		 443 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2717  lysine/cadaverine antiporter  33.09 
 
 		 443 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2759  lysine/cadaverine antiporter  33.09 
 
 		 443 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.420004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2934  lysine/cadaverine antiporter  33.09 
 
 		 443 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.252343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3768  lysine/cadaverine antiporter  32.53 
 
 		 449 aa  185  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000519797  normal  0.028767 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1307  amino acid permease-associated region  29.82 
 
 		 445 aa  180  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.678061 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04003  predicted lysine/cadaverine transporter  32.71 
 
 		 444 aa  177  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03965  hypothetical protein  32.71 
 
 		 444 aa  177  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5648  lysine/cadaverine antiporter  32.71 
 
 		 444 aa  177  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.742778  normal  0.745814 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3895  lysine/cadaverine antiporter  32.71 
 
 		 444 aa  177  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4373  lysine/cadaverine antiporter  32.71 
 
 		 444 aa  177  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0915774  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4601  lysine/cadaverine antiporter  32.71 
 
 		 444 aa  177  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000619747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4687  lysine/cadaverine antiporter  32.71 
 
 		 444 aa  177  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3940  amino acid permease-associated region  32.05 
 
 		 460 aa  176  8e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.447116 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  32.67 
 
 		 440 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5198  amino acid permease-associated region  28.47 
 
 		 441 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.043341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3167  amino acid permease-associated region  28.22 
 
 		 436 aa  168  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2801  amino acid permease  29.28 
 
 		 476 aa  162  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0536  amino acid permease-associated region  31.24 
 
 		 435 aa  156  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.555012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4244  amino acid permease-associated region  30.47 
 
 		 453 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.399011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2206  amino acid permease-associated region  28.28 
 
 		 452 aa  150  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218547  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2346  amino acid permease-associated region  28.81 
 
 		 447 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0957  amino acid permease family protein  29.43 
 
 		 411 aa  147  4.0000000000000006e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.253131  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0445  amino acid permease  27.47 
 
 		 426 aa  123  7e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000397922  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1754  amino acid permease-associated region  26.96 
 
 		 474 aa  120  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0147  amino acid permease-associated region  31.46 
 
 		 448 aa  118  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1674  phospholipid binding protein  29.31 
 
 		 438 aa  117  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.054806  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2587  arginine/ornithine antiporter  25.66 
 
 		 463 aa  110  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1939  arginine/ornithine antiporter  26.56 
 
 		 463 aa  110  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2298  putative arginine/ornithine antiporter ArcD  26.56 
 
 		 463 aa  110  6e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.552138 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1828  putative arginine/ornithine antiporter ArcD  26.56 
 
 		 463 aa  110  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.768875  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2315  arginine/ornithine antiporter  25.83 
 
 		 460 aa  102  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.222235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1791  arginine/ornithine antiporter  25.65 
 
 		 460 aa  101  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0468427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>