54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0271 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0365  major facilitator superfamily permease  80 
 
 		 474 aa  752    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0357  major facilitator transporter  79.1 
 
 		 472 aa  729    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3609  twin-arginine translocation pathway signal  79.45 
 
 		 474 aa  750    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0334  twin-arginine translocation pathway signal  79.87 
 
 		 474 aa  753    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3845  twin-arginine translocation pathway signal  78.46 
 
 		 476 aa  728    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0367  major facilitator superfamily MFS_1  79.1 
 
 		 472 aa  730    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000109722 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3806  major facilitator transporter  79.24 
 
 		 495 aa  748    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0271  hypothetical protein  100 
 
 		 491 aa  980    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0364  major facilitator transporter  79.32 
 
 		 472 aa  731    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0359  major facilitator transporter  78.85 
 
 		 471 aa  728    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3428  major facilitator transporter  67.81 
 
 		 482 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0794  major facilitator transporter  32.93 
 
 		 461 aa  190  4e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_781  hypothetical protein  32.06 
 
 		 461 aa  189  1e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0909  hypothetical protein  31.15 
 
 		 440 aa  173  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2212  hypothetical protein  28.67 
 
 		 490 aa  139  7.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.814869  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5054  major facilitator superfamily MFS_1  25.2 
 
 		 462 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102448  normal  0.0163601 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5596  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 		 531 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0855834  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1763  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 		 453 aa  105  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455527  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2087  major facilitator superfamily MFS_1  22.22 
 
 		 446 aa  103  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000442741  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5604  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 		 457 aa  101  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.638903  normal  0.244185 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2034  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 504 aa  100  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1005  major facilitator superfamily MFS_1  25.29 
 
 		 446 aa  97.1  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2443  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 		 457 aa  94.4  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000052902  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0874  major facilitator transporter  23.45 
 
 		 450 aa  86.3  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1712  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 		 445 aa  84  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.200643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1339  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 471 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0682  major facilitator transporter  23.06 
 
 		 454 aa  80.1  0.00000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1458  major facilitator transporter  24.31 
 
 		 480 aa  75.1  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2800  hypothetical protein  24.91 
 
 		 397 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1691  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 445 aa  70.5  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000499428  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3236  major facilitator superfamily MFS_1  21.72 
 
 		 513 aa  70.5  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.113654 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1862  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 440 aa  70.1  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144262  normal  0.586915 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1748  major facilitator transporter  24.92 
 
 		 444 aa  69.3  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0189374  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1194  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 		 405 aa  68.2  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0355  major facilitator transporter  23.73 
 
 		 459 aa  67.8  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000720237  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0373  major facilitator transporter  23.39 
 
 		 459 aa  66.6  0.0000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.259758  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0184  major facilitator transporter  24.92 
 
 		 470 aa  66.6  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.012641 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0201  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 		 402 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.196345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0793  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 482 aa  64.7  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320766 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0397  hypothetical protein  25.5 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0195929  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0984  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0902256  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0029  major facilitator superfamily MFS_1  27.12 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0968  major facilitator superfamily protein  20.4 
 
 		 468 aa  57.4  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.623645  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2056  major facilitator transporter  21.25 
 
 		 413 aa  54.7  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000877049  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4967  major facilitator transporter  23.73 
 
 		 440 aa  53.9  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.880384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0233  major facilitator superfamily MFS_1  21.54 
 
 		 457 aa  52.8  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1791  major facilitator superfamily MFS_1  26.24 
 
 		 420 aa  52.4  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3349  major facilitator transporter  23.8 
 
 		 441 aa  50.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2661  major facilitator transporter  26.07 
 
 		 437 aa  47  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2462  major facilitator transporter  25.57 
 
 		 446 aa  46.6  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0763  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.12 
 
 		 641 aa  45.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  25.53 
 
 		 414 aa  44.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0494  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 442 aa  44.3  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.236521  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3945  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.73 
 
 		 528 aa  43.5  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00181565  hitchhiker  0.00620132 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>