35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2968 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2968  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 288 aa  555  1e-157  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0461  RDD  47.52 
 
 		 323 aa  229  3e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.253425  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3129  RDD domain containing protein  42.96 
 
 		 304 aa  188  8e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.403499 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2675  RDD domain-containing protein  38.25 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  29.84 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0409  RDD  35.29 
 
 		 231 aa  72  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1596  RDD domain-containing protein  32.08 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3574  RDD domain containing protein  33.33 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.737424  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  33.14 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4266  RDD domain-containing protein  30.54 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000560964  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38330  hypothetical protein  34.27 
 
 		 242 aa  62  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4021  RDD  33.14 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897049  normal  0.0584976 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3753  RDD domain containing protein  31.87 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4317  hypothetical protein  30.49 
 
 		 235 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0824  RDD domain containing protein  29.63 
 
 		 590 aa  58.9  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0333571  normal  0.0552944 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3843  RDD domain containing protein  36.47 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56100  hypothetical protein  32.54 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3316  RDD domain-containing protein  31.36 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3579  RDD domain containing protein  33.53 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000310569 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09288  putative transmembrane protein  22.84 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.875246  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4887  hypothetical protein  33.14 
 
 		 223 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437888  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0277  RDD domain containing protein  34.75 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.0986894 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3744  RDD domain containing protein  27.9 
 
 		 279 aa  52.4  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4051  RDD domain containing protein  32.62 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4439  RDD  31.09 
 
 		 241 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0232  RDD domain containing protein  26.16 
 
 		 247 aa  50.1  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09620  RDD domain containing protein  25 
 
 		 302 aa  47.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0755  RDD  29.82 
 
 		 340 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.581888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5231  RDD domain-containing protein  28.73 
 
 		 262 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435963  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4952  RDD domain-containing protein  28.73 
 
 		 262 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4863  RDD domain-containing protein  28.73 
 
 		 262 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.964955  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1614  RDD domain-containing protein  28.68 
 
 		 323 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0215766 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  24.7 
 
 		 295 aa  43.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2503  hypothetical protein  30.86 
 
 		 264 aa  43.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1201  RDD domain-containing protein  28.9 
 
 		 269 aa  42.4  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>