76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2781 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2781  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 207 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0687  AraC family transcriptional regulator  45.56 
 
 		 293 aa  150  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.50177  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2970  transcriptional regulator, AraC family  45.24 
 
 		 276 aa  62  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3117 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0974  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 313 aa  61.6  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.323377  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0106  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.77 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0383824  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2289  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4039  transcriptional regulator, AraC family  35.14 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0024992  normal  0.0177037 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1550  transcriptional regulator, AraC family  31.79 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4652  transcriptional regulator, AraC family  30.57 
 
 		 272 aa  54.3  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  29.66 
 
 		 260 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3275  transcriptional regulator, AraC family  30.72 
 
 		 229 aa  52  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5221  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 297 aa  52  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343965  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.2 
 
 		 260 aa  50.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5515  transcriptional regulator, AraC family  30.86 
 
 		 291 aa  50.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184351  normal  0.0529906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 278 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4694  AraC family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 272 aa  50.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3383  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 271 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1076  transcriptional regulator, AraC family  33.55 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4393  transcriptional regulator, AraC family  29.91 
 
 		 246 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.287242  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1224  Helix-turn-helix, AraC domain protein  29.24 
 
 		 289 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3504  transcriptional regulator, AraC family  22.99 
 
 		 281 aa  50.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6191  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 		 282 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0958  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.82 
 
 		 268 aa  49.7  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0644351  decreased coverage  0.00475018 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6449  AraC family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 239 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2463  transcriptional regulator, AraC family  34.04 
 
 		 248 aa  49.7  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  26.51 
 
 		 269 aa  49.3  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  20.81 
 
 		 271 aa  48.5  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1886  transcriptional regulator, AraC family  32.56 
 
 		 280 aa  47.4  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.979359  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25000  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  30.77 
 
 		 263 aa  47.8  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1097  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 261 aa  47.8  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3589  AraC/XylS family transcription factor  36.59 
 
 		 247 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.843106  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6750  transcriptional regulator, AraC family  29.81 
 
 		 327 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0099  transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 		 287 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  26.97 
 
 		 272 aa  47.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3491  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.03 
 
 		 248 aa  46.6  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.873447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1932  AraC family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 236 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0659  hypothetical protein  36.59 
 
 		 277 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0955  hypothetical protein  36.59 
 
 		 277 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3571  hypothetical protein  36.59 
 
 		 277 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3599  hypothetical protein  36.59 
 
 		 277 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1925  hypothetical protein  36.59 
 
 		 277 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.588858  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0516  putative transcriptional regulator  36.59 
 
 		 247 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2241  helix-turn-helix domain-containing protein  34.07 
 
 		 277 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1479  helix-turn-helix domain-containing protein  24.71 
 
 		 299 aa  45.4  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0993365  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2597  transcriptional regulator, AraC family  25.9 
 
 		 253 aa  45.1  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00366269  normal  0.225275 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5257  transcriptional regulator, AraC family  31.1 
 
 		 289 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1425  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 271 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333229  normal  0.212879 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3509  transcriptional regulator, AraC family  27.22 
 
 		 277 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.551098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0145  Helix-turn-helix, AraC domain protein  31.65 
 
 		 276 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4026  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 276 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546725  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4578  AraC family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 409 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0591899  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2318  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 278 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3966  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 276 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0381394 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2409  AraC family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 285 aa  43.5  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2336  hypothetical protein  30.49 
 
 		 274 aa  43.5  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.429257 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0047  transcriptional regulator, AraC family  25.93 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.230347  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4510  transcriptional regulator, AraC family  32.63 
 
 		 268 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  26.57 
 
 		 271 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4969  transcriptional regulator, AraC family  25.14 
 
 		 409 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0310  transcriptional regulator, AraC family  29.27 
 
 		 268 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4151  transcriptional regulator, AraC family  36.59 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0354643  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4562  AraC family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 409 aa  42.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00627934  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  22.66 
 
 		 272 aa  42.7  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3952  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 262 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5387  transcriptional regulator, AraC family  25.97 
 
 		 279 aa  42.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0111  AraC family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 274 aa  42.4  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2202  transcriptional regulator, AraC family  33.05 
 
 		 287 aa  42.4  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2660  transcriptional regulator, AraC family  28.68 
 
 		 278 aa  42.4  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 275 aa  42.4  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4318  transcriptional regulator, AraC family  31.18 
 
 		 267 aa  42  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.642666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5120  transcriptional regulator, AraC family  25.3 
 
 		 275 aa  42.4  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.282168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5306  transcriptional regulator, AraC family  34.96 
 
 		 244 aa  42  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1684  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  22.78 
 
 		 288 aa  41.6  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.465215  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4529  Helix-turn-helix, AraC domain protein  29.03 
 
 		 303 aa  41.6  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0825  AraC family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 289 aa  41.2  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1131  transcriptional regulator, AraC family  28.44 
 
 		 342 aa  41.2  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.079056 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>