114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2442 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2442  putative copper efflux system periplasmic protein CusF  100 
 
 		 122 aa  239  7e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2551  hypothetical protein  46.03 
 
 		 136 aa  100  7e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4016  heavy metal efflux system protein  42.03 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5388  hypothetical protein  38.21 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141167 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0023  hypothetical protein  41.67 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.814264  hitchhiker  0.0010274 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0025  hypothetical protein  41.67 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.130406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0023  hypothetical protein  41.67 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.803739 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2580  hypothetical protein  50 
 
 		 94 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.36216 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2320  hypothetical protein  43.42 
 
 		 114 aa  62  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4823  hypothetical protein  50 
 
 		 94 aa  61.2  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.186817 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1032  hypothetical protein  48.53 
 
 		 94 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4901  hypothetical protein  50 
 
 		 104 aa  60.1  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4604  hypothetical protein  49.23 
 
 		 94 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.647307  normal  0.246426 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4403  hypothetical protein  44.78 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.574836  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4052  Tn4652, TnpA repressor protein TnpC, putative  44.78 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0493  hypothetical protein  43.94 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.119099 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6281  RND family efflux transporter MFP subunit  43.04 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.358593 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7872  hypothetical protein  46.97 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5685  RND family efflux transporter MFP subunit  41.77 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0152011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5034  periplasmic copper-binding protein  45.59 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.152463 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3979  hypothetical protein  39.76 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0069  cation efflux system domain-containing protein  37.18 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.323301 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4171  RND family efflux transporter MFP subunit  46.15 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.339982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5183  RND family efflux transporter MFP subunit  39.13 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2654  hypothetical protein  40.62 
 
 		 98 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4353  RND family efflux transporter MFP subunit  43.48 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0871487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1093  hypothetical protein  47.06 
 
 		 101 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1033  protein of unknown function DUF305  41.79 
 
 		 234 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3346  RND family efflux transporter MFP subunit  40.58 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2581  hypothetical protein  40.58 
 
 		 236 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.405095 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3490  hypothetical protein  45 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3892  RND family efflux transporter MFP subunit  42.03 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1332  hypothetical protein  40.91 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  46.55 
 
 		 546 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4560  hypothetical protein  46.94 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2039  hypothetical protein  33.7 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821645  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3056  periplasmic copper-binding protein  40.68 
 
 		 110 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4764  RND family efflux transporter MFP subunit  41.79 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.132756  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3403  RND family efflux transporter MFP subunit  41.79 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0620  periplasmic copper-binding protein  40.68 
 
 		 110 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000654239  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6290  hypothetical protein  31.97 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.104471 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3073  periplasmic copper-binding protein  40.68 
 
 		 110 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4050  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  37.8 
 
 		 517 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00534  periplasmic copper-binding protein  40.68 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00523  hypothetical protein  40.68 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0591  periplasmic copper-binding protein  40.68 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00546027  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0591  periplasmic copper-binding protein  38.98 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.877525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4113  RND family efflux transporter MFP subunit  41.54 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3377  hypothetical protein  38.81 
 
 		 105 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0715  hypothetical protein  33.09 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115312  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1326  hypothetical protein  36.62 
 
 		 134 aa  47.8  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.113159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3912  hypothetical protein  39.13 
 
 		 115 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.438117  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4456  hypothetical protein  39.13 
 
 		 115 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4550  hypothetical protein  30.65 
 
 		 117 aa  47.8  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5848  RND family efflux transporter MFP subunit  39.13 
 
 		 115 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2010  RND family efflux transporter MFP subunit  33.83 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  46.43 
 
 		 537 aa  47.4  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2720  hypothetical protein  32.14 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00719919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0623  hypothetical protein  33.83 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.8 
 
 		 512 aa  47.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0515  hypothetical protein  38.81 
 
 		 151 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1407  secretion protein HlyD  46.43 
 
 		 540 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3489  hypothetical protein  34.83 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0177  hypothetical protein  32.95 
 
 		 509 aa  46.2  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  36 
 
 		 538 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3047  hypothetical protein  38.81 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2045  hypothetical protein  38.81 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0320  hypothetical protein  38.81 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0333  hypothetical protein  38.81 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2239  hypothetical protein  38.81 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1260  blue (type1) copper domain-containing protein  40.62 
 
 		 272 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0922125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0116  hypothetical protein  41.79 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0471  hypothetical protein  38.46 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0474  RND family efflux transporter MFP subunit  42.19 
 
 		 545 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0677608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0654  periplasmic copper-binding protein  38.98 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.380565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4512  RND family efflux transporter MFP subunit  46.67 
 
 		 552 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.201635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0538  hypothetical protein  35.38 
 
 		 95 aa  45.1  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0733  hypothetical protein  36.92 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1958  RND family efflux transporter MFP subunit  38.89 
 
 		 115 aa  44.3  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6300  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.92 
 
 		 500 aa  44.3  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3354  hypothetical protein  37.33 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4028  hypothetical protein  37.5 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0335786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3914  hypothetical protein  37.5 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.248976  normal  0.907588 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2477  hypothetical protein  33.33 
 
 		 105 aa  44.3  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  35.38 
 
 		 504 aa  44.3  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2898  hypothetical protein  42.86 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0208203 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2907  hypothetical protein  40.91 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.580394  normal  0.0129637 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.13 
 
 		 537 aa  43.9  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6069  hypothetical protein  32.79 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387914  normal  0.0699917 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2549  secretion protein HlyD  31.33 
 
 		 490 aa  42.7  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4752  hypothetical protein  32.97 
 
 		 114 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533115  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1389  RND family efflux transporter MFP subunit  39.73 
 
 		 502 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545507 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2196  hypothetical protein  35.11 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3415  hypothetical protein  32.97 
 
 		 114 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4101  hypothetical protein  32.97 
 
 		 114 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.385135 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3492  secretion protein HlyD  38.33 
 
 		 545 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.341782 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1637  hypothetical protein  36.36 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214754  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2049  RND family efflux transporter MFP subunit  37.66 
 
 		 523 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00264035 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1808  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.82 
 
 		 510 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.034543  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2293  hypothetical protein  33.33 
 
 		 120 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119473  normal  0.136633 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>