More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1281 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1281  lipoyl synthase  100 
 
 		 311 aa  647    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1921  lipoyl synthase  84.83 
 
 		 310 aa  519  1e-146  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0537683  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0241  lipoyl synthase  79.8 
 
 		 312 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.395057  normal  0.45798 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  69.86 
 
 		 321 aa  429  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0165  lipoyl synthase  72.5 
 
 		 329 aa  430  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00380091 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  70.21 
 
 		 325 aa  428  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1611  lipoyl synthase  68.28 
 
 		 323 aa  421  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1083  lipoyl synthase  67.59 
 
 		 323 aa  417  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3897  lipoyl synthase  67.81 
 
 		 317 aa  420  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.576703 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1804  lipoyl synthase  68.28 
 
 		 323 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00544633  hitchhiker  0.00579604 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2065  lipoyl synthase  67.7 
 
 		 321 aa  419  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  64.24 
 
 		 351 aa  415  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1509  lipoyl synthase  66.21 
 
 		 325 aa  415  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499062  normal  0.4257 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0523  lipoyl synthase  67.71 
 
 		 325 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1624  lipoyl synthase  67 
 
 		 322 aa  417  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686327  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1376  lipoyl synthase  62.79 
 
 		 315 aa  413  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1124  lipoyl synthase  65.98 
 
 		 322 aa  410  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2123  lipoyl synthase  66.9 
 
 		 323 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2572  lipoyl synthase  64.67 
 
 		 319 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.085231  normal  0.78924 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1371  lipoyl synthase  64.26 
 
 		 330 aa  409  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.113855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2923  lipoyl synthase  65.29 
 
 		 334 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.790522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5924  lipoyl synthase  65.64 
 
 		 320 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.848601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1439  lipoyl synthase  65.64 
 
 		 319 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.115253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1877  lipoyl synthase  67.6 
 
 		 314 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1082  lipoyl synthase  65.64 
 
 		 322 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2176  lipoyl synthase  64.51 
 
 		 327 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.349481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1583  lipoyl synthase  64.6 
 
 		 316 aa  404  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.681458  normal  0.0313019 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3949  lipoyl synthase  64.95 
 
 		 319 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.331367 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0538  lipoyl synthase  64.26 
 
 		 317 aa  401  1e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2857  lipoyl synthase  66.08 
 
 		 319 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1831  lipoyl synthase  64.6 
 
 		 319 aa  401  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377575  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3027  lipoyl synthase  64.6 
 
 		 339 aa  404  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.282591  normal  0.443203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2799  lipoyl synthase  64.6 
 
 		 339 aa  403  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6533  lipoyl synthase  65.29 
 
 		 320 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432658  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2824  lipoyl synthase  69.18 
 
 		 320 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2783  lipoyl synthase  62.54 
 
 		 320 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2226  lipoyl synthase  63.7 
 
 		 315 aa  400  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0487133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1252  lipoyl synthase  65.29 
 
 		 328 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1425  lipoyl synthase  62.54 
 
 		 320 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0392901 
 
 
-
 
NC_002978  WD0392  lipoyl synthase  64.56 
 
 		 287 aa  394  1e-109  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2888  lipoyl synthase  66.31 
 
 		 319 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2584  lipoyl synthase  64.26 
 
 		 319 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510234 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1041  lipoyl synthase  61.17 
 
 		 320 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  61.36 
 
 		 299 aa  390  1e-107  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  59.32 
 
 		 297 aa  389  1e-107  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0322  lipoyl synthase  59.38 
 
 		 296 aa  349  3e-95  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0527  lipoyl synthase  55.8 
 
 		 296 aa  333  2e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  55.2 
 
 		 324 aa  326  4.0000000000000003e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  52.28 
 
 		 321 aa  322  5e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0274  lipoyl synthase  54.84 
 
 		 311 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.99023 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3156  lipoyl synthase  53.45 
 
 		 289 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1263  lipoic acid synthetase  55.64 
 
 		 337 aa  310  2.9999999999999997e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.330421  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  50.35 
 
 		 303 aa  309  4e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  50.35 
 
 		 303 aa  309  4e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2940  lipoyl synthase  53.07 
 
 		 289 aa  308  6.999999999999999e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  51.99 
 
 		 283 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1375  lipoyl synthase  53.02 
 
 		 329 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2696  lipoyl synthase  54.55 
 
 		 320 aa  306  3e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0052  lipoyl synthase  53.02 
 
 		 329 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0218  lipoyl synthase  53.02 
 
 		 329 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  53.82 
 
 		 325 aa  306  3e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3186  lipoyl synthase  53.02 
 
 		 329 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2799  lipoyl synthase  52.67 
 
 		 330 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0788526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2937  lipoyl synthase  52.67 
 
 		 330 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0417  lipoyl synthase  52.67 
 
 		 330 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297091  normal  0.190566 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01649  lipoyl synthase  51.81 
 
 		 320 aa  305  6e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00769873  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0628  lipoyl synthase  53.02 
 
 		 329 aa  305  6e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.931315  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0464  lipoyl synthase  53.02 
 
 		 329 aa  305  6e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0444  lipoyl synthase  53.02 
 
 		 329 aa  305  6e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2570  lipoyl synthase  52.43 
 
 		 317 aa  305  7e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0658558  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2200  lipoyl synthase  52.43 
 
 		 317 aa  305  7e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.810557  normal  0.0342252 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1414  lipoyl synthase  52.73 
 
 		 315 aa  305  8.000000000000001e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00276409  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1351  lipoyl synthase  52.73 
 
 		 315 aa  305  9.000000000000001e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.264104  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1162  lipoyl synthase  53.82 
 
 		 291 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000484773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  52.92 
 
 		 309 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4212  lipoyl synthase  53.02 
 
 		 334 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740031 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04289  lipoyl synthase  53.43 
 
 		 327 aa  304  1.0000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0504  lipoyl synthase  52.31 
 
 		 335 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0591731 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3346  lipoyl synthase  52.73 
 
 		 294 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2897  lipoyl synthase  52.67 
 
 		 330 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6230  lipoyl synthase  52.31 
 
 		 330 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0386  lipoyl synthase  52.67 
 
 		 329 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86797  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3093  lipoyl synthase  53.45 
 
 		 324 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2272  lipoyl synthase  52.67 
 
 		 330 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  50.7 
 
 		 282 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2887  lipoyl synthase  52.67 
 
 		 330 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0217  lipoyl synthase  52.31 
 
 		 334 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  51.81 
 
 		 308 aa  301  1e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08460  lipoyl synthase  52.73 
 
 		 325 aa  301  1e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  48.82 
 
 		 298 aa  300  2e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  50 
 
 		 298 aa  300  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23551  lipoyl synthase  52.88 
 
 		 294 aa  300  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.225624 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  48.82 
 
 		 298 aa  300  3e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4963  lipoyl synthase  51.41 
 
 		 340 aa  300  3e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  51.64 
 
 		 355 aa  299  3e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0567  lipoic acid synthetase  51.27 
 
 		 289 aa  300  3e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1957  lipoyl synthase  50.35 
 
 		 292 aa  300  3e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0540392  decreased coverage  0.00259733 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0542  lipoyl synthase  52.73 
 
 		 297 aa  299  5e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0470  lipoyl synthase  52.84 
 
 		 332 aa  298  6e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0184  lipoyl synthase  51.25 
 
 		 333 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336159  normal  0.998847 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>