More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1001 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1001  ABC transporter related  100 
 
 		 260 aa  497  1e-140  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.796453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0257  ABC transporter related  61.25 
 
 		 266 aa  279  3e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.80562  normal  0.0615172 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0511  ABC transporter related  52.54 
 
 		 259 aa  223  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.470088 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4255  ABC transporter related  50 
 
 		 260 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.350498 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8245  ABC transporter related  52.08 
 
 		 271 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1829  ABC transporter related  48.36 
 
 		 257 aa  215  7e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.336355  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6080  ABC transporter related  48.77 
 
 		 271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0086  ABC transporter related  52.17 
 
 		 260 aa  211  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.363839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3804  ABC transporter related  49.79 
 
 		 271 aa  211  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3049  ABC transporter, ATPase subunit  50.43 
 
 		 260 aa  208  9e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3729  ABC transporter related  48.94 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0793  ABC transporter related  47.97 
 
 		 259 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2923  ABC transporter related  47.68 
 
 		 260 aa  205  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0729345  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0733  ABC transporter related  48.61 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2066  ABC transporter related  47.11 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0631  ABC transporter related  45.75 
 
 		 260 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.17434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0491  ABC transporter component  46.88 
 
 		 267 aa  192  5e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2405  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  45.14 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1068  ABC transporter related  45.14 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5679  ABC transporter related  48.74 
 
 		 270 aa  190  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1302  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  45.49 
 
 		 258 aa  189  4e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1344  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  45.49 
 
 		 258 aa  189  4e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28070  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  45.9 
 
 		 258 aa  188  5.999999999999999e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  37.55 
 
 		 268 aa  188  8e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2740  ABC transporter related  47.06 
 
 		 264 aa  188  9e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2511  ABC transporter related  45 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4385  ABC transporter related  51.45 
 
 		 251 aa  186  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.426909  normal  0.116393 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  42.74 
 
 		 490 aa  183  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3343  ABC transporter for cobalamin/Fe3+-siderophores ATP-binding protein  39.61 
 
 		 273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2926  ABC transporter related  51.25 
 
 		 271 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.214011 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  35.59 
 
 		 405 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1385  ABC transporter related  45.53 
 
 		 250 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.193672 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1319  ABC transporter related  39.69 
 
 		 258 aa  177  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1342  ABC transporter related  42.4 
 
 		 252 aa  174  9e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.868132  normal  0.307367 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  40.08 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  40.08 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  40.08 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  38.98 
 
 		 409 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  40.08 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  43.57 
 
 		 293 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2492  ABC transporter related  44.68 
 
 		 419 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  38.17 
 
 		 255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0739  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  39.67 
 
 		 255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0622  ABC transporter related  40.76 
 
 		 275 aa  171  9e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.258343  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3151  ABC transporter related  49.58 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  36.36 
 
 		 258 aa  171  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  41.03 
 
 		 536 aa  170  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  36.8 
 
 		 266 aa  169  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2619  ABC transporter related  44.21 
 
 		 254 aa  169  6e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2816  ABC transporter related protein  42.08 
 
 		 263 aa  167  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  39.6 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  43.5 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_590  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, ATPase component  39.5 
 
 		 275 aa  167  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.139681  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2061  ABC transporter related  37.97 
 
 		 277 aa  167  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.948125 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8853  ABC transporter related  42.21 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0889132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0664  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  37.6 
 
 		 263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  41.15 
 
 		 268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2362  ABC transporter related  43.21 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  38.49 
 
 		 268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1694  ABC transporter related  38.91 
 
 		 278 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.055567  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001072  ferrichrome ABC transporter (ATP binding subunit) PvuE  36.93 
 
 		 254 aa  166  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  42.8 
 
 		 255 aa  165  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  40.16 
 
 		 414 aa  165  6.9999999999999995e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  40.71 
 
 		 424 aa  165  6.9999999999999995e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0652  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  39.92 
 
 		 274 aa  165  8e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0686  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  39.92 
 
 		 274 aa  165  8e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  35.14 
 
 		 262 aa  165  8e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1142  ABC transporter related  41.42 
 
 		 255 aa  165  8e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3252  ABC transporter related  40 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000102185  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  34.14 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.23 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.23 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  41.22 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6474  ABC transporter related  39.08 
 
 		 269 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.820871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0556  ABC transporter related  36.73 
 
 		 264 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3576  ABC transporter related  43.04 
 
 		 264 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0297567 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  34.98 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1448  ABC transporter related protein  41.37 
 
 		 264 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.425565  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2421  ABC transporter related  42.02 
 
 		 286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00390383  normal  0.0144872 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4153  ABC transporter related  42.37 
 
 		 257 aa  163  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0112212  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0760  iron(III) dicitrate transport system, ATP-binding protein FecE  38.02 
 
 		 263 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  37.29 
 
 		 455 aa  163  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3466  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  45.38 
 
 		 269 aa  162  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39496  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  42.13 
 
 		 255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3844  ABC transporter related  42.37 
 
 		 257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1591  ABC transporter related protein  41.81 
 
 		 262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1942  ABC transporter related  44.1 
 
 		 257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1233  ABC transporter-like protein  42.62 
 
 		 271 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.113424 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  38.27 
 
 		 268 aa  162  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1894  ABC transporter related  37.04 
 
 		 416 aa  162  6e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1095  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  34.1 
 
 		 262 aa  162  6e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3784  ABC transporter related  40.24 
 
 		 253 aa  162  6e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3617  ABC transporter related  45.42 
 
 		 270 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3736  ABC transporter-related protein  40.81 
 
 		 311 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.652525 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1451  ABC transporter related protein  40.57 
 
 		 258 aa  161  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.776567  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3549  ABC transporter-related protein  45.02 
 
 		 271 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0341647  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1621  ABC transporter-like protein  39.3 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  44.96 
 
 		 253 aa  160  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1809  ABC transporter related  41.25 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  42.55 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>