278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1658 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1658  flagellar motor switch protein FliN  100 
 
 		 194 aa  383  1e-106  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1431  Type III secretion system outer membrane O protein  32.9 
 
 		 153 aa  98.2  7e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4387  flagellar motor switch protein FliN  37.31 
 
 		 148 aa  97.1  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2908  flagellar motor switch protein FliN  45.45 
 
 		 155 aa  96.3  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1696  flagellar motor switch protein FliN  36.67 
 
 		 137 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.433623  normal  0.0279018 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  33.12 
 
 		 175 aa  96.3  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1702  flagellar motor switch protein FliN  36.3 
 
 		 137 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000907552  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2723  flagellar motor switch protein FliN  36.67 
 
 		 137 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0704854  normal  0.317166 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3436  flagellar motor switch protein FliN  32 
 
 		 153 aa  96.3  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1067  flagellar motor switch protein FliN  36.67 
 
 		 137 aa  95.9  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000602287  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2046  flagellar motor switch protein FliN  36.67 
 
 		 137 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00538012  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1986  flagellar motor switch protein  35.37 
 
 		 166 aa  95.5  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0765  Type III secretion system outer membrane O protein  44.68 
 
 		 147 aa  95.1  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1238  flagellar motor switch protein FliN  36 
 
 		 137 aa  95.1  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2179  flagellar motor switch protein FliN  36 
 
 		 137 aa  95.1  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000312484  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  45.88 
 
 		 346 aa  94.4  9e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2939  flagellar motor switch protein FliN  35 
 
 		 154 aa  94.4  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2537  flagellar motor switch protein FliN  34.46 
 
 		 137 aa  94  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.464076  normal  0.964599 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1406  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  41.28 
 
 		 422 aa  94.4  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.545677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1364  flagellar motor switch FliN  50 
 
 		 97 aa  93.6  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.000279225  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  45.88 
 
 		 346 aa  94.4  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2493  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 		 97 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484808  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1970  flagellar motor switch FliN  38.52 
 
 		 142 aa  93.2  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2589  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 		 97 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0772408  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3073  flagellar motor switch protein FliN  36.5 
 
 		 149 aa  92.8  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154609  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3799  flagellar motor switch protein FliN  36.5 
 
 		 149 aa  92.8  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0241  flagellar motor switch protein FliN  34.35 
 
 		 143 aa  91.7  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593105  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3223  Type III secretion system outer membrane O protein  34.96 
 
 		 163 aa  91.7  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1121  flagellar motor switch protein FliN  31.9 
 
 		 163 aa  91.7  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.5679 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2686  flagellar motor switch protein FliN  34.35 
 
 		 162 aa  91.3  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0028  flagellar motor switch protein FliN  34.35 
 
 		 143 aa  91.7  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182038  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3496  flagellar motor switch protein FliN  34.35 
 
 		 162 aa  91.3  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1866  flagellar motor switch protein FliN  34.35 
 
 		 162 aa  91.3  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.996713  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2193  flagellar motor switch protein FliN  34.25 
 
 		 137 aa  91.3  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.824257 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2135  flagellar motor switch protein FliN  34.25 
 
 		 137 aa  91.3  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.120788 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0030  flagellar motor switch protein FliN  34.35 
 
 		 165 aa  91.3  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0030  flagellar motor switch protein FliN  34.35 
 
 		 165 aa  91.3  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3778  flagellar motor switch protein FliN  37.4 
 
 		 154 aa  91.3  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1265  flagellar motor switch protein FliN  34.25 
 
 		 137 aa  91.3  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1142  flagellar motor switch protein FliN  34.25 
 
 		 137 aa  91.3  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0539046  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2140  flagellar motor switch protein FliN  34.25 
 
 		 137 aa  91.3  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280572 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2763  flagellar motor switch protein FliN  34.15 
 
 		 124 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0040  flagellar motor switch protein FliN  34.96 
 
 		 163 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0058  flagellar motor switch protein FliN  34.96 
 
 		 162 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2583  flagellar motor switch protein FliN  34.92 
 
 		 137 aa  90.5  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0031  flagellar motor switch FliN  34.96 
 
 		 162 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3039  flagellar motor switch protein  37.88 
 
 		 131 aa  90.5  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0031  flagellar motor switch protein FliN  34.96 
 
 		 161 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0039  flagellar motor switch protein FliN  34.96 
 
 		 162 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1322  flagellar motor switch protein FliN  43.9 
 
 		 375 aa  90.9  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0646  flagellar motor switch protein FliN  35.71 
 
 		 143 aa  90.1  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1883  flagellar motor switch protein FliN  34.13 
 
 		 137 aa  89.7  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1608  flagellar motor switch/type III secretory pathway protein FliN  41.94 
 
 		 132 aa  90.1  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429927  normal  0.0945773 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2400  flagellar motor switch protein FliN  34.13 
 
 		 138 aa  89.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3058  flagellar motor switch protein  37.4 
 
 		 127 aa  89.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.173815  normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0558  flagellar motor switch FliN  35.82 
 
 		 139 aa  89.7  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139719  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0157  flagellar motor switch protein FliN  46.34 
 
 		 154 aa  89.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.491458 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1334  flagellar motor switch protein  37.88 
 
 		 127 aa  89.7  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1123  flagellar motor switch protein  37.6 
 
 		 401 aa  89.7  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2955  flagellar motor switch protein FliN  36.88 
 
 		 137 aa  90.1  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2300  flagellar motor switch protein FliN  34.13 
 
 		 138 aa  89.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2017  flagellar motor switch protein  43.53 
 
 		 360 aa  89.4  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2733  flagellar motor switch protein FliN  36.08 
 
 		 188 aa  89.4  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02879  flagellar motor switch protein  34.67 
 
 		 135 aa  89  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2380  flagellar motor switch protein  46.99 
 
 		 411 aa  88.6  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2568  flagellar motor switch protein  35.11 
 
 		 127 aa  88.2  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002823  flagellar motor switch protein FliN  37.98 
 
 		 136 aa  88.2  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0573  flagellar motor switch protein  45.88 
 
 		 142 aa  88.2  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1374  flagellar motor switch protein  36.64 
 
 		 127 aa  88.2  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.480393  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1547  flagellar motor switch protein  33.74 
 
 		 152 aa  87.8  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0443324  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1024  flagellar motor switch protein FliN  45.88 
 
 		 153 aa  87.8  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1190  flagellar motor switch protein  36.64 
 
 		 127 aa  87.8  9e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2918  flagellar motor switch protein  45.68 
 
 		 126 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117423  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1626  flagellar motor switch protein  39.8 
 
 		 129 aa  87.8  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0042  flagellar motor switch protein FliN  45.12 
 
 		 159 aa  87.8  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3220  flagellar motor switch protein  45.68 
 
 		 124 aa  87.4  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1970  flagellar motor switch protein FliN  35.21 
 
 		 152 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.18125  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  36.97 
 
 		 155 aa  87.4  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1369  flagellar motor switch protein  36.09 
 
 		 126 aa  87.4  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3060  flagellar motor switch protein  45.68 
 
 		 126 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.255596  normal  0.369101 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5299  flagellar motor switch FliN  43.33 
 
 		 156 aa  87.4  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.934631  normal  0.10372 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1548  flagellar motor switch protein FliN  44.58 
 
 		 136 aa  87  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1290  flagellar motor switch protein  45.68 
 
 		 124 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.471773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1357  flagellar motor switch protein  45.68 
 
 		 124 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0976  flagellar motor switch protein FliN  41.25 
 
 		 226 aa  87.8  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232649  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1350  flagellar motor switch protein  45.68 
 
 		 124 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0172691  normal  0.386045 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1445  flagellar motor switch protein  45.68 
 
 		 126 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0098879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2928  flagellar motor switch protein  45.68 
 
 		 126 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1568  flagellar motor switch protein FliN  43.37 
 
 		 138 aa  87.4  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.183846  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4357  flagellar motor switch protein  33.33 
 
 		 161 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1509  flagellar motor switch protein  33.33 
 
 		 154 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785237  normal  0.0757312 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45790  flagellar motor switch protein  34.97 
 
 		 157 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2289  flagellar motor switch protein  45.68 
 
 		 124 aa  86.7  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.912954 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03153  flagellar motor switch protein  37.69 
 
 		 136 aa  87  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0377  flagellar motor switch protein FliN  45.12 
 
 		 156 aa  85.9  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1353  surface presentation of antigens (SPOA) protein  42.35 
 
 		 151 aa  86.3  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2174  surface presentation of antigens (SpoA) protein  34.35 
 
 		 135 aa  86.3  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3883  flagellar motor switch protein  34.97 
 
 		 157 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.444092  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  39.39 
 
 		 154 aa  85.5  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4755  flagellar motor switch protein FliN  45.12 
 
 		 150 aa  85.1  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.853225 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>