More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0925 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0925  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 219 aa  454  1e-127  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000502161  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3809  putative lantibiotic biosynthesis DNA-binding response regulator  54.13 
 
 		 220 aa  259  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3613  lantibiotic biosynthesis DNA-binding response regulator  54.13 
 
 		 220 aa  259  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.127001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3900  lantibiotic biosynthesis DNA-binding response regulator  54.13 
 
 		 220 aa  259  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1170  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.71 
 
 		 220 aa  233  1.0000000000000001e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.454571 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04120  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  49.1 
 
 		 220 aa  232  4.0000000000000004e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.745463 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1166  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.15 
 
 		 232 aa  188  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0244  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 233 aa  186  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71816  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4752  response regulator  38.29 
 
 		 229 aa  168  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  40.79 
 
 		 232 aa  168  5e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  40.62 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  40.62 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  40.64 
 
 		 223 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  40.64 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  40.64 
 
 		 223 aa  162  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  40.64 
 
 		 223 aa  162  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  40.64 
 
 		 223 aa  162  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  40.64 
 
 		 223 aa  162  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  40.64 
 
 		 223 aa  162  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3009  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.32 
 
 		 236 aa  161  9e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.333093 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1021  two component transcriptional regulator  38.84 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0963  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0255  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000922211  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1173  DNA-binding response regulator  37.28 
 
 		 234 aa  158  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.423617  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4168  DNA-binding response regulator  37.28 
 
 		 234 aa  158  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  38.05 
 
 		 233 aa  158  7e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  38.05 
 
 		 233 aa  158  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  38.05 
 
 		 233 aa  158  7e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  37.61 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  37.61 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  37.61 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  37.61 
 
 		 233 aa  156  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.33 
 
 		 226 aa  156  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1198  DNA-binding response regulator  37.28 
 
 		 234 aa  156  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.885409 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1017  response regulator  37.28 
 
 		 234 aa  156  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0627963  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  37.61 
 
 		 233 aa  156  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1023  two component transcriptional regulator  37.44 
 
 		 233 aa  155  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.26 
 
 		 237 aa  156  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0827  two component transcriptional regulator  39.64 
 
 		 256 aa  155  5.0000000000000005e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00211389  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5254  regulatory protein VanR  36.56 
 
 		 234 aa  155  6e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  37.17 
 
 		 233 aa  155  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1018  response regulator  37.28 
 
 		 234 aa  155  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.54503  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1665  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.55 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  36.56 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4920  DNA-binding response regulator  36.75 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4803  DNA-binding response regulator  36.75 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1040  DNA-binding response regulator  36.84 
 
 		 234 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1119  DNA-binding response regulator  36.84 
 
 		 234 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  35.78 
 
 		 234 aa  153  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0218  two component transcriptional regulator  38.36 
 
 		 239 aa  153  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  37.84 
 
 		 240 aa  153  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  36.73 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1275  DNA-binding response regulator  36.84 
 
 		 234 aa  153  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4565  DNA-binding response regulator  36.32 
 
 		 233 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4400  DNA-binding response regulator  36.32 
 
 		 233 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4417  DNA-binding response regulator  36.32 
 
 		 233 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  37.39 
 
 		 236 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1218  DNA-binding response regulator  36.4 
 
 		 234 aa  152  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.94 
 
 		 236 aa  152  4e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  36.8 
 
 		 232 aa  152  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2813  two component transcriptional regulator  38.67 
 
 		 231 aa  152  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000151023  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1476  two component transcriptional regulator  38.99 
 
 		 219 aa  152  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1505  response regulator receiver  38.99 
 
 		 219 aa  152  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.404603  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3419  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 242 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4786  DNA-binding response regulator  36.32 
 
 		 229 aa  151  7e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0289  two component transcriptional regulator  38.74 
 
 		 243 aa  151  7e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.563834 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2729  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.68 
 
 		 228 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981161  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0458  DNA-binding response regulator  36.32 
 
 		 229 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396749 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  37.78 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  37.44 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4781  DNA-binding response regulator  35.9 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2918  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.19 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3872  two component transcriptional regulator  33.91 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0547348  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.95 
 
 		 230 aa  149  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.22 
 
 		 237 aa  149  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  34.7 
 
 		 231 aa  148  5e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1220  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.53 
 
 		 233 aa  148  6e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991602 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1529  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.36 
 
 		 228 aa  148  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  36 
 
 		 237 aa  148  7e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  37.56 
 
 		 227 aa  148  7e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1562  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  37.33 
 
 		 240 aa  148  8e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.279171  normal  0.454228 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05730  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  38.39 
 
 		 242 aa  147  9e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.587783  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01984  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with BaeS  37.33 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1577  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.33 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2752  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  35.62 
 
 		 799 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0981  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  37.33 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.443633  normal  0.661259 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3019  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  37.33 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0767733 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4666  two component transcriptional regulator  34.93 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2221  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  37.33 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01976  hypothetical protein  37.33 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3069  two component transcriptional regulator  33.91 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467461  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  36.28 
 
 		 238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1210  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  36.82 
 
 		 239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000498147  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1327  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  36.82 
 
 		 239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.72 
 
 		 232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2021  regulatory protein VanR  37 
 
 		 228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  36.68 
 
 		 239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>