More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0343 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0343  ABC-type metal ion transport system, permease component  100 
 
 
230 aa  454  1e-127  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000324678  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1638  ABC transporter, permease protein  69.57 
 
 
230 aa  239  2e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0438642  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1721  ABC-type metal ion transport system, permease component  53.28 
 
 
232 aa  231  9e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0191  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.66 
 
 
229 aa  218  8.999999999999998e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.799852  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0427  ABC-type metal ion transport system, permease component  56.28 
 
 
231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0366  ABC-type metal ion transport system, permease component  55.41 
 
 
231 aa  212  3.9999999999999995e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1055  ABC-type metal ion transport system, permease component  49.12 
 
 
228 aa  187  1e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0162881  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0846  ABC-type metal ion transport system, permease component  54.98 
 
 
233 aa  170  2e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883508  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.15 
 
 
222 aa  159  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.918282  hitchhiker  0.000827956 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.48 
 
 
222 aa  158  8e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0275  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.23 
 
 
221 aa  158  9e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0890  ABC transporter, permease protein  43.48 
 
 
226 aa  157  2e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.48 
 
 
222 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08270  ABC-type metal ion transport system, permease component  42.57 
 
 
225 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154439  normal  0.55012 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.57 
 
 
224 aa  151  7e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000432369 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.57 
 
 
225 aa  149  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000286975  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.89 
 
 
215 aa  142  4e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.771315  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.26 
 
 
217 aa  141  7e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000122974  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1504  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.5 
 
 
226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1438  ABC transporter, permease protein  43.96 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.455899  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0547  methionine ABC transporter permease  43.96 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.460496  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1868  ABC transporter, permease protein  43.96 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.326462  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0859  methionine ABC transporter permease  43.96 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0449  methionine ABC transporter permease  43.96 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.800882  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2175  methionine ABC transporter permease  43.96 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2653  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.55 
 
 
224 aa  139  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7231  ABC transporter membrane spanning protein  46.38 
 
 
213 aa  139  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.238623  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 
217 aa  138  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626863  hitchhiker  0.00236834 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.96 
 
 
217 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2000  methionine transport system permease protein  41.79 
 
 
218 aa  135  4e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.445077  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0196  D-methionine ABC transporter, permease protein  41.79 
 
 
218 aa  135  4e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.87 
 
 
218 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393989  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0854  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  42.51 
 
 
218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0225125  hitchhiker  0.00619599 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1534  D-methionine ABC transporter, permease  43.69 
 
 
229 aa  133  3e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.145987  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2366  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.56 
 
 
217 aa  132  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0812331  hitchhiker  0.00268015 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0921  transmembrane ABC transporter protein  42.08 
 
 
217 aa  132  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.773713  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3857  DL-methionine transporter subunit  41.51 
 
 
217 aa  132  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.955348 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.03 
 
 
218 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141892  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.55 
 
 
221 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.74 
 
 
226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.12 
 
 
217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.676084 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.72 
 
 
221 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251109  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.72 
 
 
221 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3537  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  40.59 
 
 
228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0228117 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0887  D-methionine transport system permease protein MetI  38.65 
 
 
225 aa  129  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2537  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.72 
 
 
221 aa  129  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00567563  normal  0.226034 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.45 
 
 
218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116542  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0252  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.83 
 
 
225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.302856  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.45 
 
 
218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.206806 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0428  ABC transporter, permease protein  38.35 
 
 
225 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.03 
 
 
220 aa  129  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290196  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2552  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.06 
 
 
217 aa  128  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7235  ABC transporter membrane spanning protein  43.56 
 
 
217 aa  128  8.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.1 
 
 
223 aa  128  9.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0903  ABC transporter, permease protein  43.63 
 
 
221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0962  ABC transporter, permease protein  43.63 
 
 
221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.496997  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16990  ABC-type metal ion transport system, permease component  42.23 
 
 
217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.126358  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.63 
 
 
221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0996  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  43.96 
 
 
217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.81 
 
 
217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0565276  normal  0.49182 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3885  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 
227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.81 
 
 
217 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302745  normal  0.367632 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0736  DL-methionine transporter permease subunit  44.39 
 
 
217 aa  127  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00465748  normal  0.854328 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01201  hypothetical protein  37.38 
 
 
225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.56 
 
 
217 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291848  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.04 
 
 
235 aa  126  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004239  methionine ABC transporter permease protein  36.41 
 
 
225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0098  ABC transporter, permease protein  42.51 
 
 
219 aa  125  5e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.712322  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.58 
 
 
221 aa  125  6e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.571471  hitchhiker  0.00153184 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.06 
 
 
221 aa  125  8.000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0543007  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.06 
 
 
213 aa  124  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114041  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4332  hypothetical protein  41.38 
 
 
224 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362545  normal  0.101939 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0968  D-methionine transport system permease protein MetI  41.55 
 
 
213 aa  124  1e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.53 
 
 
217 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.60731  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1095  DL-methionine transporter permease subunit  43.78 
 
 
217 aa  123  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0123731  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3406  DL-methionine transporter permease subunit  43.78 
 
 
217 aa  123  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.139854  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2930  D-methionine ABC transporter, permease protein  43.96 
 
 
217 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1234  D-methionine transport system permease protein MetI  40.37 
 
 
223 aa  123  2e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1019  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.48 
 
 
217 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3754  DL-methionine transporter permease subunit  41.94 
 
 
217 aa  123  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000523808  normal  0.0802818 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4173  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  43.48 
 
 
217 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325664  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0312  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  43.84 
 
 
218 aa  123  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555716  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1651  D-methionine ABC transporter, permease protein  43.96 
 
 
217 aa  123  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1042  DL-methionine transporter permease subunit  43.78 
 
 
217 aa  123  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000294871  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.48 
 
 
217 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.713567  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.97 
 
 
227 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2869  D-methionine ABC transporter, permease protein  43.96 
 
 
217 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.48 
 
 
217 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3574  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.97 
 
 
227 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.129763 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0268  DL-methionine transporter permease subunit  42.93 
 
 
217 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0411312  normal  0.568834 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0216  D-methionine ABC transporter, permease protein  43.96 
 
 
217 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0413  D-methionine ABC transporter, permease protein  43.96 
 
 
217 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0268  DL-methionine transporter permease subunit  42.93 
 
 
217 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0674799  normal  0.269155 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0273  DL-methionine transporter permease subunit  42.93 
 
 
217 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.188598  normal  0.044434 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2418  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.65 
 
 
223 aa  123  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0284  DL-methionine transporter permease subunit  42.93 
 
 
217 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00293716  normal  0.232369 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0287  DL-methionine transporter permease subunit  42.93 
 
 
217 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000127237  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.97 
 
 
227 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2557  D-methionine ABC transporter, permease protein  43.96 
 
 
217 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0933  D-methionine ABC transporter, permease protein  43.96 
 
 
217 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>