256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3239.3 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3239.3  flagellar hook-associated protein  100 
 
 		 386 aa  769    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3091  flagellar hook-associated protein FlgK  84.42 
 
 		 641 aa  661    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.348969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1268  flagellar hook-associated protein FlgK  91.17 
 
 		 641 aa  711    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1338  flagellar hook-associated protein FlgK  91.43 
 
 		 641 aa  712    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1330  flagellar hook-associated protein FlgK  88.89 
 
 		 641 aa  690    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.493477  normal  0.0693976 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2953  flagellar hook-associated protein FlgK  84.68 
 
 		 641 aa  664    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1425  flagellar hook-associated protein FlgK  84.16 
 
 		 641 aa  661    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2588  flagellar hook-associated protein FlgK  88.89 
 
 		 641 aa  687    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2938  flagellar hook-associated protein FlgK  85.19 
 
 		 641 aa  669    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1354  flagellar hook-associated protein FlgK  71.43 
 
 		 638 aa  565  1e-160  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1606  flagellar hook-associated protein FlgK  71.28 
 
 		 637 aa  550  1e-155  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0566107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3078  flagellar hook-associated protein FlgK  70.03 
 
 		 638 aa  543  1e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1170  flagellar hook-associated protein FlgK  68.77 
 
 		 642 aa  543  1e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.793737  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1349  flagellar hook-associated protein FlgK  65.45 
 
 		 640 aa  528  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2309  flagellar hook-associated protein  67.64 
 
 		 638 aa  528  1e-149  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.133958 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1312  flagellar hook-associated protein  64.94 
 
 		 639 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1486  flagellar hook-associated protein  38.01 
 
 		 665 aa  233  3e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004164  flagellar hook-associated protein FlgK  34.32 
 
 		 646 aa  218  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2329  flagellar hook-associated protein FlgK  33.78 
 
 		 626 aa  210  3e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2841  flagellar hook-associated protein FlgK  35.43 
 
 		 681 aa  204  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.673988  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01297  flagellar hook-associated protein FlgK  33.24 
 
 		 637 aa  204  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1783  flagellar hook-associated protein FlgK  34.05 
 
 		 624 aa  202  9e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1474  flagellar hook-associated protein FlgK  33.77 
 
 		 676 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0329611  normal  0.363224 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3722  flagellar hook-associated protein FlgK  33.51 
 
 		 682 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  32.24 
 
 		 683 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1944  flagellar hook-associated protein FlgK  34.76 
 
 		 686 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0163464  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1233  flagellar hook-associated protein FlgK  32.62 
 
 		 649 aa  173  5e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1233  flagellar hook-associated protein FlgK  32.62 
 
 		 649 aa  172  9e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  33.33 
 
 		 680 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1111  flagellar hook-associated protein FlgK  30.71 
 
 		 688 aa  172  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0676298  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  31.79 
 
 		 682 aa  170  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3471  flagellar hook-associated protein FlgK  33.25 
 
 		 686 aa  170  5e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.230935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1506  flagellar hook-associated protein FlgK  33.6 
 
 		 681 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3942  flagellar hook-associated protein FlgK  32.1 
 
 		 680 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  30.98 
 
 		 647 aa  159  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1963  flagellar hook-associated protein FlgK  31 
 
 		 645 aa  155  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  27.23 
 
 		 920 aa  153  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  34.3 
 
 		 457 aa  152  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  28.32 
 
 		 546 aa  147  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1628  flagellar hook-associated protein FlgK  31.55 
 
 		 629 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.770281 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  30.26 
 
 		 637 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1897  flagellar hook-associated protein FlgK  31.83 
 
 		 626 aa  145  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.844089  normal  0.0573856 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06163  flagellar hook-associated protein FlgK  29.27 
 
 		 624 aa  144  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.557443  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1461  flagellar hook-associated protein FlgK  30.11 
 
 		 547 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.597207  hitchhiker  0.00000199333 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2961  flagellar hook-associated protein FlgK  29.49 
 
 		 548 aa  145  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01003  flagellar hook-associated protein FlgK  29.27 
 
 		 624 aa  144  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.163579  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  29.84 
 
 		 547 aa  144  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  29.84 
 
 		 547 aa  144  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01078  flagellar hook-associated protein K  29.84 
 
 		 547 aa  144  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  29.84 
 
 		 547 aa  143  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01086  hypothetical protein  29.84 
 
 		 547 aa  144  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0870613  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2046  flagellar hook-associated protein FlgK  29.84 
 
 		 547 aa  143  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.147605  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2518  flagellar hook-associated protein FlgK  29.84 
 
 		 547 aa  143  6e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38905  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1205  flagellar hook-associated protein FlgK  29.84 
 
 		 547 aa  143  6e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0984648  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2007  flagellar hook-associated protein FlgK  30.05 
 
 		 554 aa  142  9e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2314  flagellar hook-associated protein FlgK  30.05 
 
 		 554 aa  142  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2416  flagellar hook-associated protein FlgK  30.05 
 
 		 554 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.524278  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02919  Flagellar hook-associated protein  30.45 
 
 		 680 aa  142  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3459  flagellar hook-associated protein FlgK  32.45 
 
 		 457 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4782  flagellar hook-associated protein FlgK  32.44 
 
 		 645 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.419966 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3705  flagellar hook-associated protein FlgK  32.44 
 
 		 645 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.117062 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4182  flagellar hook-associated protein FlgK  30.03 
 
 		 652 aa  140  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2958  flagellar hook-associated protein FlgK  29.32 
 
 		 657 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360284 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3962  flagellar hook-associated protein FlgK  32.45 
 
 		 457 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  30.93 
 
 		 642 aa  138  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  28.07 
 
 		 631 aa  138  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  32.59 
 
 		 457 aa  138  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1767  flagellar hook-associated protein FlgK  30.89 
 
 		 549 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1562  flagellar hook-associated protein FlgK  30.09 
 
 		 640 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.776714  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3837  flagellar hook-associated protein FlgK  29.77 
 
 		 691 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3091  flagellar hook-associated protein FlgK  29.88 
 
 		 709 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0758  flagellar hook-associated protein FlgK  30.06 
 
 		 683 aa  132  9e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3723  flagellar hook-associated protein  28.53 
 
 		 644 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.875784  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3110  flagellar hook-associated protein FlgK  29.74 
 
 		 672 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293616  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  30.85 
 
 		 640 aa  131  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1330  flagellar hook-associated protein FlgK  30.21 
 
 		 638 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0250  flagellar hook-associated protein FlgK  30 
 
 		 667 aa  127  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0150  flagellar hook-associated protein FlgK  29.46 
 
 		 657 aa  126  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0276  flagellar hook-associated protein FlgK  30.26 
 
 		 714 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0473  flagellar hook-associated protein FlgK  30.26 
 
 		 667 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3335  flagellar hook-associated protein FlgK  30.26 
 
 		 667 aa  125  9e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3344  flagellar hook-associated protein FlgK  30.26 
 
 		 667 aa  125  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0288  flagellar hook-associated protein FlgK  30.26 
 
 		 667 aa  125  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3004  flagellar hook-associated protein FlgK  30.26 
 
 		 667 aa  125  9e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2089  flagellar hook-associated protein FlgK  30.26 
 
 		 667 aa  125  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  26.13 
 
 		 631 aa  125  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  28.61 
 
 		 457 aa  125  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3784  flagellar hook-associated protein FlgK  28.17 
 
 		 657 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1280  flagellar hook-associated protein FlgK  29.79 
 
 		 553 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.227106  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1251  flagellar hook-associated protein FlgK  29.79 
 
 		 553 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.294007 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1295  flagellar hook-associated protein FlgK  29.79 
 
 		 553 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.216547  hitchhiker  0.000168062 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2189  flagellar hook-associated protein FlgK  29.79 
 
 		 553 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000358653 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2005  flagellar hook-associated protein FlgK  29.79 
 
 		 553 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00869488  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0624  flagellar hook-associated protein FlgK  28.44 
 
 		 642 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3010  flagellar hook-associated protein FlgK  29.67 
 
 		 659 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0935  flagellar hook-associated protein FlgK  29.68 
 
 		 640 aa  121  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.789193  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6361  flagellar hook-associated protein FlgK  29.82 
 
 		 660 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04918  flagellar hook-associated protein  28.78 
 
 		 457 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1613  flagellar hook-associated protein FlgK  29.72 
 
 		 637 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000204233  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1969  flagellar hook-associated protein  27.23 
 
 		 539 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>