146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2965 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2965  prophage LambdaSo, HK97 family portal protein  100 
 
 		 432 aa  893    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2594  phage portal protein, HK97 family  93.06 
 
 		 434 aa  842    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.601506  normal  0.257209 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  46.99 
 
 		 431 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  46.55 
 
 		 416 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  46.99 
 
 		 444 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1632  HK97 family phage portal protein  44.69 
 
 		 429 aa  349  5e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4463  phage portal protein, HK97 family  41.58 
 
 		 434 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000679414 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1602  phage portal protein, HK97 family  40.91 
 
 		 434 aa  293  4e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3316  HK97 family phage portal protein  37.08 
 
 		 416 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2069  HK97 family phage portal protein  37.08 
 
 		 416 aa  286  5e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0989  HK97 family phage portal protein  38.35 
 
 		 445 aa  264  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0360  HK97 family phage portal protein  37.47 
 
 		 445 aa  264  3e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1670  Phage portal protein, HK97  38.68 
 
 		 407 aa  255  9e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  36.13 
 
 		 420 aa  236  7e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  35.79 
 
 		 414 aa  231  3e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  35.53 
 
 		 414 aa  228  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  34.64 
 
 		 440 aa  226  4e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  34.62 
 
 		 444 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3396  HK97 family phage portal protein  36.49 
 
 		 445 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0697474  hitchhiker  0.00000000693474 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0647  Phage portal protein, HK97  36.7 
 
 		 434 aa  216  9e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.239357  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  35.4 
 
 		 421 aa  211  2e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0644  HK97 family phage portal protein  33.33 
 
 		 401 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  30.85 
 
 		 413 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000275865 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  30.85 
 
 		 413 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  30.59 
 
 		 413 aa  194  4e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000136411 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5152  HK97 family phage portal protein  33.42 
 
 		 412 aa  193  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1286  HK97 family phage portal protein  33.51 
 
 		 384 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1313  phage portal protein, HK97 family  31.41 
 
 		 425 aa  182  8.000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1697  phage portal protein, HK97 family  31.41 
 
 		 425 aa  182  8.000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2273  phage portal protein, HK97 family  31.41 
 
 		 425 aa  182  8.000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1544  Phage portal protein, HK97  31.64 
 
 		 424 aa  171  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3945  HK97 family phage portal protein  31.44 
 
 		 404 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00231416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0869  HK97 family phage portal protein  33.88 
 
 		 409 aa  171  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1721  HK97 family phage portal protein  31.91 
 
 		 419 aa  171  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  30.45 
 
 		 524 aa  168  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1657  phage portal protein, HK97 family  31.48 
 
 		 408 aa  166  9e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3972  HK97 family phage portal protein  31.59 
 
 		 411 aa  159  7e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1996  phage portal protein, HK97 family  29.17 
 
 		 473 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0463  phage portal protein  28.72 
 
 		 411 aa  152  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.390433 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1336  HK97 family phage portal protein  29 
 
 		 417 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.352989  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1469  HK97 family portal protein  28.25 
 
 		 390 aa  149  8e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2199  HK97 family portal protein , putative  40.38 
 
 		 225 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0014  phage portal protein, HK97 family  27.15 
 
 		 409 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1751  HK97 family phage portal protein  29.05 
 
 		 420 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3879  HK97 family phage portal protein  29.49 
 
 		 423 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49861  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7331  phage portal protein, HK97 family  29.67 
 
 		 428 aa  137  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6184  portal protein  29.26 
 
 		 414 aa  133  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0862  phage portal protein, HK97 family  26.89 
 
 		 389 aa  133  6e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555494  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2595  HK97 family phage portal protein  26.89 
 
 		 436 aa  132  9e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2622  phage portal protein, HK97 family  25.94 
 
 		 417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.830928  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  28.37 
 
 		 404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1624  Phage portal protein, HK97  26.82 
 
 		 428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0210145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3865  HK97 family phage portal protein  28.29 
 
 		 429 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00272242 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1045  head portal protein  28.15 
 
 		 460 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.326172  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1682  phage phi-105 ORF25-like protein  27.12 
 
 		 407 aa  124  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.844077 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4004  phage portal protein, HK97 family  26.29 
 
 		 413 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1617  HK97 family phage portal protein  28.07 
 
 		 426 aa  123  6e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.709388  normal  0.287703 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2492  Phage portal protein, HK97  28 
 
 		 395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4979  hypothetical protein  25.78 
 
 		 436 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5358  hypothetical protein  25.78 
 
 		 436 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1586  HK97 family phage portal protein  25.5 
 
 		 415 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00170734  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3975  phage portal protein, HK97 family  27.78 
 
 		 398 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2502  phage portal protein, HK97 family  27.19 
 
 		 420 aa  114  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.160981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1457  phage portal protein, HK97 family  25.99 
 
 		 417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2600  HK97 family phage portal protein  26.3 
 
 		 408 aa  110  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4251  phage portal protein, HK97 family  26.27 
 
 		 544 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0625  phage portal protein, HK97 family  24.93 
 
 		 413 aa  109  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5463  hypothetical protein  24.43 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5506  phage portal protein, HK97 family  25 
 
 		 408 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.709326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2472  phage portal protein, HK97 family  25.2 
 
 		 542 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2238  phage portal protein, HK97 family  26.76 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0330088  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1968  hypothetical protein  25.63 
 
 		 435 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3805  hypothetical protein  26.49 
 
 		 404 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4093  hypothetical protein  26.49 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1303  phage portal protein, HK97 family  27.54 
 
 		 437 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1648  hypothetical protein  25.07 
 
 		 422 aa  97.8  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.117092  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0555  phage portal protein, HK97 family  24.57 
 
 		 448 aa  97.8  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0158159  hitchhiker  0.0015106 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2245  putative phage portal protein, HK97 family  25 
 
 		 859 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000140812 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2360  head HK97 family portal protein  24.5 
 
 		 397 aa  96.7  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1540  putative phage portal protein, HK97 family  25.48 
 
 		 833 aa  96.7  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.533039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2891  putative phage portal protein, HK97 family  25.48 
 
 		 833 aa  96.7  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000639413 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2997  putative head portal protein  27.51 
 
 		 408 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.429219  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5065  phage portal protein, HK97 family  26.56 
 
 		 455 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2236  HK97 family phage portal protein  26.78 
 
 		 447 aa  94.4  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.759812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0243  HK97 family phage portal protein  25.12 
 
 		 441 aa  92.4  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4078  phage portal protein, HK97 family  26.04 
 
 		 457 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333282  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1898  HK97 family phage portal protein  25.28 
 
 		 416 aa  90.9  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4113  HK97 family phage portal protein  24.6 
 
 		 455 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1060  HK97 family phage portal protein  24.18 
 
 		 412 aa  90.1  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1080  HK97 family phage portal protein  24.18 
 
 		 412 aa  90.1  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0858  phage lambdaBa02, DNA replication protein  24.72 
 
 		 408 aa  89  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2027  phage portal protein  24.19 
 
 		 406 aa  87  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1334  phage portal protein HK97 family  25.53 
 
 		 400 aa  83.6  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00597949  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0339  Phage portal protein, HK97  23.85 
 
 		 407 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0482575  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1717  Phage portal protein, HK97  23.85 
 
 		 406 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0671  HK97 family phage portal protein  22.78 
 
 		 372 aa  81.3  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2959  phage portal protein, HK97 family  22.04 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2611  phage portal protein, HK97 family  23.67 
 
 		 454 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4284  phage portal protein, HK97 family  23.67 
 
 		 454 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4384  phage portal protein, HK97 family  25.29 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>