92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2959 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2959  phage portal protein, HK97 family  100 
 
 
415 aa  836    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4004  phage portal protein, HK97 family  32.31 
 
 
413 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1457  phage portal protein, HK97 family  34.57 
 
 
417 aa  168  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2595  HK97 family phage portal protein  28.83 
 
 
436 aa  151  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0625  phage portal protein, HK97 family  28.86 
 
 
413 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0014  phage portal protein, HK97 family  29.09 
 
 
409 aa  134  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1586  HK97 family phage portal protein  30.38 
 
 
415 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00170734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2622  phage portal protein, HK97 family  25.47 
 
 
417 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.830928  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4251  phage portal protein, HK97 family  25.34 
 
 
544 aa  99.8  7e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  24.65 
 
 
416 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5152  HK97 family phage portal protein  21 
 
 
412 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1996  phage portal protein, HK97 family  23.41 
 
 
473 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5506  phage portal protein, HK97 family  25.59 
 
 
408 aa  87.4  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.709326  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1602  phage portal protein, HK97 family  23.88 
 
 
434 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1336  HK97 family phage portal protein  24.23 
 
 
417 aa  86.7  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.352989  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1670  Phage portal protein, HK97  22.25 
 
 
407 aa  84  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1060  HK97 family phage portal protein  25.36 
 
 
412 aa  83.2  0.000000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1080  HK97 family phage portal protein  25.36 
 
 
412 aa  83.2  0.000000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  21.15 
 
 
444 aa  82.8  0.000000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  22.99 
 
 
440 aa  82  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1648  hypothetical protein  22.65 
 
 
422 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.117092  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0862  phage portal protein, HK97 family  24.44 
 
 
389 aa  81.6  0.00000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555494  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1469  HK97 family portal protein  24.13 
 
 
390 aa  81.3  0.00000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  23.1 
 
 
420 aa  80.9  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2238  phage portal protein, HK97 family  24.37 
 
 
389 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0330088  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2273  phage portal protein, HK97 family  22.56 
 
 
425 aa  78.6  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  23.49 
 
 
421 aa  78.6  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1697  phage portal protein, HK97 family  22.56 
 
 
425 aa  78.6  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4384  phage portal protein, HK97 family  27.73 
 
 
264 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4093  hypothetical protein  24.65 
 
 
389 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1313  phage portal protein, HK97 family  22.56 
 
 
425 aa  78.6  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3805  hypothetical protein  24.65 
 
 
404 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  22.09 
 
 
414 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2965  prophage LambdaSo, HK97 family portal protein  22.04 
 
 
432 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2594  phage portal protein, HK97 family  21.77 
 
 
434 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.601506  normal  0.257209 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  22.09 
 
 
414 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3945  HK97 family phage portal protein  22.12 
 
 
404 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00231416  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0869  HK97 family phage portal protein  22.36 
 
 
409 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  23.14 
 
 
413 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4979  hypothetical protein  25 
 
 
436 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5358  hypothetical protein  25 
 
 
436 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  21.88 
 
 
413 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000275865 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0274  HK97 family phage portal protein  23.44 
 
 
392 aa  74.3  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  20.49 
 
 
444 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1898  HK97 family phage portal protein  20.95 
 
 
416 aa  73.2  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  21.82 
 
 
413 aa  72.8  0.000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000136411 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  20.49 
 
 
431 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1617  HK97 family phage portal protein  22.89 
 
 
426 aa  73.2  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.709388  normal  0.287703 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3972  HK97 family phage portal protein  20.72 
 
 
411 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1485  Phage portal protein, HK97  25.21 
 
 
399 aa  72  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.334021 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2600  HK97 family phage portal protein  21.24 
 
 
408 aa  71.2  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1628  Phage portal protein, HK97  24.36 
 
 
392 aa  70.9  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.220321  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1657  phage portal protein, HK97 family  22.78 
 
 
408 aa  70.5  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1682  phage phi-105 ORF25-like protein  21.11 
 
 
407 aa  70.1  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.844077 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3314  phage portal protein, HK97 family  23.67 
 
 
433 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000016128 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4463  phage portal protein, HK97 family  22.37 
 
 
434 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000679414 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1544  Phage portal protein, HK97  20.94 
 
 
424 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3316  HK97 family phage portal protein  26.64 
 
 
416 aa  68.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1632  HK97 family phage portal protein  23.65 
 
 
429 aa  67.8  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543468  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2069  HK97 family phage portal protein  26.64 
 
 
416 aa  67.8  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7331  phage portal protein, HK97 family  23.05 
 
 
428 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1356  HK97 family phage portal protein  22.49 
 
 
393 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  20.66 
 
 
524 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0858  phage lambdaBa02, DNA replication protein  22.16 
 
 
408 aa  64.3  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1721  HK97 family phage portal protein  22.53 
 
 
419 aa  63.5  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1286  HK97 family phage portal protein  20.39 
 
 
384 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0555  phage portal protein, HK97 family  25 
 
 
448 aa  62  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0158159  hitchhiker  0.0015106 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3396  HK97 family phage portal protein  21.08 
 
 
445 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0697474  hitchhiker  0.00000000693474 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0647  Phage portal protein, HK97  23.91 
 
 
434 aa  59.3  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.239357  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2492  Phage portal protein, HK97  26.06 
 
 
395 aa  58.9  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1968  hypothetical protein  20.36 
 
 
435 aa  58.2  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3879  HK97 family phage portal protein  21.08 
 
 
423 aa  57  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49861  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5463  hypothetical protein  24.07 
 
 
412 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0644  HK97 family phage portal protein  21.83 
 
 
401 aa  55.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0671  HK97 family phage portal protein  25.44 
 
 
372 aa  53.9  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2360  head HK97 family portal protein  21.74 
 
 
397 aa  53.5  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5065  phage portal protein, HK97 family  23.33 
 
 
455 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6184  portal protein  22.04 
 
 
414 aa  52.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4113  HK97 family phage portal protein  22.55 
 
 
455 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4078  phage portal protein, HK97 family  23.33 
 
 
457 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333282  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2891  putative phage portal protein, HK97 family  21.19 
 
 
833 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000639413 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1540  putative phage portal protein, HK97 family  20.84 
 
 
833 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.533039 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1045  head portal protein  23.58 
 
 
460 aa  51.2  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.326172  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2245  putative phage portal protein, HK97 family  21.19 
 
 
859 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000140812 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0243  HK97 family phage portal protein  20.33 
 
 
441 aa  50.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3865  HK97 family phage portal protein  23.67 
 
 
429 aa  49.3  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00272242 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1772  HK97 family phage portal protein  18.31 
 
 
451 aa  49.3  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.468859  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3975  phage portal protein, HK97 family  21.78 
 
 
398 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2502  phage portal protein, HK97 family  20.2 
 
 
420 aa  48.9  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.160981  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  22.34 
 
 
404 aa  46.6  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2472  phage portal protein, HK97 family  20.69 
 
 
542 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0463  phage portal protein  19.24 
 
 
411 aa  44.3  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.390433 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>